研究者
J-GLOBAL ID：200901024871559397   更新日: 2024年01月30日

酒井 義文

サカイ ヨシフミ | Sakai Yoshifumi
所属機関・部署：
東北大学 大学院農学研究科・農学部 生物産業創成科学専攻 生物産業情報科学講座 海洋生命遺伝情報システム学

東北大学 大学院農学研究科・農学部 生物産業創成科学専攻 生物産業情報科学講座 海洋生命遺伝情報システム学 について


職名： 准教授
ホームページURL (1件)： https://www.agri.tohoku.ac.jp/marine/
研究分野 (1件)： 情報学基礎論
研究キーワード (2件)： アルゴリズム ,  計算機科学
競争的資金等の研究課題 (6件)：
  • 2017 - 2021 変態発生制御のシグナル回路と形態異常感受性に関する研究
  • 2014 - 2017 次世代技術を活用した異体類体色の左右差形成の分子ネットワークへのアプローチ
  • 2013 - 2017 長期間の低線量放射線被曝が魚類に及ぼす遺伝的影響に関する研究
  • 2013 - 2016 ゲノミクス情報を活用して性格の個体差を生みだす魚類の性質制御遺伝子を同定する試み
  • 2010 - 2012 配列アラインメントを高速に求めるための前処理に関する研究
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論文 (69件)：
  • Yoshifumi Sakai, Shunsuke Inenaga. A Faster Reduction of the Dynamic Time Warping Distance to the Longest Increasing Subsequence Length. Algorithmica. 2022. 84. 9. 2581-2596
  • Yoshifumi Sakai. A data structure for substring-substring LCS length queries. Theoretical Computer Science. 2022. 911. 41-54
  • Jahidul Islam, Masae Tanimizu, Yu Shimizu, Yoshiaki Goto, Natsuki Ohtani, Kentaro Sugiyama, Eriko Tatezaki, Masumi Sato, Eiji Makino, Toru Shimada, et al. Development of a rational framework for the therapeutic efficacy of fecal microbiota transplantation for calf diarrhea treatment. Microbiome. 2022. 10. 1
  • Katsuki Usami, Kanae Niimi, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshifumi Sakai, Shintaro Sato, Kohtaro Fujihashi, Hiroshi Kiyono, Saeka Uchino, Mutsumi Furukawa, et al. The gut microbiota induces Peyer’s-patch-dependent secretion of maternal IgA into milk. Cell Reports. 2021. 36. 10. 109655-109655
  • Yoshifumi Sakai, Shunsuke Inenaga. A Reduction of the Dynamic Time Warping Distance to the Longest Increasing Subsequence Length. 31st International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2020), Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs). 2020. 181. 6:1-6:16
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MISC (16件)：
  • 酒井 義文. 部分文字列最大密度索引 (理論計算機科学の新展開). 数理解析研究所講究録. 2013. 1849. 18-21
  • 酒井 義文. 海草全単射の漸減構築 (アルゴリズムと計算理論の新展開). 数理解析研究所講究録. 2012. 1799. 60-64
  • 酒井 義文. 最長共通部分配列計算における run 長の対数時間寄与 (計算機科学とアルゴリズムの数理的基礎とその応用). 数理解析研究所講究録. 2011. 1744. 107-114
  • 上原 稔, Nnobuyoshi Sato, Minoru Udagawa, Yoshifumi Sakai, 森 秀樹. Reliability of a Distributed Search Engine for Fresh Information Retrieval. NEW HORIZONS OF PARALLEL AND DISTRIBUTED COMPUTING, Springer. 2005. 203-216
  • 佐藤永欣, 上原 稔, 酒井 義文. 新鮮情報検索における情報の新鮮さにもとづくスコア計算. マルチメディア通信と分散処理ワークショップ論文集. 2004. 2004. 15. 239-244
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講演・口頭発表等 (10件)：
  • 部分文字列最大密度索引
    (2012年冬のLAシンポジウム 2013)
  • run長符号化文字列の最強共通部分列計算
    (2012年夏のLAシンポジウム 2012)
  • 海藻全単射の漸減構築
    (2011年冬のLAシンポジウム 2012)
  • 緩い類似税判定基準のもとでの特徴文字列問題アルゴリズム
    (2011年夏のLAシンポジウム 2011)
  • 最長共通部分も配列計算におけるrun長の対数時間寄与
    (2010年冬のLAシンポジウム 2011)
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学位 (2件)：
  • 博士(情報科学) (東北大学)
  • 修士(工学) (東北大学)
所属学会 (2件)：
情報処理学会 ,  電子情報通信学会
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