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J-GLOBAL ID：201301073435598003   Update date: Jan. 30, 2024

Araki Michihiro

アラキ ミチヒロ | Araki Michihiro
Affiliation and department：
National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition

About National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition


Research field  (2)： Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research theme for competitive and other funds  (6)：
  • 2022 - 2025 代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立
  • 2014 - 2017 酵素反応の選択性と多様性の情報解析
  • 2015 - 2016 バイオ合成パスウェイデータベース
  • 2014 - 2016 人工代謝経路のスコープの拡張
  • 2012 - 2014 人工代謝経路の設計基盤の構築
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Papers (57)：
  • Naoki Watanabe, Masaki Yamamoto, Masahiro Murata, Yuki Kuriya, Michihiro Araki. EnzymeNet: Residual Neural Networks model for Enzyme Commission number prediction. Bioinformatics Advances. 2023
  • Nanae Tanemura, Tsuyoshi Sasaki, Ryotaro Miyamoto, Jin Watanabe, Michihiro Araki, Junko Sato, Tsuyoshi Chiba. Extracting the latent needs of dementia patients and caregivers from transcribed interviews in japanese: an initial assessment of the availability of morpheme selection as input data with Z-scores in machine learning. BMC Medical Informatics and Decision Making. 2023. 23. 1
  • Agustin Martin-Morales, Masaki Yamamoto, Mai Inoue, Thien Vu, Research Dawadi, Michihiro Araki. Predicting Cardiovascular Disease Mortality: Leveraging Machine Learning for Comprehensive Assessment of Health and Nutrition Variables. Nutrients. 2023
  • Jonguk Park, Hiroto Bushita, Ayatake Nakano, Ai Hara, Hiroshi M. Ueno, NAOKI OZATO, Koji Hosomi, Hitoshi Kawashima, Yi-An Chen, Attayeb Mohsen, et al. Ramen Consumption and Gut Microbiota Diversity in Japanese Women: Cross-Sectional Data from the NEXIS Cohort Study. Microorganisms. 2023. 11. 8. 1892-1892
  • Attayeb Mohsen, Masaki Yamamoto, Agustin Martin-Morales, Daiki Watanabe, Nobuo Nishi, Takashi Nakagata, Tsukasa Yoshida, Motohiko Miyachi, Kenji Mizuguchi, Michihiro Araki. Using Explainable AI to understand frailty indicators. 2023
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MISC (41)：
  • 樋口 千洋, 櫛田 達矢, 畠中 秀樹, 長尾 知生子, 荒木 通啓, 水口 賢司. 食品オントロジーの構築. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 樋口 千洋, 櫛田 達矢, 八塚 茂, 畠中 秀樹, 長尾 知生子, 荒木 通啓, 水口 賢司. 国民健康・栄養調査食品群のオントロジー構築. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • HIGUCHI Chihiro, KUSHIDA Tatsuya, YATSUDUKA Shigeru, HATANAKA Hideki, NAGAO Chioko, ARAKI Michihiro, MIZUGUCHI Kenji. Food ontology. JSAI Technical Report, Type 2 SIG. 2021. 2021. SWO-054. 02
  • 厨 祐喜, 荒木 通啓. 代謝パスウェイ・酵素反応改変における情報解析技術の活用. ファルマシア. 2020. 56. 10. 930-934
  • 蓮沼 誠久, Christopher John Vavricka Jr., 荒木通啓. 新たに設計した代謝経路を用いた大腸菌によるアルカロイド高生産. バイオサイエンスとインダストリー. 2020. 78. 1. 32-33
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Patents (11)：
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Lectures and oral presentations  (14)：
  • 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路構築
    (日本農芸化学会2016年度大会 2016)
  • 代謝シミュレーション基盤を利用した網羅的メタボローム推定
    (日本薬学会第135年会 2015)
  • M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築
    (第37回日本分子生物学会年会 2014)
  • 時系列データを利用した遺伝子制御ネットワーク選択手法の開発
    (第3回生命医薬情報学連合大会 2014)
  • バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築
    (第3回生命医薬情報学連合大会 2014)
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Education (3)：
  • - 2001 京都大学大学院薬学研究科博士課程後期課程修了
  • - 1998 Kyoto University Graduate School of Pharmaceutical Sciences
  • - 1996 京都大学大学院薬学部卒業
Professional career (2)：
  • 修士(薬学) (京都大学)
  • 博士(薬学) (京都大学)
Work history (6)：
  • 2020/04 - 現在 National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition
  • - 2020/03 Kyoto University Graduate School of Medicine
  • - 2017/03 Kobe University Graduate School of Science, Technology and Innovation Department of Science, Technology and Innovation Associate Professor
  • - 2013/02 Kyoto University Graduate School of Pharmaceutical Sciences
  • - 2008/08 The University of Tokyo The Institute of Medical Science
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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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