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J-GLOBAL ID:201601001045274446
Update date: Apr. 08, 2024
Yokoi Kakeru
Yokoi Kakeru
Affiliation and department:
Research field (2):
Biological, health, and medical informatics
, Entomology
Research keywords (3):
昆虫ゲノム科学
, バイオインフォマティクス
, 昆虫分子生物学
Research theme for competitive and other funds (31):
- 2022 - 2032 Bio-Digital Transformation (バイオDX)産学共創拠点
- 2024 - 2029 国内養蜂家を対象としたローヤルゼリー多収系統の造成に関する量的・分子遺伝学的研究
- 2023 - 2027 複合材としての昆虫外骨格:外骨格硬化を担う二つの化学反応とその応用・進化
- 2022 - 2027 昆虫(カイコ)テクノロ ジーを活用したグリーン バイオ産業の創出プロジ ェクト
- 2022 - 2025 コガネムシの構造色の多様性を作り出す分子機構、ゲノム進化機構および適応的意義
- 2022 - 2025 ハチ目昆虫の半数体オスにおける減数分裂を回避した精子形成の分子機構解明
- 2023 - 2024 昆虫における次世代シーケンスデータ解析および公共データベース利用 II
- 2023 - 2024 カイコにおけるシルクタンパク質発現量調節に関わる新規遺伝子の同定のためのリファレンス遺伝子発現データセットの取得およびオーソログ推定
- 2023 - 2024 セイヨウミツバチの女王蜂としてのアイデンティティーを決める因子の探索
- 2021 - 2024 シルクの構造・物性の多様性を担う分子基盤の解明
- 2023 - 2024 輸入蜜蜂のダニ抵抗性の性能評価法の確立
- 2023 - 地球規模の食料問題の解決と人類の宇宙進出に向けた昆虫が支える循環型食料生産システムの開発
- 2022 - 2023 セイヨウミツバチのデータ駆動型研究に資するリファレンス遺伝子発現データセットの作成
- 2022 - 2023 昆虫における次世代シーケンスデータ解析および公共データベース利用
- 2022 - 2023 カイコにおけるシルクタンパク質発現量調節に関わる新規遺伝子の同定のためのリファレンス遺伝子発現データセットの取得およびオーソログ推定
- 2021 - 2023 遺伝子ネットワーク構築による非モデル生物におけるデータ解析アプローチの構築
- 2021 - 2023 産学連携拠点データ利活用促進費
- 2020 - 2023 AIを用いた先端バイオ技術応用食品・農作物に対する消費者意識に影響する要因の探索(辞退)
- 2017 - 2022 蚕業革命による新産業創出プロジェクト
- 2020 - 2021 昆虫におけるNGSおよびゲ ノムデータベース利用による データ解析
- 2018 - 2021 昆虫(カイコ等)による有用タンパク質・新高機能素材の製造技術の開発・実用化
- 2019 - 2020 ミツバチのゲノム育種に向けた公共データベース中の転移因子のアノテーションと比較ゲノム解析
- 2019 - 2020 昆虫のゲノムデータベースとそれを活用したデータ解析 III
- 2015 - 2020 生物遺伝資源と分子遺伝学を利用した養蚕研究基盤構築
- 2018 - 2019 ミツバチのゲノム育種に向けた公共データベース中の転移因子のアノテーションと比較ゲノム解析
- 2018 - 2019 昆虫のゲノムデータベースとそれを活用したデータ解析II
- 2014 - 2019 ゲノム情報を活用した農畜産物の次世代生産基盤技術の開発プロジェクト・ゲノム情報等を活用した薬剤抵抗性管理技術の開発
- 2017 - 2018 薬剤抵抗性診断用マーカーの迅速な同定を実現するためのトビイロウンカのゲノム情報の充実とセジロウンカのゲノムの新規解読
- 2017 - 2018 昆虫のゲノムデータベースとそれを活用したデータ解析
- 2016 - 2017 カメムシ目害虫の免疫シグナリングをモニタリングできる培養細胞系の開発
- 2016 - 2017 重要害虫の殺虫剤抵抗性発達の分子メカニズムの解析
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Papers (34):
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Yudai Masuoka, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Hirokazu Chiba, Hiromasa Ono, Hideki Sezutsu, Hidemasa Bono, Kakeru Yokoi. Time-course transcriptome data of silk glands in day 0-7 last-instar larvae of Bombyx mori (w1 pnd strain). BioRxiv. 2024
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Ryusei Waizumi, Chikara Hirayama, Shuichiro Tomita, Tetsuya Iizuka, Seigo Kuwazaki, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Kakeru Yokoi, Kimiko Yamamoto, Hideki Sezutsu. A major endogenous glycoside hydrolase mediating quercetin uptake in Bombyx mori. PLOS Genetics. 2024. 20. 1. e1011118-e1011118
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Yudai Masuoka, Akiya Jouraku, Seigo Kuwazaki, Mikio Yoshiyama, Mari Horigane-Ogihara, Taro Maeda, Yutaka Suzuki, Hidemasa Bono, Kiyoshi Kimura, Kakeru Yokoi. Genome assembly reconstruction of the Japanese honey bee,Apis cerana japonica(Hymenoptera: Apidae), using homology-based assembly and nanopore long-reads. BioRxiv. 2023
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Ryusei Waizumi, Takuya Tsubota, Akiya Jouraku, Seigo Kuwazaki, Kakeru Yokoi, Tetsuya Iizuka, Kimiko Yamamoto, Hideki Sezutsu. Highly accurate genome assembly of an improved high-yielding silkworm strain, Nichi01. G3 Genes|Genomes|Genetics. 2023
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Daiki Kato, Ken Miura, Kakeru Yokoi. Analysis of the Toll and Spaetzle Genes Involved in Toll Pathway-Dependent Antimicrobial Gene Induction in the Red Flour Beetle, Tribolium castaneum (Coleoptera; Tenebrionidae). International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 2. 1523-1523
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MISC (18):
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横井 翔, 瀬筒 秀樹. カイコの遺伝子データ拡張とその利用. 農研機構技報. 2024. 15
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KOBAYASHI TETSUYA, LIU CHIA-MING, HATAKEYAMA MASATSUGU, UEHARA TAKUYA, JOURAKU AKIYA, YOKOI KAKERU, MASUOKA YUDAI. I-3. Genome analysis of black soldier fly and its application in breeding. NIPPON SUISAN GAKKAISHI. 2023. 89. 5. 450-450
