研究者
J-GLOBAL ID:200901034194227400   更新日: 2024年04月24日

長田 直樹

オサダ ナオキ | Osada Naoki
所属機関・部署:
職名: 准教授
ホームページURL (1件): https://sites.google.com/view/nosada17/
研究分野 (4件): システムゲノム科学 ,  ゲノム生物学 ,  多様性生物学、分類学 ,  進化生物学
研究キーワード (17件): 遺伝子重複 ,  遺伝子発現調節 ,  再編 ,  カニクイザル ,  CXCL1L ,  ケモカイン ,  偽遺伝子 ,  ゲノム進化 ,  翻訳 ,  CXCL1 ,  グノム ,  種分化 ,  生態学 ,  霊長類 ,  進化 ,  遺伝学 ,  遺伝子交流
競争的資金等の研究課題 (14件):
  • 2023 - 2028 先史人類による人為的環境形成(動物相)に関する研究
  • 2023 - 2028 日本列島域における先史人類史の総合的復元方法の研究
  • 2022 - 2026 ヒトゲノム中に多型的に存在するウイルス様配列の大規模探索と集団ゲノム解析
  • 2023 - 2026 種内数千ゲノム比較によるピンポイント適応変異数千の検出
  • 2022 - 2025 血中exosome内circRNA発現解析による膵癌の診断・予後関連マーカー探索
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論文 (92件):
  • Zhenxin Fan, Rusong Zhang, Anbo Zhou, Jody Hey, Yang Song, Naoki Osada, Yuzuru Hamada, Bisong Yue, Jinchuan Xing, Jing Li. Genomic Evidence for the Complex Evolutionary History of Macaques (Genus Macaca). Journal of Molecular Evolution. 2024
  • Kazumichi Fujiwara, Shunpei Kubo, Toshinori Endo, Toyoyuki Takada, Toshihiko Shiroishi, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Inference of selective forces on house mouse genomes during secondary contact in East Asia. Genome Research. 2024
  • Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Exploring The Interplay Between Scoring Functions and Physico-chemical Properties in Antibody-antigen Docking. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 10-17
  • Satoshi D. Ohdachi, Kazumichi Fujiwara, Chandra Shekhar, Nguyn Trưng Sơn, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Phylogenetics and Population Genetics of the Asian House Shrew, Suncus murinus-S. montanus Species Complex, Inferred From Whole-Genome and Mitochondrial DNA Sequences, with Special Reference to the Ryukyu Archipelago, Japan. Zoological Science. 2024. 41. 2
  • Kaisa Thorell, Zilia Y. Muñoz-Ramírez, Difei Wang, Santiago Sandoval-Motta, Rajiv Boscolo Agostini, Silvia Ghirotto, Roberto C. Torres, Judith Romero-Gallo, Uma Krishna, Richard M. Peek, et al. The Helicobacter pylori Genome Project: insights into H. pylori population structure from analysis of a worldwide collection of complete genomes. Nature Communications. 2023. 14. 1
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MISC (42件):
  • 長田直樹. ソフトウェア紹介13:SLiM-前向きシミュレーターについて. Yaponesian. 2022. 4. はる. 12-13
  • 長田 直樹. 最先端医療の今 ヤポネシア人の人口・歴史推定. Medical Science Digest. 2021. 47. 9. 476-478
  • 東アジアから俯瞰する二重構造説. Yaponesian. 2021. 3. ふゆ
  • 長田直樹. ソフトウェア紹介9:TreeMixとqpGraph. Yaponesian. 2021. 3. はる. 37-39
  • 長田直樹. 論文紹介4:ゲノム規模の遺伝子データを用いた日本列島への人類の移動モデルの探索. Yaponesian. 2021. 3. はる. 17-21
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書籍 (7件):
  • 霊長類学の百科事典 = The encyclopedia of primatology
    丸善出版 2023 ISBN:9784621308042
  • 遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源
    丸善出版 2022 ISBN:9784621306604
  • 進化で読み解く バイオインフォマティクス入門
    森北出版 2019 ISBN:4627261411
  • ヒトは病気とともに進化した (シリーズ認知と文化)
    勁草書房 2013 ISBN:4326199458
  • 遺伝子図鑑
    悠書館 2013 ISBN:4903487792
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講演・口頭発表等 (124件):
  • Inference of population history and selective force on house mouse genomes during secondary contact in East Asia
    (SMBE Regional Meeting in Taiwan 2024)
  • ゲノムデータのQC,マッピング,バリアントコール,フィルタリング
    (第一回統合生物考古学セミナー 2023)
  • 東アジアにおいて野生ハツカネズミが辿った歴史と進化
    (第33回モロシヌス研究会 2023)
  • ほぼ中立説と弱有害変異について-霊長類・げっ歯類ゲノム研究の視点から
    (日本遺伝学会第95回大会 2023)
  • 人類の移動に伴う小型げっ歯類の拡散と進化
    (日本進化学会第25回沖縄大会 2023)
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学歴 (2件):
  • 1997 - 2002 東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻
  • 1993 - 1997 東京大学 理学部 生物学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (東京大学)
経歴 (11件):
  • 2019/04 - 現在 北海道大学 大学院情報科学研究院 准教授
  • 2012/05 - 現在 放射線医科学総合研究所 客員研究員
  • 2017/09 - 2021/03 北海道大学 国際連携研究教育局 准教授
  • 2015/04 - 2019/03 北海道大学 大学院情報科学研究科 准教授
  • 2010/01 - 2015/03 国立遺伝学研究所・総合研究大学院大学 助教
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委員歴 (19件):
  • 2023/04 - 2025/03 日本遺伝学会 評議員
  • 2022/07 - 2024/06 日本進化学会 代議員
  • 2020/01 - 2020/12 文部科学省 科研費専門委員会委員
  • 2019/01 - 2020/12 日本遺伝学会 評議員
  • 2018/08 - 2019/08 第21回日本進化学会大会 大会準備委員長
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受賞 (3件):
  • 2019/07 - 日本学術振興会 特別研究員等審査会専門委員(書面担当)の表彰
  • 2014/09 - 日本遺伝学会 日本遺伝学会奨励賞 ゲノム情報と進化理論の統合による進化機構の解明
  • 2007/10 - 日本遺伝学会 ベストペーパー賞 On the correlation between gene expression pattern and selection intensity in the human genome
所属学会 (7件):
生き物文化誌学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本人類学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本霊長類学会 ,  日本進化学会 ,  日本遺伝学会
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