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J-GLOBAL ID：200902207719691051   整理番号：08A0359176

複製起点における開放複合体のATP-DnaA依存性形成の共通機構

A Common Mechanism for the ATP-DnaA-dependent Formation of Open Complexes at the Replication Origin

著者 (11件)： OZAKI Shogo (Kyushu Univ., Fukuoka) ,  KAWAKAMI Hironori (Kyushu Univ., Fukuoka) ,  NAKAMURA Kenta (Kyushu Univ., Fukuoka) ,  FUJIKAWA Norie (RIKEN Genomic Sci. Center, Yokohama) ,  KAGAWA Wataru (RIKEN Genomic Sci. Center, Yokohama) ,  PARK Sam-Yong (Yokohama City Univ., Yokohama) ,  YOKOYAMA Shigeyuki (RIKEN Genomic Sci. Center, Yokohama) ,  YOKOYAMA Shigeyuki (Univ. Tokyo, Tokyo) ,  KURUMIZAKA Hitoshi (RIKEN Genomic Sci. Center, Yokohama) ,  KURUMIZAKA Hitoshi (Waseda Univ., Tokyo, JPN) ,  KATAYAMA Tsutomu (Kyushu Univ., Fukuoka)
資料名： Journal of Biological Chemistry  (Journal of Biological Chemistry)
巻： 283  号： 13  ページ： 8351-8362  発行年： 2008年03月28日 
JST資料番号： E0038A  ISSN： 0021-9258  CODEN： JBCHA3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大腸菌のDnaAは複製起点(oriC)とホモ多量体複合体を形成し,ATP-DnaA多量体がoriC巻き戻し要素(DUE)内の二重鎖を巻き戻す。この結晶構造を決め,突然変異実験を組み合わせて機能性アミノ酸残基を決めた。その結果,DnaA多量体の中心孔に露出された数残基がこの巻き戻しに重要だった。特にVal211とArg245が反応開始に必要だった。これらの残基をAla置換してもATP/ADPとDNAに対する親和性に変化はなく,ATP特異的立体配座に対する活性も正常だったが,形成されたoriC複合体はDUE巻き戻しと一本鎖DUEの結合に関して不活性だった。ADP-DnaAや変異DnaAを含むoriC複合体と異なり,ATP-DnaA-oriC複合体は一本鎖DUEの上方鎖に特異的に結合した。この結合には鎖中のTリッチ配列が必要だった。進化的に離れたThermotoga maritimaでも同様にDnaAオルソログの対応し保存された残基が巻き戻しに必要だった。したがって,この構造に関する知見から,孔による起点の巻き戻し,ATP/ADPに依存した調節,開始複合体のヘリカーゼに関する機構が分かると推測された。

シソーラス用語： 大腸菌 ,  *DNA結合タンパク質 ,  *複製起点 ,  結晶構造 ,  立体配座 ,  アミノ酸配列 ,  細菌 ,  DNA【核酸】 ,  六量体 ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド
準シソーラス用語： *DnaA ,  Thermotoga maritima ,  *oriC

分類 (1件)： 遺伝子の複製  (EC02030F)

物質索引 (2件)： ADP ,  ATP

タイトルに関連する用語 (5件)： 複製起点 ,  複合体 ,  ATP ,  DnaA ,  依存性