市原寿子

イチハラヒサコ | Ichihara Hisako

所属機関・部署：
職名：特任助教(常勤)

研究分野 (1件)：進化生物学

研究キーワード (7件)：情報学 , 配列解析 , 分子進化学 , バイオインフォマティクス , Protein Engineering , Molecular Evolution , Biological Science

競争的資金等の研究課題 (8件)：

2022 - 2025 セマンティックウェブ技術を用いた植物の系統・生育環境・表現型のデータベース
2019 - 2022 セマンティックウェブ技術を用いた遺伝素材の交配・解析系統の選定を支援するシステム
2009 - 2011 ヒト赤血球microRNAによるマラリア感染機構の調節
2007 - 2009 情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発
2005 - 2007 情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発

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論文 (10件)：

平川英樹, 中谷明弘, 市原寿子, 柴谷多恵子, 浅水恵理香, 白澤沙知子, 中村保一, 磯部祥子, 田畑哲之. 植物ゲノム統合データベースPGDBjの構築. トーゴーの日2017. 2017. 1
Akihiro Nakaya, Hisako Ichihara, Erika Asamizu, Sachiko Shirasawa, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Hideki Hirakawa. Plant Genome DataBase Japan (PGDBj). Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2017. 1533. 45-77
Erika Asamizu, Hisako Ichihara, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Hideki Hirakawa, Takahiro Ishii, Takuro Tamura, Kaoru Fukami-Kobayashi, Yukari Nakajima, Satoshi Tabata. Plant Genome DataBase Japan (PGDBj): a portal website for the integration of plant genome-related databases. Plant & cell physiology. 2014. 55. 1. e8-e8(7)
Kengo Okada, Hisako Ichihara, Hiroyuki Takahashi, Nobuyuki Fujita, Akira Ishihama, Toshio Hakoshima. Preparation and preliminary X-ray diffraction analysis of crystals of bacterial flagellar sigma factor sigma(28) in complex with the sigma(28)-binding region of its antisigma factor, FlgM. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS. 2007. 63. 196-199
Toshio Hakoshima, Hisako Ichihara. Structure of SixA, a histidine protein phosphatase of the ArcB histidine-containing phosphotransfer domain in Escherichia coli. TWO-COMPONENT SIGNALING SYSTEMS, PT A. 2007. 422. 288-+

MISC (38件)：

市原寿子, 山田学, 戸田陽介, 中谷明弘, 山下サマッチャヤー, 清水武彦, 白澤沙知子, 小原光代, 平川英樹, 中村保一, et al. 植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2023年度・第4四半期版)-進化情報を活用するためのツールの開発-. 育種学研究. 2024. 26
市原寿子, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 山田学, 清水武彦, 白澤沙知子, 戸田陽介, 平川英樹, 中村保一, 中村保一, et al. 植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2023年度・第2四半期版). 育種学研究. 2023. 25
市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 清水武彦, 中村保一, 中村保一, et al. 植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2022年度・第4四半期版). 育種学研究. 2023. 25
市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 中村保一, 七夕高也, 田畑哲之, et al. 植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2022年度・第2四半期版). トーゴーの日2022. 2022. 1
磯部祥子, 市原寿子, 山田学, 中村保一, 中村保一, 戸田陽介, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 七夕高也, 平川英樹, et al. Plant GARDENからMi-GARDENへ~公開ゲノム情報とユーザーデータをつなぐ~. 日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM). 2022. 86th

書籍 (4件)：

実験医学増刊今日から使える!データベース・ウェブツール達人になるための実践ガイド100 内藤雄樹/編
羊土社 2014 ISBN:9784758103435
Prostaglandin D Synthase - A Multitude of Biological Functions. Ragolia L(ed)
Research Signpost 2007
バイオインフォマティクス事典日本バイオインフォマティクス学会/編
共立出版 2006
実験医学別冊注目のプロテオミクスの全貌を知る -最新手法とその応用成果- 磯辺俊明・高橋信弘/編
羊土社 2002

講演・口頭発表等 (6件)：

植物統合データベースPGDBJ(Plant Genome DataBase Japan)の構築
(園芸学会平成28年度春季大会小集会 2016)
Plant Genome DataBase Japan(PGDBj)-植物統合DB 2013年度版の紹介-
(第55回日本植物生理学会大会シンポジウム「データベース講習会」 2014)
ゲノム情報に基づく植物データベースの統合
(第31回日本植物細胞分子生物学会(札幌)大会シンポジウム「バイオインフォマティクス講習会」 2013)
統合化推進プログラム-ゲノム情報に基づく植物データベースの統合-
(第54回日本植物生理学会大会シンポジウム「データベース講習会」 2013)
ゲノムを護るタンパク質のバイオインフォマティクス
(福岡歯科大学学術フロンティア研究シンポジウム 2007)

学歴 (2件)：

- 2000 奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科分子生物学専攻
- 2000 奈良先端科学技術大学院大学

学位 (1件)：

博士(システム生命科学) (九州大学)

経歴 (16件)：

2023/04 - 現在公益財団法人かずさDNA研究所シーズ開拓研究室生物情報解析システム開発チーム特任研究員
2020/04 - 2022/03 公益財団法人かずさDNA研究所植物遺伝学研究室特任研究員
2017/04 - 2020/03 大阪大学医学系研究科ゲノム情報学共同研究講座特任助教(常勤)
2012/04 - 2017/03 公益財団法人かずさDNA研究所技術開発研究部ゲノム情報解析グループ JST統合化推進プログラムプロジェクト研究員
2011/04 - 2012/03 立教大学理学部生命理学科兼任講師

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所属学会 (5件)：

日本育種学会 , 園芸学会 , 日本分子生物学会 , Japan Society for Cell Biology , The Molecular Biology Society of Japan

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