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J-GLOBAL ID：201601007961419539   Update date: May. 25, 2023

Osato Naoki

オオサト ナオキ | Osato Naoki
Affiliation and department：
Waseda University Research Institute for Science and Engineering

About Waseda University Research Institute for Science and Engineering


Research field  (2)： Systems genomics ,  Biological, health, and medical informatics
Research keywords  (19)： Non-coding DNA ,  Insulator ,  Enhancer ,  Deep learning ,  Biochemistry ,  Molecular biology ,  Informatics ,  Statistics ,  Genome science ,  Computational biology ,  Bioinformatics ,  Chromatin interaction ,  Sense-antisense mRNA ,  Non-protein-coding RNA ,  Epigenome ,  Transcription factor ,  Gene expression ,  Regulation of gene expression ,  Transcriptional regulation
Research theme for competitive and other funds  (6)：
  • 2022 - 2024 深層学習による遺伝子発現制御ネットワーク解析技術の開発
  • 2021 - 2022 エンハンサーに関わるDNA配列と遺伝子発現に影響する転写因子の網羅的な探索
  • 2021 - 2022 深層学習による生物実験データ解析法と研究仮説検証法の開発
  • 2020 - 2021 遺伝子転写制御のゲノムワイドな予測法の開発
  • 2009 - 2010 線虫のゲノムワイドな転写制御ネットワーク解析
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Papers (33)：
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Books (10)：
  • Topics 機械学習による遺伝子転写制御に関わる因子の探索
    月刊細胞, ニューサイエンス社 2022
  • Topics 実験データ解析と機械学習による転写制御因子の探索、特集 エピトランスクリプトミクス
    月刊細胞、ニューサイエンス社 2021
  • Topics 実験データ解析による転写制御因子の探索、特集 ゲノムデータを駆使した医学研究
    月刊細胞、ニューサイエンス社 2021
  • ヒトのエンハンサーと遺伝子相互作用や転写制御に影響する方向性のある転写因子DNA結合配列の解析法の開発
    情報処理学会研究報告 Vol.2021-BIO-67 No.6 2021
  • ヒトのエンハンサーと遺伝子相互作用や転写制御に影響する方向性のある転写因子DNA結合配列の解析法の開発
    情報処理学会研究報告 Vol.2021-BIO-68 No.2 2021
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Lectures and oral presentations  (122)：
  • Systematic discovery of regulatory motifs associated with an insulator function for human enhancer-promoter interactions
    (ERATO International Symposium on Chromatin Architecture: Structure and Function 2023)
  • ヒト遺伝子発現制御のインシュレータ機能に関わる転写因子の予測と発見
    (第45回日本分子生物学会年会 2022)
  • ヒト遺伝子発現制御のインシュレータ機能に関わる転写因子の予測と発見
    (第45回日本分子生物学会年会 2022)
  • ヒト遺伝子発現制御のインシュレータ機能に関わる転写因子の予測と発見
    (日本遺伝学会第94回大会 2022)
  • Systematic discovery of regulatory motifs associated with the insulator function of human enhancer-promoter interactions
    (2022)
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Awards (2)：
  • 2018/08 - Information Processing Society of Japan IPSJ Yamashita SIG Research Award Characteristic of functional enrichment of putative transcriptional target genes and its application
  • 2018/05 - Information Processing Society of Japan, Bioinformatics and Genomics(BIO) SIGBIO Excellent Presentation Award Characteristics of functional enrichement of putative transcriptional target genes and its application
Association Membership(s) (8)：
(資格)JDLA Deep Learning for Engineer 2023#1 ,  (資格)バイオインフォマティクス技術者認定試験 ,  (資格)JDLA Deep Learning for General 2022#3 ,  International Society of Computational Biology ,  INFORMATION PROCESSING SOCIETY OF JAPAN ,  THE GENETICS SOCIETY OF JAPAN ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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