渡邉博文

ワタナベヒロフミ | Watanabe Hirofumi

所属機関・部署：

研究分野 (1件)：生命、健康、医療情報学

研究キーワード (7件)：ベイズ統計 , 分子動力学 , 溶媒効果 , 分子シミュレーション , ケモインフォマティクス , インシリコ創薬 , フラグメント分子軌道法

論文 (44件)：

Makoto Ikejo, Hirofumi Watanabe, Kohei Shimamura, Shigenori Tanaka. Improvement of the Force Field for β-d-Glucose with Machine Learning. Molecules (Basel, Switzerland). 2021. 26. 21
Chiduru Watanabe, Hirofumi Watanabe, Yoshio Okiyama, Daisuke Takaya. Development of an Automated FMO Calculation Protocol to Construction of FMO Database. Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method. 2021. 183-203
Yosuke Suzuki, Hirofumi Watanabe, Yoshio Okiyama, Kuniyoshi Ebina, Shigenori Tanaka. Comparative study on model parameter evaluations for the energy transfer dynamics in Fenna-Matthews-Olson complex. Chemical Physics. 2020. 539. 110903-110903
Esaki Tsuyoshi, Shimada Tomohiro, Ikeda Kazuyoshi, Kumazawa Keiko, Takahashi Kazutoshi, Watanabe Reiko, Masuda Tomohide, Watanabe Hirofumi, Shimizu Yugo, Okada Akitoshi, et al. Open Innovation Platform using Cloud-based Applications and Collaborative Space: A Case Study of Solubility Prediction Model Development. CBIジャーナル. 2020. 20. 0. 5-18
Fumiyuki Shirai, Takeshi Tsumura, Yoko Yashiroda, Hitomi Yuki, Hideaki Niwa, Shin Sato, Tsubasa Chikada, Yasuko Koda, Kenichi Washizuka, Nobuko Yoshimoto, et al. Discovery of Novel Spiroindoline Derivatives as Selective Tankyrase Inhibitors. Journal of medicinal chemistry. 2019. 62. 7. 3407-3427

MISC (25件)：

丸山正, 嶋根康弘, 岩沢美佐子, 秦田勇二, 吉田尊雄, 高木善弘, 大石和恵, 田中成典, 渡邉博文, 徐逢祺, et al. フラグメント分子軌道法の生物間相互作用解析 : ウイルスの受容体への結合特異性解析への応用. Annual report of the earth simulator. 2016. 251-257
福澤薫, 渡邉千鶴, 沖山佳生, 渡邉博文, 本間光貴, 望月祐志, 田中成典. フラグメント分子軌道法のインシリコ創薬への応用. 日本化学会講演予稿集. 2015. 95th. 2. 232
幸瞳, 渡邉博文, 本間光貴. 第1章構造解析のための先端技術の高度化 6.分子動力学シミュレーションの医薬品設計への応用. 実験医学. 2014. 32. 10
WATANABE Chiduru, WATANABE Hirofumi, FUKUZAWA Kaori, OKIYAMA Yoshio, MOCHIZUKI Yuji, PARKER Lorien J, YUKI Hitomi, HONMA Teruki. Prediction of activity cliff among Pim1 inhibitors using FMO and MM-PBSA calculations. CBI学会大会. 2014. 2014. 24
Miki Nakano, Hirofumi Watanabe, Stuart M. Rothstein, Shigenori Tanaka. Comparative Characterization of Short Monomeric Polyglutamine Peptides by Replica Exchange Molecular Dynamics Simulation (vol 114, pg 7056, 2010). JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B. 2010. 114. 31. 10234-10234

特許 (1件)：

書籍 (3件)：

Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method
2021
実験医学増刊 Vol.32 No.10 構造生命科学で何がわかるのか,何ができるのか〜最先端のタンパク質解析技術から構造情報の活用事例,創薬展開まで (実験医学増刊 Vol. 32-10)
羊土社 2014 ISBN:4758103399
Amberによる生体高分子シミュレーション入門
サイエンスハウス 2011 ISBN:486281008X

講演・口頭発表等 (40件)：

フラグメント分子軌道法のインシリコ創薬への応用
(日本化学会講演予稿集 2015)
量子化学計算による相互作用エネルギーの空間分布と PDB 中リガンド原子の空間分布の解析
(CBI学会2014年大会フォーカストセッション 2014)
Prediction of activity cliff among Pim1 inhibitors using FMO and MM-PBSA calculations
(CBI学会大会 2014)
Development of Substituent Conversion Database and Searching System Based on ChEMBLdb for Medicinal Chemists
(情報計算化学生物学会大会予稿集 2011)
21aEF-6 リガンドに依存した核内受容体の構造変化に対する線型応答理論による解析(21aEF 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
(日本物理学会講演概要集 2010)

学位 (1件)：

委員歴 (4件)：

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渡邉 博文