- 2022 - 2026 縄文時代中期から後・晩期への社会変動に関する考古学とDNA分析の共同研究
- 2018 - 2022 縄文時代の氏族制社会の成立に関する考古学と集団遺伝学の共同研究
- 2018 - 2021 縄文時代の氏族制社会の成立に関する考古学と集団遺伝学の共同研究
- 2014 - 2017 民族誌から読み解く土器型式変化の理論的研究
- 2011 - 2014 民族誌を用いた土器型式の動態把握のための理論的研究
- 2010 - 2014 完新世の気候変動と縄紋文化の変化
- 2011 - 2014 文明移動としての「仏教」からみた東アジアの差異と共生の研究
- 2012 - 共同研究 国立歴史民俗博物館 先史時代における社会複雑化・地域多様化の研究
- 2007 - 2009 文部科学省委託事業 埋蔵文化財調査士の養成および資格授与のための埋蔵文化財科学実践プログラム
- 2007 - 2008 未開社会の土器生産と縄文社会の比較研究
- 2006 - 2007 環南シナ海先史時代の交流に関する基礎的研究
- 2004 - 2007 東アジア村落における水稲文化の儀礼と景観
- 2002 - 2005 古代社会の発展と都市化の比較考古学的研究
- 1998 - 2002 アジア地域文化に関する共同研究:中国
- 1992 - 2001 エジプト、アブ・シール遺跡の旧石器遺跡の研究
- 1998 - 2000 中国新彊トルファンヤールホト古墳群の総合研究
- 1997 - 2000 四川省成都盆地における巴蜀文化の研究
- 2000 - 縄文時代における堅果類利用に関する研究
- 1997 - 1999 亀ヶ岡文化における土器の文様類型と地域性に関する研究
- 1995 - 1997 エジプト・アラブ共和国アブ・シール南地区における丘陵頂部および周辺遺跡の調査
- 1997 - 岩手県名川町虚空蔵遺跡出土土器の共同研究
- 1991 - 1993 エジプト・アラブ共和国 アブ・シール地区におけるピラミッドおよび周辺遺跡の調査
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