Kawano Shin

カワノシン | Kawano Shin

Affiliation and department：
Job title： Professor
Other affiliations (1)：

Joint Support-Center for Data Science Research Database Center for Life Science Visiting Professor

Research field (7)： Systems genomics , Biological, health, and medical informatics , Molecular biology , Functional biochemistry , Web and service informatics , Library/information science, humanistic/social informatics , Polymer chemistry

Research keywords (3)： Proteomics , バイオインフォマティクス , Computational Social Science

Research theme for competitive and other funds (7)：

2023 - 2028 jPOST prime:コミュニティ連携を基盤とするプロテオームデータベース環境の実現
2020 - 2023 質量分析によるアミノ酸配列de novo決定のための新規手法開発
2018 - 2023 プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化
2016 - 2019 パーソナルゲノム時代におけるRNA-seqを活用したプロテオミクス解析手法の確立
2015 - 2017 プロテオーム統合データベースの構築

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Papers (42)：

Shujiro Okuda, Akiyasu C Yoshizawa, Daiki Kobayashi, Yushi Takahashi, Yu Watanabe, Yuki Moriya, Atsushi Hatano, Tomoyo Takami, Masaki Matsumoto, Norie Araki, et al. jPOST environment accelerates the reuse and reanalysis of public proteome mass spectrometry data. Nucleic Acids Research. 2024
Shin Kawano. Sharing and Standardization of Proteomics Data. Proteome Letters. 2023. 8. 1. 1-11
Eric W. Deutsch, Juan Antonio Vizcaíno, Andrew R. Jones, Pierre-Alain Binz, Henry Lam, Joshua Klein, Wout Bittremieux, Yasset Perez-Riverol, David L. Tabb, Mathias Walzer, et al. Proteomics Standards Initiative at Twenty Years: Current Activities and Future Work. Journal of Proteome Research. 2023. 22. 2. 287-301
Eric W Deutsch, Nuno Bandeira, Yasset Perez-Riverol, Vagisha Sharma, Jeremy J Carver, Luis Mendoza, Deepti J Kundu, Shengbo Wang, Chakradhar Bandla, Selvakumar Kamatchinathan, et al. The ProteomeXchange consortium at 10 years: 2023 update. Nucleic Acids Research. 2022
Richard D. LeDuc, Eric W. Deutsch, Pierre-Alain Binz, Ryan T. Fellers, Anthony J. Cesnik, Joshua A. Klein, Tim Van Den Bossche, Ralf Gabriels, Arshika Yalavarthi, Yasset Perez-Riverol, et al. Proteomics Standards Initiative’s ProForma 2.0: Unifying the Encoding of Proteoforms and Peptidoforms. Journal of Proteome Research. 2022. 21. 4. 1189-1195

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MISC (79)：

高橋悠志, 吉沢明康, 小林大樹, 守屋勇樹, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 荒木令江, 田畑剛, 田畑剛, et al. Accelerating data re-analysis in jPOST using metadata from JPDM data papers. 日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集. 2024. 2024 (Web)
守屋勇樹, 田畑剛, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 瀧川一学, 吉沢明康. 深層学習に基づくペプチド由来イオンピークの新規検出手法. 質量分析総合討論会講演要旨集. 2019. 67th. 166
守屋勇樹, 田畑剛, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 瀧川一学, et al. 深層学習を用いたペプチド由来質量分析イオンピークの検出法の開発. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2019. 42nd
Satoshi Tanaka, Masaki Murase, Tsuyoshi Takahashi, Masaki Kato, Maiko Kusano, Shin Kawano, Akiyasu C. Yoshizawa, Susumu Goto, Yasushi Ishihama. Mass++ ver.4: an open-source, quick and simple data viewer. American Society for Mass Spectrometry Annual Conference. 2018. 66th
五斗進, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, et al. jPOSTプロジェクトが提供するプロテオミクスデータとその解析ツール. 第41回日本分子生物学会. 2018. 41st

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Books (8)：

生命科学データベース・ウェブツール図解と動画で使い方がわかる! 研究がはかどる定番18選
メディカルサイエンスインターナショナル 2018 ISBN:4815701431
A Practical Guide to Using Glycomics Databases
Springer 2017 ISBN:4431564527
実験医学増刊 Vol.32 No.20 今日から使える! データベース・ウェブツール達人になるための実践ガイド100
羊土社 2014 ISBN:4758103437
マイクロアレイデータ統計解析プロトコール-Excelを中心としたデータの標準化から有意差解析、クラスタリング、ネットワーク解析法のすべて (実験医学別冊 23)
羊土社 2008 ISBN:4758101736
改訂第2版バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 - 遺伝子の配列・機能解析、タンパク質解析、プロテオミクス、文献検索、検索エンジン...etc.真に役立つサイトを使い倒す!
羊土社 2007 ISBN:4758108110

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Education (2)：

1998 - 2003 Hokkaido University Graduate School of Engineering Division of Molecular Chemistry
1994 - 1998 Hokkaido University Faculty of Engineering Department of Applied Chemistry

Professional career (2)：

Master of Engineering (Hokkaido University)
PhD. (Engineering) (Hokkaido University)

Work history (17)：

2023/04 - 現在 Kitasato University School of Frontier Engineering Professor
2022/04 - 現在 Joint Support-Center for Data Science Research Database Center for Life Science Visiting Professor
2022/10 - 2023/03 Kitasato University
2022/04 - 2023/03 Toyama University of International Studies Faculty of Contemporary Society Professor
2019/04 - 2022/03 Toyama University of International Studies Faculty of Contemporary Society Associate Professor

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Committee career (2)：

2023/01 - 現在 Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Council Member
2018/01 - 現在日本プロテオーム学会理事

Awards (1)：

2003 - ESF-JSPS Frontier Science Meetings for Young Researchers BEST POSTER AWARD JSPS

Association Membership(s) (11)：

人工知能学会 , 情報処理学会 , Research Data Alliance , Global Alliance for Genomics and Health , Human Proteome Organization , JAPAN ASSOCIATION FOR MEDICAL INFORMATICS , Japan Human Proteome Organization , 日本糖質学会 , 日本分子生物学会 , Japanese Society for Bioinformatics , The Cellulose Society of Japan

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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