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J-GLOBAL ID：200901091976994322
Update date: Jan. 05, 2024
Yuichi Kodama
コダマ ユウイチ | Yuichi Kodama
Affiliation and department：
Job title：
Researcher
Homepage URL (1)：
https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=NV7bPO4AAAAJ
Research field (1)：
Genomics
Research keywords (3)：
Database
, バイオインフォマティクス
, Bioinformatics
Research theme for competitive and other funds (2)：
- バイオインフォマティクス
- Bioinformatics
Papers (25)：
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Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata. Nucleic acids research. 2023
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Tsuyoshi Hachiya, Manabu Ishii, Yosuke Kawai, Seik-Soon Khor, Minae Kawashima, Licht Toyo-Oka, Nobutaka Mitsuhashi, Asami Fukuda, Yuichi Kodama, Takatomo Fujisawa, et al. The NBDC-DDBJ imputation server facilitates the use of controlled access reference panel datasets in Japan. Human genome variation. 2022. 9. 1. 48-48
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Yasuhiro Tanizawa, Takatomo Fujisawa, Yuichi Kodama, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Tomoya Tanjo, Yasukazu Nakamura. DNA Data Bank of Japan (DDBJ) update report 2022. Nucleic acids research. 2022. 51. D1. D101-D105
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Hirotaka Suetake, Tomoya Tanjo, Manabu Ishii, Bruno P. Kinoshita, Takeshi Fujino, Tsuyoshi Hachiya, Yuichi Kodama, Takatomo Fujisawa, Osamu Ogasawara, Atsushi Shimizu, et al. Sapporo: A workflow execution service that encourages the reuse of workflows in various languages in bioinformatics. F1000Research. 2022. 11. 889-889
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Toshihisa Okido, Yuichi Kodama, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Takatomo Fujisawa, Osamu Ogasawara. DNA Data Bank of Japan (DDBJ) update report 2021. Nucleic acids research. 2022. 50. D1. D102-D105
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MISC (19)：
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藤澤 貴智, 森 宙史, 谷澤 靖洋, 児玉 悠一, 内山 郁夫, 中川 善一, 山田 拓司, 高橋 弘喜, 中村 保一, 黒川 顕. 統合微生物データベースMicrobeDB.jpポータルサイト拡張. トーゴーの日2019. 2019. 1
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三嶋博之, 坊農秀雅, 片山俊明, 川島秀一, 天竺桂弘子, 児玉悠一, 平川英樹, 市原寿子, 浅水恵理香, 中谷明弘, et al. 今日から使えるデータベース・ウェブツール 第2章 ゲノム/遺伝子/塩基配列を調べる. 実験医学. 2014. 32. 20. 3223-3284
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神沼英里, 長崎英樹, 望月孝子, 児玉悠一, 谷沢靖洋, 大久保公策, 高木利久, 高木利久, 中村保一. 高速シークエンサ由来配列のアーカイブデータベースと解析パイプライン. 日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集. 2013. 31st
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神沼英里, 望月孝子, 長崎英樹, 児玉悠一, 猿橋智, 大久保公策, 高木利久, 大柳一, 倉田のり, 清水徳朗, et al. 新型シークエンサのアーカイブ配列と解析パイプライン:系統間SNP解析を事例として. 育種学研究. 2012. 14. 35
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神沼英里, 望月孝子, 長崎英樹, 児玉悠一, 猿橋智, 高木利久, 大久保公策, 中村保一. 新型シークエンサ・アーカイブDBと大量配列解析パイプライン. 日本植物生理学会年会要旨集. 2012. 53rd
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Books (9)：
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RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
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実験医学増刊 Vol.40 No.17 バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選〜知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤
羊土社 2022 ISBN:4758104069
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バリアントデータ検索&活用 : 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ
羊土社 2020 ISBN:9784758122450
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RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ (実験医学別冊)
羊土社 2019
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研究,健康,医療を支えるデータベース
生物工学会誌第96巻 第2号 バイオミディア 2018
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Lectures and oral presentations (34)：
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MAGE-TAB のメタボロミクスデータへの展開と MetaboBank での利用
(日本プロテオーム学会2022年大会 2022)
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Database and supercomputer resources for human data at DDBJ
(The Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2019 2019)
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DDBJ センターにおけるデータベースサービスのこれまでとこれから
(第41回日本分子生物学会年会 ワークショップ: いかにして公共データベースを生命科学研究に活用するか? (オーガナイザー) 2018)
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Resources for archiving, sharing and analysis of controlled-access human data at DDBJ Center.
(The Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2018 2018)
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次世代シークエンスデータベースの紹介と歩き方
(統合データベース講習会:AJACS番町1 2018)
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Education (4)：
- - 2007 Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Biological Sciences Department of Cell Biology
- - 2007 Nara Institute of Science and Technology Graduate School, Division of Biological Science
- - 2001 Tokyo Institute of Technology School of Bioscience and Biotechnology
- - 2001 Tokyo Institute of Technology Faculty of Life Science and Engineering
Professional career (1)：
- Ph. D (Bioscience) (Nara Institute of Science and Technology)
Work history (3)：
- 2020/04 - 現在 東京大学大学院 農学生命科学研究科 非常勤講師
- 2008/01 - 現在 National Institute of Genetics DNA Data Bank of Japan (DDBJ) Center Researcher
- 2013/10 - 2014/03 東京大学大学院 農学生命科学研究科 非常勤講師
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