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J-GLOBAL ID：201401028513268700   Update date: Feb. 01, 2024

YOSHIDA Ryo

ヨシダ リョウ | YOSHIDA Ryo
Affiliation and department：
Research Organization of Information and Systems The Institute of Statistical Mathematics

About Research Organization of Information and Systems The Institute of Statistical Mathematics


Job title： Professor
Homepage URL  (2)： http://spacier.ism.ac.jp/ ,  http://spacier.ism.ac.jp/en/
Research field  (4)： Inorganic compounds/materials chemistry ,  Polymer chemistry ,  Intelligent informatics ,  Statistical science
Research keywords  (7)： Material Property Database ,  Quasicrystal ,  Polymeric Materials ,  Bayesian inference ,  Bioinformatics ,  Materials Informatics ,  Machine Learning
Research theme for competitive and other funds  (32)：
  • 2023 - 2029 分子・情報技術の創発による液相分離の限界突破と社会実装
  • 2022 - 2028 フェイゾンエンジニアリング:構造タイル組み換えに基づく新物質創製
  • 2019 - 2024 Hypermaterials: Inovation of materials science in hyper space
  • 2019 - 2024 Hypermaterials informatics and the search for hidden orders
  • 2019 - 2024 Discovery of innovative functional materials using state-of-the-art machine learning
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Papers (74)：
  • Minoru Kusaba, Yoshihiro Hayashi, Chang Liu, Araki Wakiuchi, Ryo Yoshida. Representation of materials by kernel mean embedding. Physical Review B. 2023. 108. 13
  • Chang Liu, Koichi Kitahara, Asuka Ishikawa, Takanobu Hiroto, Alok Singh, Erina Fujita, Yukari Katsura, Yuki Inada, Ryuji Tamura, Kaoru Kimura, et al. Quasicrystals predicted and discovered by machine learning. Physical Review Materials. 2023. 7. 9
  • Mitsuru Ohno, Yoshihiro Hayashi, Qi Zhang, Yu Kaneko, Ryo Yoshida. SMiPoly: Generation of a Synthesizable Polymer Virtual Library Using Rule-Based Polymerization Reactions. Journal of Chemical Information and Modeling. 2023. 63. 17. 5539-5548
  • Yuta Aoki, Stephen Wu, Teruki Tsurimoto, Yoshihiro Hayashi, Shunya Minami, Okubo Tadamichi, Kazuya Shiratori, Ryo Yoshida. Multitask Machine Learning to Predict Polymer-Solvent Miscibility Using Flory-Huggins Interaction Parameters. Macromolecules. 2023
  • Qi Zhang, Chang Liu, Stephen Wu, Yoshihiro Hayashi, Ryo Yoshida. A Bayesian method for concurrently designing molecules and synthetic reaction networks. Science and Technology of Advanced Materials: Methods. 2023. 3. 1
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MISC (24)：
  • Ohno M, Hayashi Y, Zhang Q, Kaneko Y, Yoshida R. SMiPoly: Generation of Synthesizable Polymer Virtual Library using Rule-based Polymerization Reactions. ChemRxiv. 2023
  • Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Daiki Nagata, Manami Kanamori, Moon Sun Jang, Koyo Kuze, Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, et al. Deducing ensemble dynamics and information flow from the whole-brain imaging data. bioRxiv. 2022
  • Shunya Minami, Kenji Fukumizu, Yoshihiro Hayashi, Ryo Yoshida. Transfer learning with affine model transformation. arXiv preprint. 2022. abs/2210.09745
  • Megumi Iwayama, Stephen Wu, Chang Liu, Ryo Yoshida. Functional Output Regression for Machine Learning in Materials Science. ChemRxiv. 2022
  • Yoshihiro Hayashi, Junichiro Shiomi, Junko Morikawa, Ryo Yoshida. RadonPy: Automated Physical Property Calculation using All-atom Classical Molecular Dynamics Simulations for Polymer Informatics. arXiv preprint. 2022
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Books (2)：
  • マテリアルズインフォマティクス = Materials informatics
    共立出版 2022 ISBN:9784320072022
  • データ同化入門-次世代のシミュレーション技術-
    2011
Lectures and oral presentations  (173)：
  • データ駆動型材料研究における実験・シミュレーション・機械学習の融合
    (統計数学×情報×物質セミナー 2023)
  • 機械学習による材料の予測・理解・発見:高分子材料・準結晶研究への応用事例
    (2023年度公益社団法人日本金属学会関東支部講習会 「機械学習と金属工学:最新動向と材料開発への応用」, 2023)
  • 機械学習による物質の予測・理解・発見
    (ipi - ダイキン シンポジウム 2023)
  • マテリアルズインフォマティクスと材料開発の未来
    (10thシンポジウム〜データサイエンスの最前線 2023)
  • 高分子材料研究における実験・シミュレーション・機械学習の協奏
    (NEDOプロジェクトを核とした人材育成、産学連携等の総合的展開/データ駆動型材料設計利用技術者養成に係る特別講座 2023)
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Works (6)：
  • RadonPy: Automated Physical Property Calculation using All-atom Classical Molecular Dynamics Simulations for Polymer Informatics
    2022 - 現在
  • XenonPy: Python library for materials informatics
    - 現在
  • アフィン転移学習
  • 結晶構造予測プログラムCSPML
  • 関数出力変数カーネル回帰
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Professional career (1)：
  • Ph.D. (The Graduate University for Advanced Studies)
Work history (12)：
  • 2018/04 - 現在 Nagoya University Graduate School of Medicine Visiting Professor
  • 2018/04 - 現在 The Graduate University for Advanced Studies School of Multidisciplinary Sciences, Department of Statistical Science Professor
  • 2018/04 - 現在 The Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems Professor
  • 2017/07 - 現在 The Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems Data Science Center for Creative Design and Manufacturing Director
  • 2015/10 - 現在 National Institute for Materials Science Visiting Research Fellow
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Committee career (10)：
  • 2023/10 - 現在 JST ACT-X「トランススケールな理解で切り拓く革新的マテリアル」 領域アドバイザー
  • 2022/04 - 現在 文部科学省 データ創出・活用型マテリアル研究開発プロジェクト プログラム運営委員会 専門委員
  • 2021/04 - 現在 高度情報科学技術研究機構(RIST) 利用研究課題審査委員会 委員
  • 2021/04 - 現在 文部科学省「次世代計算基盤に係るシステム検討ワーキンググループ」 委員
  • 2021/04 - 現在 JST-CREST「データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新」バイオDX領域 アドバイザー
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Awards (5)：
  • 2021/12 - 第44回 ケモインフォマティクス討論会 優秀発表賞 ベイズ推論を用いた高潜熱蓄冷材向け分子探索
  • 2017/09 - 第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2017,主催:日本バイオインフォマティクス学会) 研究奨励賞 Inverse prediction for transcription elongation rates with total RNA sequencing
  • 2016/10 - 第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2016,主催:日本バイオインフォマティクス学会) 研究奨励賞 Bayesian design of bioactive molecules with a chemical language model
  • 2016/10 - 第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2016,主催:日本バイオインフォマティクス学会) 研究奨励賞 Whole brain imaging of Caenorhabditis elegans × machine learning
  • 2008/12 - The 19th International Conference on Genome Informatics (GIW2008) Finalist Best Paper Award Predicting differences in gene regulatory systems by state space models
Association Membership(s) (2)：
Japanese Society for Bioinformatics ,  The Japan Statistical Society
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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