特許

J-GLOBAL ID：201103016046073425

RNA干渉ポリヌクレオチド混合物の設計装置、RNA干渉ポリヌクレオチド混合物の作製方法、及びRNA干渉ポリヌクレオチド混合物の設計プログラム

発明者： 武部 豊 ,  内藤 雄樹 ,  西郷 薫 ,  名取 幸和
出願人/特許権者： 国立感染症研究所長 ,  国立大学法人 東京大学 ,  株式会社アルファジェン
代理人 (2件)： 恩田 博宣 ,  恩田 誠
公報種別：特許公報
出願番号（国際出願番号）：特願2005-055064
公開番号（公開出願番号）：特開2006-238724
特許番号：特許第4641199号
出願日： 2005年02月28日
公開日（公表日）： 2006年09月14日
請求項（抜粋）：

【請求項1】 病原性微生物のゲノム又は転写産物もしくは特定のタンパクをコードする配列に含まれる標的サイトに対してRNA干渉を生じさせるRNA干渉ポリヌクレオチドを複数種類含むRNA干渉ポリヌクレオチド混合物の設計方法に基づき、当該設計方法によって取得されるRNA干渉ポリヌクレオチド混合物の組成にしたがってRNA干渉ポリヌクレオチドを混合するRNA干渉ポリヌクレオチド混合物の作製方法であって、 前記RNA干渉ポリヌクレオチド混合物の設計方法は、 前記病原性微生物のゲノムを構成する塩基配列又は転写産物もしくは特定のタンパクをコードする配列についての病原性微生物塩基配列情報を複数取得する病原性微生物塩基配列情報取得工程と、 取得した前記病原性微生物塩基配列情報に基づいて、所定のガイドラインに従って前記病原性微生物の前記標的サイトを特定し、当該標的サイトの塩基配列情報を複数取得する標的サイト情報取得工程と、 取得した前記標的サイトの複数の塩基配列情報に基づいて、前記所定のガイドラインに従って設計し前記標的サイトに対してRNA干渉を生じさせるRNA干渉ポリヌクレオチドの塩基配列情報を複数取得するRNA干渉ポリヌクレオチド情報取得工程と、 取得した前記複数のRNA干渉ポリヌクレオチドの塩基配列情報から、前記病原性微生物のゲノム多様性および変異の発生に対応可能なRNA干渉ポリヌクレオチドの組み合わせを選択して、より好ましい組み合わせ情報を取得する組み合わせ選択工程と、を含み、 前記組み合わせ選択工程は、 RNA干渉ポリヌクレオチドの組み合わせが、前記病原性微生物塩基配列情報取得工程で取得した複数の前記病原性微生物塩基配列情報のうちのいくつの前記病原性微生物塩基配列情報と一致するかに関する網羅性と、 前記RNA干渉ポリヌクレオチドの組み合わせのうち、前記病原性微生物塩基配列情報のうちの一の情報に対し、前記RNA干渉ポリヌクレオチドの塩基配列情報と一致する前記病原性微生物塩基配列情報が幾つあるかに関する重複性と、に基づいて、前記RNA干渉ポリヌクレオチドの組み合わせを選択することを特徴とするRNA干渉ポリヌクレオチド混合物の作製方法。

IPC (2件)：

C12N 15/09 ( 200 6.01) ,  G06F 19/00 ( 201 1.01)

FI (2件)：

C12N 15/00 ZNA A ,  G06F 19/00 600

引用文献：

出願人引用 (3件)

• 実験医学, 2005.02.15, Vol.23, No.4(増刊), 107-111
• 日本分子生物学会年会 プログラム・講演要旨集, 2004, Vol.27, p.487
• 蛋白質 核酸 酵素, 2004, Vol.49, No.17, p.2662-2670

審査官引用 (3件)

• 実験医学, 2005.02.15, Vol.23, No.4(増刊), 107-111
• 日本分子生物学会年会 プログラム・講演要旨集, 2004, Vol.27, p.487
• 蛋白質 核酸 酵素, 2004, Vol.49, No.17, p.2662-2670