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J-GLOBAL ID：200901094457032954   Update date: Apr. 14, 2024

Okuno Yasushi

オクノ ヤスシ | Okuno Yasushi
Affiliation and department：
Kyoto University

About Kyoto University


Job title： Instructor
Research field  (3)： Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics ,  Other
Research keywords  (6)： ゲノム創薬 ,  ゲノムデータベース ,  バイオインフォマティクス ,  Genomic Drug Discovery ,  Genome database ,  Bioinformatics
Research theme for competitive and other funds  (31)：
  • 2022 - 2027 Social implementation trial of ALD/NAFLD predictive model to improve health literacy and promote behavior change
  • 2023 - 2027 「富岳」で目指すシミュレーション・ AI 駆動型次世代医療・創薬
  • 2021 - 2025 Novel diagnostic and therapeutic strategies for ovarian cancer by investigation of cancer and host diversity
  • 2018 - 2021 Research on Biological and Clinical Significance of VUS in Cancer Clinical Sequencing
  • 2016 - 2019 Development of diagnostic biomarkers for "Hypermutated-type" colorectal cancer
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Papers (226)：
  • Shunta Mori, Hiroki Izumi, Mitsugu Araki, Jie Liu, Yu Tanaka, Yosuke Kagawa, Yukari Sagae, Biao Ma, Yuta Isaka, Yoko Sasakura, et al. LTK mutations responsible for resistance to lorlatinib in non-small cell lung cancer harboring CLIP1-LTK fusion. Communications Biology. 2024. 7. 1
  • Mei Tomoto, Yohei Mineharu, Noriaki Sato, Yoshinori Tamada, Mari Nogami-Itoh, Masataka Kuroda, Jun Adachi, Yoshito Takeda, Kenji Mizuguchi, Atsushi Kumanogoh, et al. Idiopathic pulmonary fibrosis-specific Bayesian network integrating extracellular vesicle proteome and clinical information. Scientific Reports. 2024. 14. 1
  • Hirohiko Kohjitani, Hiroshi Koshimizu, Kazuki Nakamura, Yasushi Okuno. Recent developments in machine learning modeling methods for hypertension treatment. Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension. 2024
  • Ryo Kanada, Atsushi Tokuhisa, Yusuke Nagasaka, Shingo Okuno, Koichiro Amemiya, Shuntaro Chiba, Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Koichiro Kato, Yasushi Okuno. Enhanced Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulation with a Smoothed Hybrid Potential Using a Neural Network Model. Journal of chemical theory and computation. 2024. 20. 1. 7-17
  • Yoshinobu Igarashi, Ryosuke Kojima, Shigeyuki Matsumoto, Hiroaki Iwata, Yasushi Okuno, Hiroshi Yamada. Developing a GNN-based AI model to predict mitochondrial toxicity using the bagging method. The Journal of Toxicological Sciences. 2024. 49. 3. 117-126
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MISC (339)：
  • 奥野恭史. ライフインテリジェンスコンソーシアム(LINC). 医学のあゆみ. 2023. 278. 6. 109-112
  • 奥野 恭史. 総論 COVID-19から学ぶシミュレーションの可能性. Precision Medicine 新型コロナウイルスとシミュレーション. 2023. 6. 2. 1-4
  • 糀谷泰彦, 小清水宏, 中村和貴, 奥野恭史. AIと高血圧. 日本臨牀. 2023. 81. 55-59
  • 岩田浩明, 千葉峻太朗, 長谷川亜樹, 大田雅照, 奥野恭史. 製剤処方設計AIの開発. 月刊 PHARMSTAGE. 2022. 11月号
  • 田中良尚, 松本篤幸, 奥野恭史. AI・シミュレーションによる薬剤開発の迅速化. 実験医学. 2022. 40. 13. 2122-2127
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Patents (6)：
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Books (8)：
  • 医薬品開発におけるオミクス解析技術 ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム
    情報機構 2020
  • サイエンスビュー化学総合資料 四訂版2刷
    実教出版 2019
  • NEWS LETTER Vol.12
    文部科学省 2019
  • 2章1節 スーパーコンピュータによる創薬プロセスの高速化と精度向上
    技術情報協会 2018
  • 日本人のためのゲノム医療用AI,2018年度中に試行開始
    週刊医学界新聞 2018
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Lectures and oral presentations  (260)：
  • 特別講演「DXで目指す創薬イノベーション」
    (第73回日本薬学会関西支部 総会・大会 2023)
  • Comprehensive Clinical Risk Assessment of Drug Candidate Compounds using ADMET-AI Models
    (2023)
  • 創薬科学副専攻「創薬科学特殊講義」「AI・シミュレーションが拓く創薬の未来」
    (大阪公立大学第 11 回 創薬科学研究所セミナー 、第 133 回 生物科学フロンティアセミナー 2023)
  • INGOR / SiGN-BN - Gene Network Estimation Software
    (2023)
  • Network-Based Prediction Method for Cancer Driver Missense Mutations.
    (Intelligent Systems for Molecular Biology/European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 2023 2023)
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Education (1)：
  • 京都大学大学院 薬学研究科修士課程薬品作用制御システム専攻
Professional career (1)：
  • 博士(薬学)
Work history (6)：
  • 2021 - 現在 一般社団法人ライフインテリジェンスコンソーシアム 代表理事(併任)
  • 2021 - 現在 理化学研究所 計算科学研究センター HPC/AI駆動型医薬プラットフォーム 部門長(併任)
  • 2016 - 現在 京都大学 大学院医学研究科 人間健康科学系専攻 ビッグデータ医科学分野 教授
  • 2017 - 理化学研究所 科技ハブ産連本部 医科学イノベーションハブ推進プログラム 副プログラムディレクター
  • 2016 - 理化学研究所 科技ハブ産連本部 健康生き活き羅針盤リサーチコンプレックス推進プログラム 融合研究推進グループディレクター
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Awards (8)：
  • 2021/04 - 日刊工業新聞社 主催「第50回日本産業技術大賞」 内閣総理大臣賞 スーパーコンピュータ「富岳」
  • 2020/12 - 量子生命科学会 優秀発表賞 創薬応用を目指したテンプレートマッチンングによる生体分子構造多形評価法の開発
  • 2020 - 内閣府 第2回日本オープンイノベーション大賞 厚生労働大臣賞
  • 2011 - 財団法人新技術開発財団 第43回市村学術賞
  • 2009 - 文部科学省 文部科学大臣表彰 科学技術賞 (科学技術振興部門)
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Association Membership(s) (6)：
日本化学療法学会 ,  ケミカルバイロジー研究会 ,  情報計算化学生物学会(CBI学会) ,  日本分子生物学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本薬学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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