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J-GLOBAL ID:201410066109774638   Research Resource code:NBDC00698 Update date:Sep. 28, 2023

Tandem Repeats Database

Tandem Repeats Database
Owning Organization:
  • Boston University
Resource classification: Data,Database
Tag (subject)  (1): Genetic variation
Tag (data type)  (1): Sequence
Species (28): Anopheles gambiae (NCBI Taxonomy ID: 7165) ,  Apis mellifera (NCBI Taxonomy ID: 7460) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Caenorhabditis briggsae (NCBI Taxonomy ID: 6238) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Corythoichthys intestinalis (NCBI Taxonomy ID: 161448) ,  Canis lupus familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Drosophila mojavensis (NCBI Taxonomy ID: 7230) ,  Drosophila pseudoobscura (NCBI Taxonomy ID: 7237) ,  Drosophila persimilis (NCBI Taxonomy ID: 7245) ,  Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Fugu rubripes (NCBI Taxonomy ID: 31033) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Oryzias latipes (NCBI Taxonomy ID: 8090) ,  Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Rhetus (NCBI Taxonomy ID: 419719) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) ,  Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) ,  Tetraodon (NCBI Taxonomy ID: 47144) ,  Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)
Overview:
TRDB is a database of repeated genetic sequences. Users can query repeat sequences, use an analysis tool to find repeats in a query sequence, design primers, analyze mutations and origins of repeated sequences, and download several data types. Login required.
Source: NBDC
Record maintainer: Integbio Database Catalog
Record license: Creative Commons CC0 license

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