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J-GLOBAL ID：200901058692177335   Update date: Feb. 02, 2024

Nishiyama Atsuya

ニシヤマ アツヤ | Nishiyama Atsuya
Affiliation and department：
東京大学 医科学研究所 癌・細胞増殖部門癌防御シグナル分野

About 東京大学 医科学研究所 癌・細胞増殖部門癌防御シグナル分野


Job title： 准教授
Research field  (1)： Molecular biology
Research keywords  (12)： ADPリボシル化 ,  PAF15 ,  USP7 ,  脱ユビキチン化 ,  クロマチン ,  ツメガエル卵無細胞系 ,  Histone ,  Dnmt1 ,  Uhrf1 ,  Ubiquitin ,  DNA replication ,  DNA Methylation
Research theme for competitive and other funds  (9)：
  • 2021 - 2023 5-aza-dCTPによる新たなDNA維持メチル化制御機構の解明
  • 2019 - 2023 DNAメチル化を介したゲノム安定性制御の分子メカニズム
  • 2018 - 2021 Structural basis for DNA methylation maintenance regulated by replication factors.
  • 2019 - 2021 ケモテクノロジーで探るDNAメチル化部位特異的なユビキチンシグナル機能とその制御
  • 2016 - 2019 試験管内染色体複製系を用いたDNA維持メチル化制御の分子基盤の解明
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Papers (31)：
  • Nao Shiraishi, Tsuyoshi Konuma, Yoshie Chiba, Sayaka Hokazono, Md Hadiul Islam, Makoto Nakanishi, Atsuya Nishiyama, Kyohei Arita. Structure of human DPPA3 bound to the UHRF1 PHD finger reveals its functional and structural differences from mouse DPPA3. 2024
  • Isabel E Wassing, Atsuya Nishiyama, Moeri Hiruta, Qingyuan Jia, Reia Shikimachi, Amika Kikuchi, Keita Sugimura, Xin Hong, Yoshie Chiba, Junhui Peng, et al. CDCA7 is a hemimethylated DNA adaptor for the nucleosome remodeler HELLS. bioRxiv : the preprint server for biology. 2023
  • Dan Li, Yoshikazu Johmura, Satoru Morimoto, Miyuki Doi, Keiko Nakanishi, Manabu Ozawa, Yuji Tsunekawa, Akane Inoue-Yamauchi, Hiroya Naruse, Takashi Matsukawa, et al. LONRF2 is a protein quality control ubiquitin ligase whose deficiency causes late-onset neurological deficits. Nature aging. 2023. 3. 8. 1001-1019
  • Ryota Miyashita, Atsuya Nishiyama, Weihua Qin, Yoshie Chiba, Satomi Kori, Norie Kato, Chieko Konishi, Soichiro Kumamoto, Hiroko Kozuka-Hata, Masaaki Oyama, et al. The termination of UHRF1-dependent PAF15 ubiquitin signaling is regulated by USP7 and ATAD5. eLife. 2023. 12
  • Hiroki Onoda, Amika Kikuchi, Kosuke Yamaguchi, Satomi Kori, Shun Matsuzawa, Yoshie Chiba, Shota Tanimoto, Sae Yoshimi, Hiroki Sato, Atsushi Yamagata, et al. Structural basis for activation of DNMT1. 2022
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MISC (7)：
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Lectures and oral presentations  (27)：
  • DNAメチル化制御因子CDCA7は ヘミメチル化DNAに特異的に結合する
    (第27回DNA複製・組換え・修復ワークショップ 2023)
  • USP7とATAD5はUHRF1依存的なPAF15ユビキチンシグナルを制御する
    (第45回分子生物学会年会 2022)
  • DNMT1-DNA架橋によって誘導されるSUMOシグナルとその制御機構
    (第95回日本生化学会大会 2022)
  • DNAメチル化継承の分子機構
    (日本遺伝学会第94回大会 2022)
  • The termination of UHRF1-dependent PAF15 ubiquitin signaling is regulated by USP7 and ATAD5
    (2022)
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Works (2)：
  • 維持型DNAメチル化酵素DNMT1とモノユビキチン化されたヒストンH3との複合体の結晶構造から明らかにされたDNA維持メチル化の分子基盤
    西山 敦哉, 有田恭平, 中西真 2017 -
  • Uhrf1-dependent H3K23 ubiquitylation couples maintenance DNA methylation and replication.
    NISHIYAMA Atsuya 2013 -
Education (2)：
  • 1995 - 2000 東京工業大学大学院 生命理工学研究科 バイオサイエンス専攻
  • 1991 - 1995 東京工業大学大学院 生命理工学部 生命理学学科
Work history (3)：
  • 2018/09 - 現在 The University of Tokyo The Institute of Medical Science
  • 2016/08 - 2018/08 The University of Tokyo
  • 2011/05 - 2016/07 Nagoya City University
Awards (6)：
  • 2020 - 第一三共生命科学研究振興財団 2020年度研究助成 DNMT1阻害剤5-aza-dCTPが形成するDNAタンパク質架橋修復の分子機構(2020年度)
  • 2018/09 - 武田科学振興財団 医学系研究継続助成 DNAメチル化維持機構の破綻がもたらすゲノム不安定化のメカニズムの解明
  • 2017/11 - 持田記念医学薬学振興財団 平成29年度研究助成金 ゲノムDNAの複製とDNAメチル化維持をリンクする新規DNAメチル化制御機構の解明
  • 2016 - 内藤記念科学振興財団 2016年度 内藤記念科学奨励金・研究助成 試験管内染色体複製系を用いた新規DNAメチル化制御因子の機能解析
  • 2015 - 武田科学振興財団 医学系研究奨励 DNAメチル化維持機構の破綻がもたらすゲノム不安定化のメカニズムの解明
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Association Membership(s) (3)：
THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY ,  日本エピジェネティクス研究会 ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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