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J-GLOBAL ID：200901044232295363   Update date: Jan. 30, 2024

Sakumura Yuichi

サクムラ ユウイチ | Sakumura Yuichi
Affiliation and department：
Nara Institute of Science and Technology

About Nara Institute of Science and Technology


Homepage URL  (1)： https://ncb.naist.jp
Research field  (5)： Biophysics ,  Biological, health, and medical informatics ,  Soft computing ,  Systems genomics ,  Neuroscience - general
Research keywords  (28)： システム生物学 ,  統計解析 ,  形態形成 ,  シグナル伝達 ,  分子生物学 ,  システム同定 ,  軸索誘導 ,  生物形態 ,  膜電位 ,  ベイズ推定 ,  細胞形態 ,  数理生物 ,  発生 ,  分節化 ,  生物時計 ,  神経成長 ,  軸索伸長 ,  Notch シグナル ,  シミュレーション ,  体節 ,  分子時空間計測 ,  Rhoファミリー低分子量Gタンパク質 ,  細胞運動 ,  推論問題 ,  非線型力学 ,  システム神経生物学 ,  Protein Interaction Nonlinear Dynamics ,  Brain Information
Research theme for competitive and other funds  (22)：
  • 2023 - 2025 Elucidating the mechanism of angiogenesis through a quantitative model of cell movement
  • 2021 - 2024 Comprehensive study on the effects of periodontal pathogen on the pathophysiology of atrial fibrillation
  • 2020 - 2023 呼気成分による複数疾病のAI診断と生物学的基盤に関する研究
  • 2018 - 2020 細胞の社会的ふるまいを軸とした発生過程のロバストな器官サイズ決定機構の新展開
  • 2017 - 2019 体節細胞の速い同調を構成する細胞モデルと検証
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Papers (38)：
  • Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. On-Line Reoptimization of Mammalian Fed-Batch Culture Using a Nonlinear Model Predictive Controller. New Generation Computing. 2023
  • Ryosuke Fujikawa, Chika Okimura, Satoshi Kozawa, Kazushi Ikeda, Naoyuki Inagaki, Yoshiaki Iwadate, Yuichi Sakumura. Bayesian traction force estimation using cell boundary-dependent force priors. Biophysical Journal. 2023
  • Yuichi SAKUMURA, Katsuyuki KUNIDA. Extracting quantitative relationships between cell motility and molecular activities (Analytical approaches and implications). Journal of Biomechanical Science and Engineering. 2023
  • Tomoki Ohkubo, Yuki Soma, Yuichi Sakumura, Taizo Hanai, Katsuyuki Kunida. A hybrid in silico/in-cell controller for microbial bioprocesses with process-model mismatch. Scientific Reports. 2023. 13. 1
  • Toshio Itoh, Yutaro Koyama, Yuichi Sakumura, Takafumi Akamatsu, Akihiro Tsuruta, Yoshitake Masuda, Woosuck Shin. Discrimination of volatile organic compounds using a sensor array via a rapid method based on linear discriminant analysis. Sensors and Actuators B: Chemical. 2023. 387. 133803-133803
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MISC (33)：
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Books (5)：
  • 半導体式ガスセンサによる呼気分析と統計解析
    電気化学 2018
  • Quantitative Modeling of Neuronal Polarization
    2012
  • 神経細胞が突起の長さを検知する仕組みと神経細胞の対称性の破れ
    エヌ・ティー・エス 2011
  • 細胞形態変化の定量と現象論的モデル
    秀潤社 2010
  • 神経の可塑性と発達の生体反応モデリング
    羊土社 2007
Lectures and oral presentations  (74)：
  • Feature Selection using Distance from Classification Boundary and Monte Carlo Simulation
    (The 25th International Conference on Neural Information Processing (ICONIP 2018) 2018)
  • Stochasticity Promotes Synchronized Gene Expression between Cells in Somite Segmentation
    (2017)
  • 細胞性粘菌の運動の数理モデル
    (バイオメカニクス研究会 2015)
  • 軸索伸長の抑制因子と因子阻害剤の浸透率の推定
    (電子情報通信学会技術研究報告 2015)
  • 神経細胞の形態形成モデル
    (立命館大学視覚科学統合研究センターシンポジウム 2014)
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Education (3)：
  • 1996 - 1999 The University of Tokyo Graduate School of Engineering
  • 1994 - 1996 The University of Tokyo Graduate School of Engineering
  • 1990 - 1994 Tokyo Institute of Technology School of Science Department of Physics
Professional career (1)：
  • Doctor(Engineering) (The University of Tokyo)
Work history (8)：
  • 2021/04 - 現在 Nara Institute of Science and Technology Data Science Center Professor
  • 2018/04 - 2021/03 Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Science and Technology Associate Professor
  • 2017/04 - 2018/03 Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Biological Sciences Associate Professor
  • 2012/04 - 2017/03 Aichi Prefectural University School of Information Science and Technology Associate Professor
  • 2011/04 - 2012/03 Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Biological Sciences Associate Professor
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Committee career (4)：
  • 2015/04 - 現在 Journal of the Physical Society of Japan 編集委員
  • - 現在 電子情報通信学会 編集委員
  • 2008/04 - 2012/03 日本神経回路学会 理事
  • 2008/04 - 2011/03 日本神経科学学会 神経科学ニュース編集委員
Association Membership(s) (7)：
Asia Pacific Neural Network Society ,  北米神経科学学会 ,  電子情報通信学会ソサイエティ論文誌 編集委員会 ,  Biophysical Society ,  THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN ,  THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN ,  日本神経科学学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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