研究者
J-GLOBAL ID：200901084345719960   更新日: 2024年04月19日

遠藤 俊徳

エンドウ トシノリ | Endo Toshinori
所属機関・部署：
北海道大学 情報科学研究院

北海道大学 情報科学研究院 について


職名： 教授
研究分野 (6件)： 進化生物学 ,  多様性生物学、分類学 ,  機能生物化学 ,  ゲノム生物学 ,  生物分子化学 ,  生命、健康、医療情報学
研究キーワード (5件)： 遺伝子進化と生物進化 ,  正の自然淘汰 ,  機械学習による機能予測 ,  遺伝子構造・機能 ,  情報生物学
競争的資金等の研究課題 (11件)：
  • 2018 - 2023 動植物ゲノム配列解析にもとづくヤポネシアへのヒトの移動の推定
  • 2019 - 2022 遺伝的クローンであるアリの適応的な表現型個体差を産み出す分子機構の解明
  • 2014 - 2018 多様な無脊椎動物の比較解析基盤としての比較ゲノムデータベース構築
  • 2014 - 2016 高速分子動力学法によるHCV抗ウイルス薬耐性化予測仮想アッセイシステムの構築
  • 2012 - 2014 インターメア機能配列の情報量規準と機械学習による同定および進化的解析
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論文 (46件)：
  • Kazumichi Fujiwara, Shunpei Kubo, Toshinori Endo, Toyoyuki Takada, