- 2021 - 2031 海洋生物多様性ビッグデータ汎用化の基盤技術と海の豊かさを守る応用技術の開発
- 2022 - 2027 Dynamic β-Maxentによる生物多様性予測とそのアプリケーション実装
- 2021 - 2024 森林の生物多様性の分布形成機構の解明に基づく気候変動に適応的な保護区の提示
- 2020 - 2024 生物の系統・全ゲノム情報を利用した貿易を通じた種多様性・固有性評価に関する研究
- 2020 - 2023 新生代の木本植物多様性の緯度勾配動態:気候変動と気候ニッチに基づくメカニズム解明
- 2017 - 2022 汎用型離散最適化システムの構築による拡散移動を伴う森林生態系サービスの経済評価
- 2018 - 2020 環境変動に対する生物多様性と生態系サービスの応答を考慮した国土の適応的保全計画
- 2016 - 2020 太平洋イシサンゴ類の保全生物地理学:系統分類バイアスを考慮した群集形成機構の解明
- 2017 - 2019 自然史ビッグデータ科学:生物多様性情報を駆使した進化生態学的一般理論の探求
- 2015 - 2018 東アジア島嶼の植物多様性の起源と維持:群集形成プロセスの階層的作用機構を探る
- 2015 - 2018 亜熱帯林における群集形成プロセスの空間変異に着目した伐採インパクト評価
- 2015 - 2018 ニッチ適応と非平衡性に基づく中立理論の拡張と保全生態学への適用
- 2014 - 2017 大規模時空間情報の階層構造分析のためのプラットフォーム構築とその応用
- 2015 - 2017 生態学的ビッグデータを基盤とした生物多様性パターンの予測と自然公園の実効力評価
- 2014 - 2016 海洋生物多様性の進化生態学的形成プロセスと保全に関する国際共同研究
- 2012 - 2014 多目的最適化アルゴリズムを用いた自然保護区の空間配置分析ツールの開発
- 2010 - 2014 環北方域の針葉樹林の衰退機構と適応的森林資源管理
- 2009 - 2012 地球温暖化に伴う台風強大化が島嶼生態系の機能と生物多様性に及ぼす影響評価
- 2010 - 2011 空間版コアレセント理論を用いた群集集合の形成機構の解明
- 2006 - 2007 北方林における攪乱体制変化が生態系機能に及ぼす影響評価とそのメカニズム解明
- 2000 - 2001 亜熱帯域林木群集の初期更新動態に基づく植生帯移行メカニズムに関する研究
- 1998 - 1999 北方森林群集における空間構造のダイナミクスとその時系列変動
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