清水顕史

シミズアキフミ | Shimizu Akifumi

所属機関・部署：
職名：准教授
ホームページURL (1件)： http://www.eonet.ne.jp/~vor-dem-gesetz/index.html

研究分野 (1件)：遺伝育種科学

研究キーワード (15件)：大量データの解析プログラミング , 発現遺伝子解析 , 遺伝解析 , ファイトレメデーション , 酸性硫酸塩土壌 , 鉄過剰害 , 低pH , リン酸欠乏 , イネ , Phytoremedation , Acid sulfate soil , Iron toxicity , low-pH , Phosphorus deficiency , Rice

競争的資金等の研究課題 (9件)：

2021 - 2024 低肥料で持続可能なイネ生産に役立つ遺伝子探索と、深層学習による新形質分類法の確立
2018 - 2021 低肥料環境の収量性限界突破に寄与するイネ遺伝子座および座間相互作用の解析
2014 - 2017 貧栄養ストレス耐性イネ品種開発のためのゲノム解析
2010 - 2012 環境保全型イネのゲノム育種に役立つ、酸性土壌ストレス耐性の遺伝子単離と機能解析
2007 - 2008 大規模EST情報からの遺伝子発現パターンを利用した有用遺伝子の探索手法の開発

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論文 (6件)：

小林優, 小山博之, 渡部敏裕, 前島恵理子, Anongnat Sriprachote, 落合久美子, 清水顕史, 近藤始彦, 飯泉佳子, 渡辺武, et al. 熱帯アジア地域の問題土壌と農業生産. 土肥誌. 2017. 88. 4. 346-351
清水顕史. IV-3 熱帯アジア地域の問題土壌と農業生産連続無施肥水田を利用した、イネ収量形質の全ゲノム関連解析(シンポジウム,2016年度佐賀大会). 日本土壌肥料学会講演要旨集. 2016. 62. 208-208
Aki Kosugi, Jun Tamaru, Kazumi Gotou, Hazuka Y. Furihata, Akifumi Shimizu, Akira Kawabe, Emiko Harada. Metal accumulation by Arabidopsis halleri subsp gemmifera at a limestone mining site. AUSTRALIAN JOURNAL OF BOTANY. 2015. 63. 1-2. 134-140
Julio Cesar, Masaru Iehisa, Akifumi Shimizu, Kazuhiro Sato, Ryo Nishijima, Kouhei Sakaguchi, Ryusuke Matsuda, Shuhei Nasuda, Shigeo Takumi. Genome-wide marker development for the wheat D genome based on single nucleotide polymorphisms identified from transcripts in the wild wheat progenitor Aegilops tauschii. Theor. Appl. Genet. 2014. 127. 261. 271
Julio Cesar, Masaru Iehisa, Akifumi Shimizu, Kazuhiro Sato, Shuhei Nasuda, Shigeo Takumi. Discovery of high-confidence SNPs from large-scale de novo analysis of leaf transcripts of Aegilops tauschii, a wild wheat progenitor. DNA Research. 2012. 19. 487-497

MISC (39件)：

Takayanagi Shu, Takagi Yuma, Shimizu Akifumi, HASEGAWA Hiroshi. The shoot is important for high-affinity, nitrate uptake in Egeria densa, a submerged vascular plant. Journal of plant research. 2012. 125. 5. 669-678
濱田和輝, 横山幸治, 土田博子, 佐野和美, 望月孝子, 大木信彦, 堀内陽子, 藤田雅丈, 渡辺正夫, 松岡信, et al. OryzaExress: イネの機能アノテーションと遺伝子発現ネットワークの統合データベース. 日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集. 2011. 2011. 0. 826-826
Kazuki Hamada, Kohei Hongo, Keita Suwabe, Akifumi Shimizu, Taishi Nagayama, Reina Abe, Shunsuke Kikuchi, Naoki Yamamoto, Takaaki Fujii, Koji Yokoyama, et al. OryzaExpress: An Integrated Database of Gene Expression Networks and Omics Annotations in Rice. PLANT AND CELL PHYSIOLOGY. 2011. 52. 2. 220-229
濱田和輝, 本郷耕平, 諏訪部圭太, 清水顕史, 長山大志, 阿部伶奈, 菊地俊介, 山本直樹, 藤井貴朗, 横山幸治, et al. OryzaExpress:イネの遺伝子発現ネットワークとオミックス情報統合データベース. 育種学研究. 2011. 13
Akifumi Shimizu, Kentaro Yano. GENE DISCOVERY METHODS FROM LARGE-SCALE GENE EXPRESSION DATA. QUANTUM BIO-INFORMATICS III: FROM QUANTUM INFORMATION TO BIO-INFORMATICS. 2010. 26. 489. 489-+

書籍 (2件)：

Proceedings of the Final International Meeting for 21th Century Center for Excellence (COE) Program, “Development of New Bioremediation Systems of Acid Sulfate Soil for Agriculture and Forestry"
SHOUKADOH Book Sellers 2008 ISBN:9784879746085
Brassicas and Legumes. From Genome Structure to Breeding . Biotechnology in Agriculture and Forestry , Vol. 52
Springer 2003 ISBN:9783540427285

学位 (1件)：

博士(農学) (京都大学)

委員歴 (1件)：

2008 - 日本育種学会幹事(2008-)

所属学会 (3件)：

近畿作物・育種研究会 , 日本土壌肥料学会 , 日本育種学会

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