- 2023 - 2024 感染症対策強化に向けた高感度・迅速な呼吸器系ウイルス病原体遺伝子の網羅的解析法及び検出法の開発に関する研究
- 2023 - 粘膜抗体による呼吸器ウイルス感染症のウイルス排出制御に資する基盤技術創出研究
- 2020 - 2023 新興呼吸器ウイルス感染症の迅速診断法の改良及び実用化に関する研究
- 2021 - 2022 新型コロナワクチン等の有効性及び安全性の評価体制の構築に向けた研究
- 2021 - ワクチンで予防可能な疾病のサーベイランス及びワクチン効果の評価に関する研究
- 2017 - 2020 新型インフルエンザ等、新興ウイルス性呼吸器感染症等の診断機能向上のための研究
- 2020 - 新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の診断法開発に資する研究
- 2019 - 病原体ゲノミクスを基盤とした病原体検索システムの利活用に係る研究
- 2017 - 2019 迅速・網羅的病原体ゲノム解析法の開発及び感染症危機管理体制の構築に資する研究
- 2016 - 2017 迅速・網羅的病原体ゲノム解析法の開発及び感染症危機管理体制の構築に資する研究
- 2015 - 2017 感染症の診断機能向上のための研究
- 2014 - 2017 川崎病患児・急性期便から分離された新規レンサ球菌のゲノム解読と病原性解析
- 2014 - 2015 感染症の診断機能向上のための研究
- 2012 - 2014 網羅的ロタウイルス分子疫学基盤構築とワクチン評価
- 2011 - 2014 感染症の予防、診断・治療又は医療水準の向上のための臨床的研究
- 2009 - 2010 再生医療・細胞医療製剤に汎用可能な新規微量高感度品質管理・安全性検証システムの開発と製剤の規格化に関する研究
- 2007 - 2008 微生物の網羅的検出方法を用いた川崎病の原因病原体の検索
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