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J-GLOBAL ID：200901096092851040   Update date: Jan. 29, 2024

Kitao Akio

キタオ アキオ | Kitao Akio
Affiliation and department：
Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology

About Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology


Job title： Professor
Homepage URL  (2)： http://www.kitao.bio.titech.ac.jp/ ,  http://www.kitao.bio.titech.ac.jp/indexE.html
Research field  (3)： Basic physical chemistry ,  Bio-, chemical, and soft-matter physics ,  Biophysics
Research keywords  (24)： energy landscape ,  solvation ,  function ,  dynamics ,  molecular simulation ,  nano machine ,  Protein ,  分子論 ,  相互作用 ,  分子メカニズム ,  超並列計算 ,  生体分子機械 ,  エネルギー地形 ,  水和 ,  機能 ,  ダイナミクス ,  分子シミュレーション ,  ナノマシン ,  蛋白質 ,  Theoretical Chemistry ,  Computational Chemistry ,  Computational Physics ,  Chemical Physics ,  Biophysics
Research theme for competitive and other funds  (36)：
  • 2020 - 2023 プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進
  • 2019 - 2023 先端シミュレーションで低分子結合が制御するGPCR活性化のメカニズムを探る
  • 2020 - 2022 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析
  • 2017 - 2020 回転分子モーター制御機構解明への再構成的アプローチ
  • 2014 - 2020 生体分子システムの機能制御による革新的創薬基盤の構築
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Papers (122)：
  • Tegar N. Wijaya, Akio Kitao. Energetic and Kinetic Origins of CALB Interfacial Activation Revealed by PaCS-MD/MSM. The Journal of Physical Chemistry B. 2023. 127. 7431-7441
  • Akio Kitao. Molecular Simulation to Investigate Open-Close Motion of a Flagellar Export Apparatus Protein FlhAC. Methods in Molecular Biology. 2023. 27-34
  • Kazuhiro Takemura, Akio Kitao. Molecular dynamics. Plasma Membrane Shaping. 2023. 431-443
  • Mariko Kojima, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Yuki Hishikawa, Akio Kitao, Takafumi Ueno. Engineering of an in-cell protein crystal for fastening a metastable conformation of a target miniprotein. Biomaterials Science. 2023
  • Tatsuro Nishikino, Norihiro Takekawa, Duy Phuoc Tran, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Sakura Onoe, Seiji Kojima, Michio Homma, Akio Kitao, Takayuki Kato, et al. Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2022. 631. 78-85
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MISC (131)：
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Patents (1)：
  • FLAGELLAR AN DNEEDLE COMPLEX(INJECTOSOME)LOOP AS ANTI BACTERIAL DRUG TARGET,
Books (7)：
  • in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術
    技術情報協会 2018 ISBN:9784861046889
  • The Bacterial Flagellum
    Springer 2017
  • 揺らぎ・ダイナミクスと生体機能 : 物理化学的視点から見た生体分子
    化学同人 2013 ISBN:9784759815108
  • シミュレーション辞典
    コロナ社 2012 ISBN:9784339024586
  • Normal mode analysis : theory and applications to biological and chemical systems
    Chapman & Hall/CRC 2006 ISBN:158488472X
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Lectures and oral presentations  (143)：
  • SARS-CoV-2タンパク質のオリゴマー化を阻害する薬剤候補分子の探索
    (新型コロナウイルス感染症対応HPCI臨時課題の最前線 2020)
  • PaCS-MDによるタンパク質-タンパク質複合体の解離シミュレーション
    (第9回日本生物物理学会関東支部会 2020)
  • PaCS-MDによるアクトミオシンの結合解離予測
    (第9回日本生物物理学会関東支部会 2020)
  • 長時間ダイナミクス法と 標的分子ネットワーク
    (第7回 重点課題1ワークショップ 2020)
  • 計算で予測するタンパク質複合体立体構造と結合親和性
    (第7回 生命理工オープンイノベーションハブ(LiHub)フォーラム -メゾスケール分子と創薬- 2019)
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Works (20)：
  • eePaCS-MD (Edge expansion parallel cascade selection molecular dynamics)
    Kenichiro Takaba, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao 2020 -
  • a/dPaCS-MD (association and dissociation PaCS-MD)
    Duy Phuoc Tran, Akio Kitao 2020 -
  • evERdock BAI (Machine-learning-guided selection of protein-protein complex structure)
    Kei Terayama, Ai Shinbu, Koji Tsuda, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao 2019 -
  • dPaCS-MD/MSM
    Duy Phuoc Tran, Akio Kitao 2019 -
  • PaCS-MD/MSM
    Duy Phuoc Tran, Kazuhiro Takemura, Kazuo Kuwata, Akio Kitao 2018 -
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Education (3)：
  • 1991 - 1993 Kyoto University Graduate School of Science Department of Chemictry Doctor Course
  • 1989 - 1991 Kyoto University Graduate School of Science Department of Chemictry Master Course
  • 1985 - 1989 Kyoto University Faculty of Science Mainly Physics and Chemistry
Professional career (3)：
  • Doctor of Science (Kyoto University)
  • Master of Science (Kyoto University)
  • Bachelor of Science (Kyoto University)
Work history (11)：
  • 2017/07 - 現在 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology Professor
  • 2016/04 - 現在 National Institutes for Quantum and Radiological Science and Technology Adjunct Researcher
  • 2017/07 - 2018/03 The University of Tokyo Institute of Molecular and Cellular Biosciences "Ishoku" Professor
  • 2007/04 - 2017/06 The University of Tokyo Institute of Molecular and Cellular Biosciences Associate Professor
  • 2005/10 - 2016/03 Japan Atomic Energy Agency Research Advisor
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Committee career (21)：
  • 2021/01 - 現在 日本シミュレーション学会 編集委員長
  • 2008 - 現在 日本蛋白質科学会 男女共同参画ワーキンググループ
  • 2023/04 - 2025/03 日本物理学会 代議員
  • 2023/04 - 2024/03 日本物理学会 領域委員会委員
  • 2023/04 - 2024/03 日本物理学会 領域12領域代表
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Association Membership(s) (10)：
Chemical Information and Computer Science The Chemical Society of Japan ,  日本化学会情報化学部会 ,  Biophysical Society ,  Protein Science Society of Japan ,  The physical Society of Japan ,  溶液化学研究会 ,  The Chemical Society of Japan ,  The biophysical Society of Japan ,  日本分子シミュレーション学会 ,  American Chemical Society
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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