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J-GLOBAL ID：200902233159283360   整理番号：06A0846556

配列プロファイルを利用したドメインリンカー予測

Domain linker prediction based on position-specific scoring matrix

著者 (4件)： 滝沢雅俊 (早稲田大 大学院理工学研究科) ,  滝沢雅俊 (産業技術総合研 生命情報科学研究セ) ,  山名早人 (早稲田大 大学院理工学研究科) ,  野口保 (産業技術総合研 生命情報科学研究セ)
資料名： 情報処理学会研究報告  (IPSJ SIG Technical Reports)
巻： 2006  号： 99(BIO-6)  ページ： 41-47  発行年： 2006年09月15日 
JST資料番号： Z0031B  ISSN： 0919-6072  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： ドメインリンカー予測は,タンパク質の立体構造を迅速に決定する...

シソーラス用語： *立体配座 ,...
準シソーラス用語： *バイオインフォマティックス ,...

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分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  人工知能  (JE08000Z)

引用文献 (11件)：

• MIYAZAKI, S. Characterization and prediction of linker sequences of multi-domain proteins by a neural network. J. Struct. Funct. Genomics. 2002, 2, 37-51
• SUYAMA, M. DomCut : prediction of inter-domain linker regions in amino acid sequences. Bioinformatics. 2003, 19, 673-674
• KABSCH, W. Dictionary of protein secondary structure : pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features. Biopolymers. 1983, 22, 2577-2637
• TANAKA, T. Improvement of domain linker prediction by incorporating loop length-dependent characteristics. Biopolymers. 2005, 84, 161-168
• DONG, Q. Domain boundary prediction based on profile domain linker propensity index. Comp. Biol. Chem. 2006, 30, 127-133

タイトルに関連する用語 (4件)： プロファイル ,  ドメイン ,  リンカー ,  予測