研究者
J-GLOBAL ID：200901083788745339   更新日: 2024年11月13日

坊農 秀雅

ボウノウ ヒデマサ | BONO HIDEMASA
所属機関・部署：
広島大学 大学院統合生命科学研究科

広島大学 大学院統合生命科学研究科 について


職名： 教授
ホームページURL (1件)： https://bonohu.hiroshima-u.ac.jp/
研究分野 (5件)： 腫瘍生物学 ,  分子生物学 ,  システムゲノム科学 ,  昆虫科学 ,  ゲノム生物学
研究キーワード (21件)： バイオDX ,  公共データベース ,  トランスクリプトーム解析 ,  ゲノム編集 ,  メタ解析 ,  オープンデータ ,  酸素生物学 ,  オープンアクセス ,  アノテーション ,  酸化ストレス ,  パーキンソン病 ,  がん ,  オープンソースソフトウェア ,  データベース ,  トランスクリプトーム ,  低酸素 ,  配列解析 ,  機能アノテーション ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム ,  遺伝子発現解析
競争的資金等の研究課題 (22件)：
  • 2024 - 2027 ハダカデバネズミの「健康長寿」システムを構成する分子基盤の解明
  • 2022 - 2027 新規脳内小タンパク質NPGLによる生活習慣病発症防止メカニズムの解明
  • 2021 - 2023 データ駆動型ゲノム育種を実現するデータ解析基盤技術の開発
  • 2020 - 2023 酸素ホメオスターシス制御を切り口とした麻酔に伴う免疫応答変容の分子基盤解明
  • 2021 - 2023 最長寿・がん化耐性ハダカデバネズミにおける生体内発がん抑制機構の解明
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論文 (154件)：
  • Takayuki Suzuki, Hidemasa Bono. Pipeline to explore information on genome editing using large language models and genome editing meta-database. bioRxiv. 2024. 2024.10.16.617154
  • Ryo Nozu, Mitsutaka Kadota, Masaru Nakamura, Shigehiro Kuraku, Hidemasa Bono. Meta-analysis of gonadal transcriptome provides novel insights into sex change mechanism across protogynous fishes. Genes to Cells. 2024. gtc.13166
  • Kouhei Toga, Fumiko Kimoto, Hiroki Fujii, Hidemasa Bono. Genome-wide Search for Gene Mutations likely Conferring Insecticide Resistance in the Common Bed Bug, Cimex lectularius. Insects. 2024. 15. 737
  • Keita Tamura, Hirokazu Chiba, Hidemasa Bono. Triterpene RDF: Developing a database of plant enzymes and transcription factors involved in triterpene biosynthesis using the Resource Description Framework. Plant BIotechnology. 2024. 41. 303-308
  • Takayuki Suzuki, Hidemasa Bono. A systematic exploration of unexploited genes for oxidative stress in Parkinson's disease. npj Parkinson's disease. 2024. 10. 160
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MISC (64件)：
  • 奥原 啓輔, 横井 翔, 中村 保一, 坊農 秀雅. バイオDX産学共創拠点におけるデータベース基盤技術開発. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 藤岡周助, 藤岡周助, 岡香織, 河村佳見, 河村佳見, 菰原義弘, 中條岳志, 山村祐紀, 大岩祐基, 須藤洋一, et al. ハダカデバネズミの炎症応答の減弱は発がん耐性に寄与している. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2021. 141st. 29V08-am11S
  • Hiromasa Ono, Hidemasa Bono. RefEx: Dataset for Reference Gene Expression. Practical Guide to Life Science Databases. 2021. in press-133
  • 坊農秀雅. 注目を集める生命科学データ解析. 電脳会議. 2019. 193. 7-7
  • 小野浩雅, 坊農秀雅. 遺伝子発現解析の基準となるデータを快適に検索できるウェブツール「RefEx」. 実験医学. 2018. 36. 6. 999-1003
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書籍 (35件)：
  • 論文に出る遺伝子 デルジーン300
    羊土社 2024 ISBN:9784758122771
  • Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今 -
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2024 ISBN:4815731209
  • 生命科学研究のためのデジタルツール入門 第2版
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2024 ISBN:4815731063
  • 生命科学者のためのDr.Bonoデータ解析道場 第2版
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2023 ISBN:9784815730888
  • 改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ
    羊土社 2023 ISBN:9784758122672
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講演・口頭発表等 (179件)：
  • Meta-Analysis of Public RNA-Seq Data reveals Novel Drought and Salt Stress-Responsive Genes in Oryza sativa and Corresponding Genes in Arabidopsis thaliana
    (Plant and Animal Genome Conference / PAG 32 2025)
  • Exploration of Novel Heat Stress-Responsive Genes Using Public Database Resources and Structural Similarity Search
    (Plant and Animal Genome Conference / PAG 32 2025)
  • A Pathway Analysis Environment for Non-Model Organisms: Development and Application of Qpx
    (Plant and Animal Genome Conference / PAG 32 2025)
  • バイオDXによるデータベース駆動型生命科学研究
    (第320回 月例薬学セミナー 2024)
  • A Quarter Century of Functional Annotation
    (RIKEN IMS Seminar 2024)
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Works (8件)：
  • AOE (All of gene expression)
    坊農秀雅 2014 -
  • CRISPRdirect
    内藤雄樹, 日野公洋, 坊農秀雅, 程久美子 2014 -
  • RefEx (Reference Expression dataset)
    小野浩雅, 坊農秀雅 2011 -
  • GGRNA
    内藤雄樹, 坊農秀雅 2011 -
  • DBCLS SRA
    仲里猛留, 大田達郎, 坊農秀雅 2011 -
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学歴 (4件)：
  • 1997 - 2000 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻 生物物理学系 博士後期課程
  • 1995 - 1997 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻 生物物理学系 修士課程
  • 1993 - 1995 東京大学 教養学部 基礎科学科第一
  • 1991 - 1993 東京大学 理科二類
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (9件)：
  • 2023/10 - 現在 広島大学 大学院統合生命科学研究科 教授
  • 2020/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター
  • 2020/04 - 2023/09 広島大学 大学院統合生命科学研究科 特任教授
  • 2007/07 - 2020/03 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授
  • 2007/04 - 2007/06 埼玉医科大学 ゲノム医学研究センター 准教授
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委員歴 (6件)：
  • 2023/03 - 2024/01 IJMS Guest Editor
  • 2022/02 - 2023/01 Insects Guest Editor
  • 2022/06 - ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)情報運営委員会委員
  • 2016/04 - 2018/03 SPARC Japan セミナー企画ワーキンググループメンバー
  • 2008 - 2017/09 BMC Genomics Associate Editor
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所属学会 (3件)：
日本ゲノム編集学会 ,  日本癌学会 ,  日本分子生物学会
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