動物の転写開始部位と関連する小さなRNA

TAFT Ryan J; GLAZOV Evgeny A; CLOONAN Nicole; SIMONS Cas; STEPHEN Stuart; FAULKNER Geoffrey J; LASSMANN Timo; FORREST Alistair R R; FORREST Alistair R R; GRIMMOND Sean M; SCHRODER Kate; IRVINE Katharine; ARAKAWA Takahiro; NAKAMURA Mari; KUBOSAKI Atsutaka; HAYASHIDA Kengo; KAWAZU Chika; MURATA Mitsuyoshi; NISHIYORI Hiromi; FUKUDA Shiro; KAWAI Jun; DAUB Carsten O; HUME David A; HUME David A; SUZUKI Harukazu; ORLANDO Valerio; ORLANDO Valerio; CARNINCI Piero; HAYASHIZAKI Yoshihide; MATTICK John S

文献

J-GLOBAL ID：200902282449202195 整理番号：09A0456088

動物の転写開始部位と関連する小さなRNA

Tiny RNAs associated with transcription start sites in animals

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資料名：
巻： 41 号： 5 ページ： 572-578 発行年： 2009年05月
JST資料番号： W0430A ISSN： 1061-4036 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

いろいろなサイズの比較的短いRNAが,真核生物のプロモーター近傍の配列から転写されているといわれてきた。FANTOM4プロジェクトと共同で,ヒト,トリ,ショウジョウバエの転写開始点(TSS)から-60~+120塩基にマッピングされる,主として18塩基の長さからなる小さなRNAを同定した。これらの転写開始RNA(transcription initiation RNA:tiRNA)はTSSと同じ鎖に由来しており,G+Cに富んだプロモーターによくみられた。tiRNAの5′端は,TSSの下流10~30塩基のところにピークがあり,これらがプロセシングを受けていることを示している。tiRNAは,例外はあるが,一般的に発現の高い転写産物およびRNAポリメラーゼII結合部位と関係している。我々は,tiRNAが後生動物および,おそらくはすべての真核生物の転写において一般的にみられる特徴であると考えている。Copyright Nature Publishing Group 2009

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遺伝子発現

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