Osada Naoki

オサダナオキ | Osada Naoki

Affiliation and department：
Homepage URL (1)： https://sites.google.com/view/nosada17/

Research field (4)： Systems genomics , Genomics , Biodiversity and systematics , Evolutionary biology

Research keywords (17)：遺伝子重複 , 遺伝子発現調節 , 再編 , カニクイザル , CXCL1L , ケモカイン , 偽遺伝子 , ゲノム進化 , 翻訳 , CXCL1 , グノム , 種分化 , 生態学 , 霊長類 , 進化 , 遺伝学 , 遺伝子交流

Research theme for competitive and other funds (14)：

2023 - 2028 先史人類による人為的環境形成(動物相)に関する研究
2023 - 2028 Integrative Bioarcheology: Reconstruction of Human Prehistory around the Japanese Archipelago
2022 - 2026 Comprehensive search and population genetic analysis of virus-like sequences in human genomes
2023 - 2026 Thousands of adaptive changes emerging from thousands of genomes within a species
2022 - 2025 血中exosome内circRNA発現解析による膵癌の診断・予後関連マーカー探索

Show all

Papers (92)：

Kazumichi Fujiwara, Shunpei Kubo, Toshinori Endo, Toyoyuki Takada, Toshihiko Shiroishi, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Inference of selective force on house mouse genomes during secondary contact in East Asia. Genome Research. 2024
Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Exploring The Interplay Between Scoring Functions and Physico-chemical Properties in Antibody-antigen Docking. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 10-17
Satoshi D. Ohdachi, Kazumichi Fujiwara, Chandra Shekhar, Nguyn Trưng Sơn, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Phylogenetics and Population Genetics of the Asian House Shrew, Suncus murinus-S. montanus Species Complex, Inferred From Whole-Genome and Mitochondrial DNA Sequences, with Special Reference to the Ryukyu Archipelago, Japan. Zoological Science. 2024. 41. 2
Kaisa Thorell, Zilia Y. Muñoz-Ramírez, Difei Wang, Santiago Sandoval-Motta, Rajiv Boscolo Agostini, Silvia Ghirotto, Roberto C. Torres, Judith Romero-Gallo, Uma Krishna, Richard M. Peek, et al. The Helicobacter pylori Genome Project: insights into H. pylori population structure from analysis of a worldwide collection of complete genomes. Nature Communications. 2023. 14. 1
Kazuhiro Zakoh, Kazumichi Fujiwara, Toyoyuki Takada, Naoki Osada, Hitoshi Suzuki. Genealogical characterization of regional populations and dorsal coat color variation in the house mouse <I>Mus musculus</I> from Asia based on haplotype structure analysis of a gene-rich region harboring <I>Mc1r</I>. Genes & Genetic Systems. 2023

ｍore...

MISC (42)：

長田直樹. ソフトウェア紹介13:SLiM-前向きシミュレーターについて. Yaponesian. 2022. 4. はる. 12-13
長田直樹. 最先端医療の今ヤポネシア人の人口・歴史推定. Medical Science Digest. 2021. 47. 9. 476-478
東アジアから俯瞰する二重構造説. Yaponesian. 2021. 3. ふゆ
長田直樹. ソフトウェア紹介9:TreeMixとqpGraph. Yaponesian. 2021. 3. はる. 37-39
長田直樹. 論文紹介4:ゲノム規模の遺伝子データを用いた日本列島への人類の移動モデルの探索. Yaponesian. 2021. 3. はる. 17-21

ｍore...

Books (7)：

霊長類学の百科事典 = The encyclopedia of primatology
丸善出版 2023 ISBN:9784621308042
Encyclopedia of genetics : origin of inheritance and diversity
2022 ISBN:9784621306604
進化で読み解くバイオインフォマティクス入門
森北出版 2019 ISBN:4627261411
ヒトは病気とともに進化した (シリーズ認知と文化)
勁草書房 2013 ISBN:4326199458
遺伝子図鑑
悠書館 2013 ISBN:4903487792

ｍore...

Lectures and oral presentations (123)：

ゲノムデータのQC,マッピング,バリアントコール,フィルタリング
(第一回統合生物考古学セミナー 2023)
東アジアにおいて野生ハツカネズミが辿った歴史と進化
(第33回モロシヌス研究会 2023)
ほぼ中立説と弱有害変異について-霊長類・げっ歯類ゲノム研究の視点から
(日本遺伝学会第95回大会 2023)
人類の移動に伴う小型げっ歯類の拡散と進化
(日本進化学会第25回沖縄大会 2023)
ゲノム多様性のバイオインフォマティクス解析:野生ハツカネズミの歴史とゲノム進化
(第一回北海道バイオ”Mix up” 2023)

ｍore...

Education (2)：

1997 - 2002 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻
1993 - 1997 University of Tokyo

Professional career (1)：

博士(理学) (東京大学)

Work history (11)：

2019/04 - 現在 Hokkaido University
2012/05 - 現在放射線医科学総合研究所客員研究員
2017/09 - 2021/03 Hokkaido University
2015/04 - 2019/03 Hokkaido University Graduate School of Information Science and Technology
2010/01 - 2015/03 National Institute of Genetics, SOKENDAI 助教

Show all

Committee career (19)：

2023/04 - 2025/03 日本遺伝学会評議員
2022/07 - 2024/06 日本進化学会代議員
2020/01 - 2020/12 文部科学省科研費専門委員会委員
2019/01 - 2020/12 日本遺伝学会評議員
2018/08 - 2019/08 第21回日本進化学会大会大会準備委員長

Show all

Awards (3)：

2019/07 - 日本学術振興会特別研究員等審査会専門委員(書面担当)の表彰
2014/09 - Genetic Society of Japan The GSJ Award for Young Scientists
2007/10 - 日本遺伝学会ベストペーパー賞 On the correlation between gene expression pattern and selection intensity in the human genome

Association Membership(s) (7)：

THE SOCIETY OF BIOSOPHIA STUDIES , JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS , 日本人類学会 , 日本分子生物学会 , 日本霊長類学会 , 日本進化学会 , 日本遺伝学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

Return to Previous Page