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Ryusei Waizumi, Chikara Hirayama, Shuichiro Tomita, Tetsuya Iizuka, Seigou Kuwazaki, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Kakeru Yokoi, Kimiko Yamamoto, Hideki Sezutsu. A major endogenous glycosidase mediating quercetin uptake in Bombyx mori. BioRxiv. 2023
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坪田拓也, 増岡裕大, 横井翔, 高須陽子, 瀬筒秀樹. Analysis of the silk genes in the wild silkmoth, Samia ricini. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
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Daiki Kato, Ken Miura, Kakeru Yokoi. Analysis of the Toll and spaetzle genes involved in Toll path-way-dependent antimicrobial gene induction in the red flour beetle, Tribolium castaneum (Coleoptera: Tenebriodae). BioRxiv. 2022
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Books (10):
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General remarks: Insects and Access and Benefit-Sharing Kakeru Yokoi, Ayako Ishikawa
2024
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Chapter7(2)主成分分析(PCA)(RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実)
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
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Chapter7 サンプル間の類似度を比較する (1)階層クラスタリング(RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実)
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
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Chapter4 リファレンスゲノムのない生物でde novo解析を行う 〜アセンブリからアノテーションまで(RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実)
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
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ミツバチのゲノム情報解析とその応用
養蜂産業振興会報No.9 p5-9 2023
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Lectures and oral presentations (88):
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昆虫ゲノムデータ解析を始める
(日本昆虫学会第84回大会 第68回日本応用動物昆虫学会大会 小集会 DNA配列データ解析を始めてみようII 2024)
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昆虫遺伝子機能アノテーションをどうするか
(日本昆虫学会第84回大会 第68回日本応用動物昆虫学会大会 小集会 昆虫機能アノテーション:昆虫データ解析に今必要なこと 2024)
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はじめに-趣旨説明
(日本昆虫学会第84回大会 第68回日本応用動物昆虫学会大会 昆虫学におけるABS対応7 ABSの基礎と最新事例 2024)
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ゲノム情報解析によるミツバチのダニ抵抗性遺伝子の探索
(ミツバチサミット2023 2023)
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I-3. Genome analysis of black soldier fly and its application in breeding
(NIPPON SUISAN GAKKAISHI 2023)
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Education (3):
- 2009 - 2012 Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
- 2007 - 2009 Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
- 2002 - 2007 Nagoya University School of Agricultural Sciences Department of Biological Resources and Environmental Sciences
Professional career (1):
Work history (12):
- 2021/04 - 現在 National Agriculture and Food Research Organization Institute of Agrobiological Sciences, NARO
- 2023/04 - 2024/03 山口大学理学部非常勤講師
- 2021/04 - 2024/03 National Agriculture and Food Research Organization
- 2019/10 - 2021/03 国立研究開発法人 農研機構 生物機能利用研究部門・遺伝子利用基盤研究領域・先進昆虫ゲノム改変ユニット 主任研究員
- 2018/10 - 2021/03 National Agriculture and Food Research Organization
- 2019/04 - 2019/09 国立研究開発法人 農研機構 生物機能利用研究部門・遺伝子利用基盤研究領域・先進昆虫ゲノム改変ユニット 研究員
- 2016/04 - 2019/03 国立研究開発法人 農研機構 生物機能利用研究部門・遺伝子利用基盤研究領域・先進昆虫ゲノム改変ユニット 研究員(任期付)
- 2015/10 - 2016/03 国立研究開発法人・農業生物資源研究所 農業生物先端ゲノム研究センター・•昆虫ゲノム研究ユニット 任期付研究員
- 2015/05 - 2015/09 Aichi Medical University
- 2012/10 - 2015/09 名古屋大学大学院 生命農学研究科 博士研究員
- 2012/04 - 2012/09 Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
- 2012/03 - 2012/09 Nagoya University
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Committee career (4):
- 2023 - 現在 養蜂等振興強化推進事業 委員
- 2024/03 - 第68回日本応用動物昆虫学会大会 日本昆虫学会第84回大会 合同大会運営委員
- 2019/01 - 2022/12 日本応用動物昆虫学会 学会誌編集委員会委員
- 2019/03 - 第63回日本応用動物昆虫学会大会 運営委員
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