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J-GLOBAL ID：200901096383316532   Update date: Mar. 07, 2024

Shimizu Mitsuhiro

Shimizu Mitsuhiro
Affiliation and department：
Meisei University School of Science and Engineering, Program in Chemistry and Life Science,Department of Interdisciplinary Science and Engineering

About Meisei University School of Science and Engineering, Program in Chemistry and Life Science,Department of Interdisciplinary Science and Engineering


Homepage URL  (1)： https://www.chem.meisei-u.ac.jp/mitsuhiro-shimizu/
Research field  (2)： Molecular biology ,  Applied molecular and cellular biology
Research keywords  (8)： protein-DNA interaction ,  gene expression ,  DNA structure ,  chromatin ,  タンパク質-DNA相互作用 ,  遺伝子発現制御 ,  DNA構造 ,  クロマチン
Research theme for competitive and other funds  (25)：
  • 2019 - 2022 HMGBタンパク質とヒストンとのインタープレイによるクロマチン動態制御機構
  • 2017 - 2020 相同組換えにおけるクロマチンでの相同鎖検索機構とその制御メカニズムの解明
  • 2014 - 2017 マイクロサテライト配列におけるヌクレオソーム形成とそのクロマチン動態
  • 2013 - 2017 クロマチンにおける相同組換えの分子機構に関する研究
  • 2009 - 2013 核内ネットワークを制御する天然変性タンパク質の機能発現
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Papers (70)：
  • Kei Kawakami, Shin-ichi Maeda, Yoshiko Tanimoto, Mitsuhiro Shimizu, Hiroaki Kato. Budding Yeast Cap Analysis of Gene Expression Dataset of Two Cell Types. Genes & Genetic Systems. 2024
  • Hiroaki Kato, Mitsuhiro Shimizu, Takeshi Urano. Asymmetric patterns of nucleosome positioning sequences in protein-coding regions. 2023
  • Hiroaki Kato, Mitsuhiro Shimizu, Takeshi Urano. Chemical map-based prediction of nucleosome positioning using the Bioconductor package nuCpos. BMC Bioinformatics. 2021. 22. 1. 322
  • Koji Katsumata, Yuichi Ichikawa, Tomohiro Fuse, Hitoshi Kurumizaka, Akio Yanagida, Takeshi Urano, Hiroaki Kato, Mitsuhiro Shimizu. Sequence-dependent nucleosome formation in trinucleotide repeats evaluated by in vivo chemical mapping. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2021. 556. 179-184
  • Tomohiro Fuse, Akio Yanagida, Mitsuhiro Shimizu. The yeast minichromosome system consisting of highly positioned nucleosomes in vivo. Biol. Pharm. Bull. 2019. 42. 2. 289-294
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MISC (11)：
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Books (7)：
  • ベーシックマスター 分子生物学(改訂2版)
    (株)オーム社 2013
  • ベーシックマスター 生化学
    オーム社 2008 ISBN:9784274206047
  • ベーシックマスター分子生物学
    2006 ISBN:4274203204
  • Chromatin alteration and gene expression control by alternative DNA structures.
    Transworld Research Network 2006 ISBN:8178952289
  • Z-DNA and Triplexes.
    1990
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Lectures and oral presentations  (14)：
  • 第82回日本生化学会大会シンポジウム「天然変性タンパク質による分子認識機構の解明を目指して」
    (クロマチンを介した転写抑制と天然変性タンパク質 2009)
  • 大阪大学蛋白質研究所セミナー:クロマチン -構造とダイナミクス-
    (ヌクレオソームポジショニングと転写制御 2008)
  • Nucleosome placement governs PHO5 expression in the yeast genome.
    (8th EMBL Transcription Meeting 2008)
  • Functional analysis of nucleosomes in PHO5 regulation in the yeast genome.
    (2008 Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting 2008)
  • 第8回日本蛋白質科学会年会 ワークショップ「構造から理解するDNA結合タンパク質の機能」
    (酵母ゲノムにおけるヌクレオソームの構造-機能解析 2008)
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Education (2)：
  • 1982 - 1987 Tokyo University of Pharmacy and Life Sciences
  • 1978 - 1982 Tokyo University of Pharmacy and Life Sciences School of Pharmacy School of Pharmacy
Professional career (1)：
  • 薬学博士 (東京薬科大学)
Work history (9)：
  • 2010/04/01 - 現在 Meisei University School of Science and Engineering, Department of Interdisciplinary Science and Engineering
  • 2018/04 - 2020/03 Meisei University
  • 2014/04 - 2018/03 Meisei University School of Science and Engineering
  • 2005/04/01 - 2010/03/31 Meisei University School of Science and Engineering
  • 1998/04/01 - 2005/03/31 Meisei University School of Science and Engineering
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Association Membership(s) (3)：
THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN ,  THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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