研究者
J-GLOBAL ID：200901083788745339   更新日: 2024年04月21日

坊農 秀雅

ボウノウ ヒデマサ | BONO HIDEMASA
所属機関・部署：
広島大学 大学院統合生命科学研究科

広島大学 大学院統合生命科学研究科 について


職名： 教授
ホームページURL (1件)： https://bonohu.hiroshima-u.ac.jp/
研究分野 (5件)： 腫瘍生物学 ,  分子生物学 ,  システムゲノム科学 ,  昆虫科学 ,  ゲノム生物学
研究キーワード (21件)： バイオDX ,  公共データベース ,  トランスクリプトーム解析 ,  ゲノム編集 ,  メタ解析 ,  オープンデータ ,  酸素生物学 ,  オープンアクセス ,  アノテーション ,  酸化ストレス ,  パーキンソン病 ,  がん ,  オープンソースソフトウェア ,  データベース ,  トランスクリプトーム ,  低酸素 ,  配列解析 ,  機能アノテーション ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム ,  遺伝子発現解析
競争的資金等の研究課題 (21件)：
  • 2022 - 2027 新規脳内小タンパク質NPGLによる生活習慣病発症防止メカニズムの解明
  • 2021 - 2023 データ駆動型ゲノム育種を実現するデータ解析基盤技術の開発
  • 2020 - 2023 酸素ホメオスターシス制御を切り口とした麻酔に伴う免疫応答変容の分子基盤解明
  • 2021 - 2023 最長寿・がん化耐性ハダカデバネズミにおける生体内発がん抑制機構の解明
  • 2021 - 2022 広島から世界最先端のバイオエコノミー社会を実現する Bio x Digital Transformation(バイオDX)産学共創拠点
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論文 (145件)：
  • Kazuki Nakamae, Saya Ide, Nagaki Ohnuki, Yoshiko Nakagawa, Keisuke Okuhara, Hidemasa Bono. PtWAVE: A High-Sensitive deconvolution software of sequencing trace for the Detection of Large Indels in Genome Editing. bioRxiv. 2024
  • Mitsuo Shintani, Keita Tamura, Hidemasa Bono. Meta-Analysis of Public RNA Sequencing Data of Abscisic Acid-Related Abiotic Stresses in Arabidopsis thaliana. Frontiers in Plant Science. 2024. 15. 1343787
  • Takayuki Suzuki, Hidemasa Bono. A systematic exploration of unexploited genes for oxidative stress in Parkinson's disease. bioRxiv. 2024. 2024.03.11.583425
  • Yudai Masuoka, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Hiromasa Ono, Hirokazu Chiba, Hideki Sezutsu, Hidemasa Bono, Kakeru Yokoi. Time-course transcriptome data of silk glands in day 0-7 last-instar larvae of Bombyx mori (w1 pnd strain). bioRxiv. 2024. 2024.03.02.582034
  • Mitsuo Shintani, Keita Tamura, Hidemasa Bono. Meta-analysis of public RNA sequencing data of abscisic acid-related abiotic stresses in Arabidopsis thaliana. Frontiers in Plant Science. 2024. 15. fpls.2024.1343787
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MISC (62件)：
  • 奥原 啓輔, 横井 翔, 中村 保一, 坊農 秀雅. バイオDX産学共創拠点におけるデータベース基盤技術開発. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 藤岡周助, 藤岡周助, 岡香織, 河村佳見, 河村佳見, 菰原義弘, 中條岳志, 山村祐紀, 大岩祐基, 須藤洋一, et al. ハダカデバネズミの炎症応答の減弱は発がん耐性に寄与している. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2021. 141st. 29V08-am11S
  • Hiromasa Ono, Hidemasa Bono. RefEx: Dataset for Reference Gene Expression. Practical Guide to Life Science Databases. 2021. in press-133
  • 坊農秀雅. 注目を集める生命科学データ解析. 電脳会議. 2019. 193. 7-7
  • 小野浩雅, 坊農秀雅. 遺伝子発現解析の基準となるデータを快適に検索できるウェブツール「RefEx」. 実験医学. 2018. 36. 6. 999-1003
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書籍 (32件)：
  • 生命科学者のためのDr.Bonoデータ解析道場 第2版
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2023 ISBN:9784815730888
  • 改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ
    羊土社 2023 ISBN:9784758122672
  • PacBio HiFiリードによるアカシソゲノム配列解読の実際
    羊土社 2023 ISBN:9784758125574
  • がんゲノムデータ解析
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2022 ISBN:9784815730529
  • Practical Guide to Life Science Databases
    Springer-Nature 2022 ISBN:9811658110
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講演・口頭発表等 (144件)：
  • PacBio HiFiリードシーケンスによるキンウワバトビコバチのゲノム解読と機能アノテーション
    (日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会 2024)
  • 遺伝子機能アノテーションワークフローFanflow4Insects
    (日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会 2024)
  • 昆虫のDNA配列データ解析を始めよう
    (日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会 2024)
  • ダイズにおいてソヤサポニン生合成を制御するbHLH 型転写因子の機能解析
    (第65回日本植物生理学会年会 2024)
  • ロングリードシークエンサーによる植物ゲノム解析とそのデータ駆動型ゲノム育種への応用
    (第65回日本植物生理学会年会 2024)
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Works (8件)：
  • AOE (All of gene expression)
    坊農秀雅 2014 -
  • CRISPRdirect
    内藤雄樹, 日野公洋, 坊農秀雅, 程久美子 2014 -
  • RefEx (Reference Expression dataset)
    小野浩雅, 坊農秀雅 2011 -
  • GGRNA
    内藤雄樹, 坊農秀雅 2011 -
  • DBCLS SRA
    仲里猛留, 大田達郎, 坊農秀雅 2011 -
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学歴 (4件)：
  • 1997 - 2000 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻 生物物理学系 博士後期課程
  • 1995 - 1997 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻 生物物理学系 修士課程
  • 1993 - 1995 東京大学 教養学部 基礎科学科第一
  • 1991 - 1993 東京大学 理科二類
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (9件)：
  • 2023/10 - 現在 広島大学 大学院統合生命科学研究科 教授
  • 2020/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター
  • 2020/04 - 2023/09 広島大学 大学院統合生命科学研究科 特任教授
  • 2007/07 - 2020/03 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授
  • 2007/04 - 2007/06 埼玉医科大学 ゲノム医学研究センター 准教授
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委員歴 (6件)：
  • 2023/03 - IJMS Guest Editor
  • 2022/02 - 2023/01 Insects Guest Editor
  • 2022/06 - ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)情報運営委員会委員
  • 2016/04 - 2018/03 SPARC Japan セミナー企画ワーキンググループメンバー
  • 2008 - 2017/09 BMC Genomics Associate Editor
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所属学会 (3件)：
日本ゲノム編集学会 ,  日本癌学会 ,  日本分子生物学会
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