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J-GLOBAL ID：200901011515136622   Update date: Feb. 01, 2024

Honda Naoki

ホンダ ナオキ | Honda Naoki
Affiliation and department：
Hiroshima University

About Hiroshima University


Other affiliations (2)：
Research field  (3)： Developmental biology ,  Biophysics ,  Neuroscience - general
Research keywords  (9)： データ駆動生物学 ,  理論生物学 ,  システム生物学 ,  定量生物学 ,  機械学習 ,  Mathematical biology ,  神経科学 ,  発生生物学 ,  1細胞ゲノミクス
Research theme for competitive and other funds  (8)：
  • 2021 - 2025 多細胞動態を司る支配方程式のデータ駆動的解読
  • 2021 - 2024 あいまい環境に対峙する脳・生命体の情報獲得戦略研究の推進
  • 2021 - 2024 新自由エネルギー原理の確立
  • 2019 - 2021 Analyses of cortical actin dynamics by live-cell imaging and machine-learning
  • 2019 - 2021 脳回路構築における軸索配線原理の解読
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Papers (39)：
  • Tomoya Nakayama, Miki Tanikawa, Yuki Okushi, Thoma Itoh, Tsuyoshi Shimmura, Michiyo Maruyama, Taiki Yamaguchi, Akiko Matsumiya, Ai Shinomiya, Ying-Jey Guh, et al. A transcriptional program underlying the circannual rhythms of gonadal development in medaka. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2023. 120. 52
  • Yuichiro Yada, Honda Naoki. Few-shot prediction of amyloid β accumulation from mainly unpaired data on biomarker candidates. npj Systems Biology and Applications. 2023. 9. 1
  • Shunta Sakaguchi, Sonoko Mizuno, Yasushi Okochi, Chiharu Tanegashima, Osamu Nishimura, Tadashi Uemura, Mitsutaka Kadota, Honda Naoki, Takefumi Kondo. Single-cell transcriptome atlas of Drosophila gastrula 2.0. Cell reports. 2023. 112707-112707
  • Shunta Sakaguchi, Sonoko Mizuno, Yasushi Okochi, Chiharu Tanegashima, Osamu Nishimura, Tadashi Uemura, Mitsutaka Kadota, Honda Naoki, Takefumi Kondo. Single-cell transcriptome atlas of Drosophila gastrula 2.0. Cell Reports. 2023. 112707-112707
  • Yudai Hatakeyama, Nen Saito, Yusuke Mii, Ritsuko Takada, Takuma Shinozuka, Tatsuya Takemoto, Honda Naoki, Shinji Takada. Intercellular exchange of Wnt ligands reduces cell population heterogeneity during embryogenesis. Nature Communications. 2023. 14. 1
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MISC (10)：
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Books (2)：
  • AI導入によるバイオテクノロジーの発展
    シーエムシー出版 2018
  • Trends in Biophysics: From Cell Dynamics Toward Multicellular Growth Phenomena
    Apple Academic Press 2013
Professional career (1)：
  • 奈良先端科学技術大学院大学
Work history (9)：
  • 2021/07 - 現在 National Institutes of Natural Sciences
  • 2021/07 - 現在 Hiroshima University
  • 2018/04 - 2021/03 京都大学大学院 生命科学研究科 准教授
  • 2017/04 - 2018/03 京都大学大学院 生命科学研究科 特定准教授
  • 2013/05 - 2017/03 京都大学大学院 医学研究科 生命動態システム科学推進拠点 特定准教授
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Association Membership(s) (5)：
数理生物学会 ,  発生生物学会 ,  生物物理学会 ,  神経回路学会 ,  神経科学学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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