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J-GLOBAL ID:201201086911673008   Update date: Apr. 24, 2024

Osakabe Akihisa

オサカベ アキヒサ | Osakabe Akihisa
Affiliation and department:
Job title: 特任助教/さきがけ専任研究員
Research field  (3): Genetics ,  Structural biochemistry ,  Molecular biology
Research keywords  (7): クロマチンリモデリング ,  トランスポゾン ,  ヌクレオソーム ,  ヒストンバリアント ,  エピジェネティクス ,  クロマチン ,  染色体
Research theme for competitive and other funds  (12):
  • 2024 - 2028 植物のクロマチン調節因子CDCA7の発現調節による適応進化プロセスの探索
  • 2024 - 2027 クロマチンリモデリングを介したトランスポゾン自己同一性確立と喪失機構の解明
  • 2024 - 2026 トランスポゾン由来非ドメイン型バイオポリマーによるトランスポゾン脱抑制機構の解明
  • 2022 - 2024 両性花の可塑性を支える受精分子群の破壊と再構築
  • 2022 - 2024 Genomic dynamics underlying the plastic hermaphroditism in plants: the basis of exploratory reproductive adaptations
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Papers (48):
  • Daniela Quiroz, Satoyo Oya, Diego Lopez-Mateos, Kehan Zhao, Alice Pierce, Lissandro Ortega, Alissza Ali, Pablo Carbonell-Bejerano, Vladimir Yarov-Yarovoy, Sae Suzuki, et al. H3K4me1 recruits DNA repair proteins in plants. The Plant Cell. 2024
  • Bhagyshree Jamge, Zdravko J Lorković, Elin Axelsson, Akihisa Osakabe, Vikas Shukla, Ramesh Yelagandula, Svetlana Akimcheva, Annika Luisa Kuehn, Frédéric Berger. Histone variants shape chromatin states in Arabidopsis. eLife. 2023. 12
  • Sae Suzuki, Yuya Nakajima, Naoki Kamo, Akihisa Osakabe, Akimitsu Okamoto, Gosuke Hayashi, Hiroshi Murakami. Thiocholine-Mediated One-Pot Peptide Ligation and Desulfurization. Molecules. 2023. 28. 9. 3655-3655
  • Hanna Markusch, Philipp Michl-Holzinger, Simon Obermeyer, Claudia Thorbecke, Astrid Bruckmann, Sabrina Babl, Gernot Längst, Akihisa Osakabe, Frédéric Berger, Klaus D. Grasser. Elongation factor 1 is a component of the Arabidopsis RNA polymerase II elongation complex and associates with a subset of transcribed genes. New Phytologist. 2023. 238. 1. 113-124
  • Philipp Michl-Holzinger, Simon Obermeyer, Hanna Markusch, Alexander Pfab, Andreas Ettner, Astrid Bruckmann, Sabrina Babl, Gernot Längst, Uwe Schwartz, Andrey Tvardovskiy, et al. Phosphorylation of the FACT histone chaperone subunit SPT16 affects chromatin at RNA polymerase II transcriptional start sites in Arabidopsis. Nucleic acids research. 2022. 50. 9. 5014-5028
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MISC (14):
Books (8):
  • カレントトピックス-クロマチンリモデリング因子DDM1によるパラサイトDNAの鎮静化機構-
    羊土社 2021 ISBN:9784758125475
  • オーバーラッピングダイヌクレオソームの立体構造と形成機構
    羊土社 2017
  • ゲノムDNAを収納するクロマチンの構造基盤
    近代科学社 2017 ISBN:9784764950283
  • クロマチン構造基盤の多様性-古くて新しい動的構造体の不思議-
    2015
  • ヒストンバリアントと発がん
    2014
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Lectures and oral presentations  (21):
  • エピゲノム変異と熱刺激によるトランスポゾンの脱抑制機構
    (第41回染色体ワークショップ・第22回核ダイナミクス研究会 2024)
  • The contribution of histone variants to regulate transposon silencing and expression.
    (The 46th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2023)
  • ヒストンバリアントを介した可動性DNAの調節機構
    (第26回クロマチン代謝制御セミナー 2023)
  • DDM1機能喪失変異によるトランスポゾン脱抑制の温度依存性
    (遺伝学会第95回大会 2023)
  • DDM1 silences transposons by deposition of the histone variant H2A.W
    (International symposium on chromatin architecture: structure and function 2023)
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Education (3):
  • 2009 - 2012 Waseda University
  • 2007 - 2009 早稲田大学 大学院先進理工学研究科 電気・情報生命専攻
  • 2003 - 2007 Waseda University School of Science and Engineering
Professional career (1):
  • 博士(理学) (早稲田大学)
Work history (8):
  • 2020/11 - 現在 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 特任助教/さきがけ専任研究員
  • 2016/04 - 2020/11 Gregor Mendel Institute Postdoctoral Fellow
  • 2018/08 - 2020/07 Gregor Mendel Institute FWF Lise Meitner Postdoctoral Fellow
  • 2016/04 - 2018/03 Gregor Mendel Institute
  • 2015/04 - 2016/03 Waseda University
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Awards (5):
  • 2022/09 - 日本遺伝学会 日本遺伝学会第94回大会BP賞 遺伝子様エピゲノムを獲得したトランスポゾンの発現調節機構
  • 2022/06 - The Japanese Society for Epigenetics Mechanisms on transposon regulation by chromatin remodeling factor-mediated histone variant dynamics
  • 2015/08 - The Best Poster Award
  • 2013/11 - 第22回DNA複製・組換え・修復ワークショップ 若手研究者優秀発表賞
  • 2013/09 - 第86回日本生化学会年会 鈴木紘一メモリアル賞
Association Membership(s) (4):
日本遺伝学会 ,  日本エピジェネティクス研究会 ,  日本分子生物学会 ,  日本生化学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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