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J-GLOBAL ID：200901028956985706   Update date: Feb. 01, 2024

Tokumasa Horiike

ホリイケ トクマサ | Tokumasa Horiike
Affiliation and department：
Shizuoka University

About Shizuoka University


Job title： Associate Professor
Research field  (2)： Genomics ,  Evolutionary biology
Research keywords  (3)： phylogenetic tree ,  Bioinformatics ,  Massive data analysis
Research theme for competitive and other funds  (2)：
  • 2022 - 2026 分子進化シミュレーションによる長枝誘引の発生メカニズム解明と解消法の提案
  • 2010 - 2012 Development of new system for making ortholog dataset
Papers (30)：
  • 堀池徳祐, 渡邊知輝. ゲノムデータの分子系統解析への応用と今後の展望. 化学と生物. 2023. 6. 257-259
  • Tomoaki Watanabe, Akinori Kure, Tokumasa Horiike. OrthoPhy: A program to construct ortholog datasets using taxonomic information. Genome Biology and Evolution. 2023. 3. 1-16
  • Watanabe Tomoaki, Horiike Tokumasa. The Evolution of Molybdenum Dependent Nitrogenase in Cyanobacteria. Biology. 2021. 10. 4. 329
  • 伊藤玄, 古屋康則, 堀池徳祐, 向井貴彦. 伊勢湾周辺域におけるアカハライモリの遺伝的集団構造. 爬虫両棲類学会報. 2020. 2020. 2. 139-150
  • Gen Ito, Yasunori Koya, Tokumasa Horiike, Takahiko Mukai. Genetic population structure of Cobitis minamorii tokaiensis. Japanese Journal of Ichthyology. 2020. 67. 1. 41-50
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MISC (1)：
Patents (2)：
  • 無根系統樹の同型判定方法をコンピュータ上で実行可能なプログラム,それを記録したコンピュータ読取可能な記録媒体および無根系統樹の同型判定装置
  • 相同性解析システム、相同性解析方法、相同性解析プログラム及び取引成立システム
Books (2)：
  • CELLULAR ORIGIN AND LIFE IN EXTREME HABITATS (Volume 3: Symbiosis, Nucleus Symbiosis Hypothesis Formation of Eukaryotic Cell Nuclei by the Symbiosis of Archaea in Bacteria)
    Springer 2004
  • サイバネティック・ルネサンス
    工業調査会 1999
Lectures and oral presentations  (54)：
  • indel マーカーを作成するプ ログラム LINDA(Large INDel Analyzer)の開発
    (園芸学会 2023)
  • 分類情報を用いたオーソログデータセット作成プログラムOrthoPhyの開発
    (第17回日本ゲノム微生物学会年会 2023)
  • 食虫植物の収斂タンパク質検出と正の自然選択検定
    (第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023)
  • NGSロングリードを利用した挿入・欠失マーカー作成プログラムの開発
    (第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023)
  • Farris系統樹で発生する長枝誘引
    (第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023)
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Professional career (1)：
  • 博士(工学) (群馬大学)
Work history (1)：
  • Shizuoka University Graduate School of Science and Technology,Research Division, Integrated Bioscience Section, Graduate School of Science and Technology,Research Division Assistant professor
Association Membership(s) (3)：
Information Processing Society of Japan ,  Society of Evolutionary Studies, Japan ,  Society of Genome Microbiology, Japan
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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