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J-GLOBAL ID：201301076090415791   Update date: Apr. 16, 2024

Nakagawa So

ナカガワ ソウ | Nakagawa So
Affiliation and department：
Tokai University School of Medicine

About Tokai University School of Medicine


Job title： Associate Professor
Homepage URL  (1)： https://sites.google.com/site/sonakagawa/
Research field  (5)： Biological, health, and medical informatics ,  Virology ,  Genetics ,  Genomics ,  Evolutionary biology
Research keywords  (10)： Multigene family ,  zoonosis ,  Metagenomics ,  Viral Evolution ,  Endogenous Retrovirus ,  Retrotransposon ,  Bioinformatics ,  Retrovirus ,  Comparative Genomics ,  Molecular Evolution
Research theme for competitive and other funds  (14)：
  • 2021 - 2024 DUX4による非コードDNAの転写活性化の病理的意義の研究
  • 2020 - 2024 Studies on anti-tumor potential of symbiotic retroviruses and their therapeutic applications
  • 2020 - 2024 内在性レトロウイルス依存性の宿主因子機能と機能変更による腫瘍化
  • 2020 - 2023 哺乳類ゲノムに内在化したレトロウイルス由来の遺伝子の進化メカニズムの解明
  • 2019 - 2022 Functional analyses of endogenous retroviruses expressed in melanoma and their application in veterinary clinical practice.
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Papers (106)：
  • Kosuke Takada, Yasuko Orba, Yurie Kida, Jiaqi Wu, Chikako Ono, Yoshiharu Matsuura, So Nakagawa, Hirofumi Sawa, Tokiko Watanabe. Genes involved in the limited spread of SARS-CoV-2 in the lower respiratory airways of hamsters may be associated with adaptive evolution. Journal of Virology. 2024
  • Justine Charon, Ingrida Olendraite, Marco Forgia, Li Chuin Chong, Luke S. Hillary, Simon Roux, Anne Kupczok, Humberto Debat, Shoichi Sakaguchi, Rachid Tahzima, et al. Consensus statement from the first RdRp Summit: advancing RNA virus discovery at scale across communities. Frontiers in Virology. 2024. 4. 1371958
  • Akira Oka, Shinji Hadano, Mahoko Takahashi Ueda, So Nakagawa, Gen Komaki, Tetsuya Ando. Rare CRHR2 and GRM8 variants identified as candidate factors associated with eating disorders in Japanese patients by whole exome sequencing. Heliyon. 2024
  • Yoriyuki Konno, Keiya Uriu, Takayuki Chikata, Toru Takada, Jun-Ichi Kurita, Mahoko Takahashi Ueda, Saiful Islam, Benjy Jek Yang Tan, Jumpei Ito, Hirofumi Aso, et al. Two-step evolution of HIV-1 budding system leading to pandemic in the human population. Cell reports. 2024. 43. 2. 113697-113697
  • Izumi Kimura, Daichi Yamasoba, Hesham Nasser, Hayato Ito, Jiri Zahradnik, Jiaqi Wu, Shigeru Fujita, Keiya Uriu, Jiei Sasaki, Tomokazu Tamura, et al. Multiple mutations of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant orchestrate its virological characteristics. Journal of Virology. 2023. 97. 10. e0101123
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MISC (81)：
  • 高田光輔, 大場靖子, 木田裕里恵, 呉佳齊, 小野慎子, 小野慎子, 松浦善治, 松浦善治, 中川草, 澤洋文, et al. Genes involved in spread of SARS-CoV-2 into the lower respiratory tract may be under adaptive selection. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2023. 25th
  • 今西規, 木村亮介, 瀧靖之, 竹内光, 中川草, 安藤寿康. Prediction of human facial morphology based on genomic polymorphisms. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2023. 25th
  • 今西規, 木村亮介, 瀧靖之, 竹内光, 中川草, 安藤寿康. ゲノム多型情報を使ったヒトの顔形状の予測. 霊長類研究. 2022. Supplement
