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J-GLOBAL ID：200901011646491193   Update date: Jan. 31, 2024

Nagata Yuji

ナガタ ユウジ | Nagata Yuji
Affiliation and department：
Tohoku University Graduate School of Life Sciences, Department of Molecular and Chemical Life Sciences, Microbial Genetics and Evolution

About Tohoku University Graduate School of Life Sciences, Department of Molecular and Chemical Life Sciences, Microbial Genetics and Evolution


Job title： Professor
Homepage URL  (2)： http://www.lifesci.tohoku.ac.jp/biideshin/index.html ,  https://www.lifesci.tohoku.ac.jp/en/research/teacher/detail---id-45545.html
Research field  (1)： Applied biochemistry
Research keywords  (4)： genome ,  protein engineering ,  biodegradation ,  Environmental pollutant
Research theme for competitive and other funds  (36)：
  • 1991 - 現在 Study on biodegradation of polychlorinated biphenyls
  • 1991 - 現在 Study on Biodegradation of γ-hexachlorocyclohexane
  • 2021 - 2026 土壌微生物機能発揮の鍵となる群集・メタゲノム構造の特定
  • 2022 - 2025 Advanced utilization strategies of beneficial bacteria based on the survival and growth mechanisms of bacteria under poor conditions
  • 2022 - 2024 Approach to the substance of bacterial extracellular genetic information storage device
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Papers (152)：
  • Keiichiro Sakai, Kouhei Kishida, Satoshi Matsumoto, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Yoshiyuki Ohtsubo. Three distinct metabolic phases of PCB/biphenyl degrader Acidovorax sp. KKS102 in nutrient broth. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2024
  • Kafayat Olaide Yusuf Habibullah, Ren Ito, Leonardo Stari, Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Eiji Masai, Masao Fukuda, Keisuke Miyauchi, Yuji Nagata. Degradation of DDT by γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2023. 88. 1. 123-130
  • Dailin Yang, Hiromi Kato, Kazutaka Kawatsu, Yutaka Osada, Toyohiro Azuma, Yuji Nagata, Michio Kondoh. Reconstruction of a Soil Microbial Network Induced by Stress Temperature. Microbiology Spectrum. 2022. 10. 5
  • Yuji Nagata, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo. CO2 -dependent High-yield Growth of a Heterotrophic Bacterium under Oligotrophic Conditions. Journal of Environmental Biotechnology. 2022. 22. 1. 9-13
  • Yoshiyuki Ohtsubo, Yuu Hirose, Yuji Nagata. Algorisms used for in silico finishing of bacterial genomes based on short-read assemblage implemented in GenoFinisher, AceFileViewer, and ShortReadManager. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry. 2022. 86. 6. 693-703
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MISC (113)：
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Patents (1)：
  • ハロアルカンデハロゲナーゼを使用するイペリットの解毒方法
Books (13)：
  • DNA Traffic in the Environment
    Springer 2019
  • 酵素利用技術体系
    エヌ・ティー・エス 2010
  • 難培養性微生物研究の最新技術II
    シーエムシー出版 2010
  • マリンメタゲノムの有効利用
    シーエムシー出版 2009
  • バイオフィルムの基礎と制御
    株式会社エヌ・ティー・エス 2008
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Lectures and oral presentations  (11)：
  • 従属栄養細菌の極貧栄養環境での CO 2依存的な増殖現象
    (日本農芸化学会2021年度大会シンポジウム「細菌の低栄養環境に対する増殖を伴う適応機構」 2021)
  • 細菌の進化機構の理解と環境浄化への応用
    (社会にインパクトある研究F-1「生命の奇跡のプロセスに学ぶイノベーション」キックオフシンポジウム 2019)
  • 環境浄化で活躍する微生物
    (Visionary 農芸化学100シンポジウム・「微生物と私たちの健康・暮らし・環境 〜世界に誇る日本の微生物研究〜」 2018)
  • HCH脱塩素反応を触媒するハロアルカンデハロゲナーゼの多様性とバイオレメディエーションへの応用
    (第36回農薬環境科学研究会 2018)
  • 人為起源環境汚染物質分解微生物から進化に迫る
    (東北大学大学院生命科学研究科改組記念講演会 2018)
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Professional career (1)：
  • Ph. D. (The University of Tokyo)
Awards (4)：
  • 2015/02 - Siemens Siemens Innovation Prize 2014 in Czech Republic Biotechnologies using dehalogenases
  • 2004/10 - 東北大学大学院生命科学研究科 東北大学大学院生命科学研究科内研究奨励賞 環境汚染物質分解に関わる脱ハロゲン酵素遺伝子の自然生態系からの直接的取得と解析
  • 2003/05/15 - インテリジェント・コスモス学術振興財団 インテリジェント・コスモス奨励賞 細菌由来の有機塩素系環境汚染物質分解酵素の蛋白質工学的及び分子生態学的研究
  • 2000/04 - 日本農芸化学会 農芸化学奨励賞 環境を汚染する有機塩素系農薬gamma-HCHの微生物代謝系の解明
Association Membership(s) (6)：
日本ゲノム微生物学会 ,  環境バイオテクノロジー学会 ,  The Japanese Society of Microbial Ecology ,  American Society for Microbiology ,  The Society for Biotechnology, Japan ,  The Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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