  • 上田真保子, 小野悠介, 隅山健太, 三橋里美, 三橋弘明, 中川草. 筋細胞の融合にかかわる内在性レトロウイルス由来の新規遺伝子. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2022. 24th
  • 甲斐 慎一, 松尾 禎之, 松川 志乃, 岩井 鉄平, 中川 草, Kryukov Kirill, 今西 規, 広田 喜一. MinIONを用いた迅速細菌同定システムの臨床応用への取り組み. 日本集中治療医学会雑誌. 2019. 26. Suppl. [O145-4]
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Books (27)：
  • 実験医学 2023年9月号 EVE研究に役立つデータベース
    羊土社 2023 ISBN:9784758125710
  • 実験医学 2022年4月号 新型コロナウイルスのゲノム解析
    羊土社 2022 ISBN:9784758125543
  • メタゲノムデータ解析 : 16Sも!ショットガンも!ロングリードも!菌叢解析が得意になる凄技レシピ
    羊土社 2021 ISBN:9784758122559
  • ロングリードWET&DRY解析ガイド : シークエンスをもっと自由に! : リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術 : どこでも、誰でも、今日から使える!
    羊土社 2021 ISBN:9784758122535
  • ヒト以外の遺伝子に関連する研究 新型コロナウイルスのゲノム
    (株)メディカルドゥ 2021 ISBN:9784909508126
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Lectures and oral presentations  (70)：
  • Diversity and dynamic evolution of RNA viruses revealed by massive nucleotide sequence data
    (2023)
  • SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotypes spread in Japan
    (2023)
  • NeoRdRpデータベース - 多様なRNAウイルスの同定を目指して
    (第45回 日本分子生物学会年会 2022)
  • 卵生哺乳類ゲノムに内在化したレトロウイルス由来のエンベロープタンパク質の細胞融合活性
    (第45回 日本分子生物学会年会 2022)
  • 大規模シークエンスデータ解析が明らかにするRNAウイルスの生態系
    (日本微生物生態学会 2022)
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Education (2)：
  • 2003 - 2008 Tokyo Medical and Dental University Graduate School of Biomedical Science Bioinformatics
  • 2000 - 2003 Keio University Faculty of Science and Technology Department of Applied Chemistry
Work history (7)：
  • 2022/04 - 現在 Tokai University School of Medicine Associate Professor
  • 2021/07 - 現在 National Institute of Genetics Bioinformation and DDBJ Center Specially Appointed Associate Professor
  • 2018/04 - 2022/03 Tokai University School of Medicine Junior Associate Professor
  • 2013/04 - 2018/03 Tokai University School of Medicine Assistant Professor
  • 2011/08 - 2013/03 Harvard University Department of Organismic and Evolutionary Biology Visiting Scholar
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Committee career (5)：
  • 2024/03 - 現在 Virus Evolution Associate Editor
  • 2022/07 - 現在 日本進化学会 web担当
  • 2021/05 - 現在 FEBS Open Bio Associate Editor
  • 2021/04 - 現在 Frontiers in Virology Associate Editor
  • 2020/09 - 2022/06 日本進化学会 代議員
Awards (6)：
  • 2023/09 - The Genetics Society of Japan Encouragement Award
  • 2022/10 - 公益財団法人日本デザイン振興会 グッドデザイン賞 8Kデータビジュアライゼーション [新型コロナウイルスの進化地図]
  • 2022/08 - 一般社団法人 可視化情報学会 第33期学会賞(技術賞) 新型コロナウイルスゲノム系統樹の3次元可視化
  • 2021/09 - 一般社団法人 可視化情報学会 第49回可視化情報学会シンポジウムアートコンテスト 大賞 新型コロナウイルスゲノム系統樹の3次元可視化
  • 2021/01 - 松前重義学術奨励賞
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Association Membership(s) (10)：
The Visualization Society of Japan ,  Japanese Society of Microbial Ecology ,  THE SOCIETY OF BIOSOPHIA STUDIES ,  THE JAPANESE SOCIETY FOR VIROLOGY ,  JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  THE GENETICS SOCIETY OF JAPAN ,  SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN ,  Society for Molecular Biology and Evolution ,  Japan Association for Omics-baced Medicine
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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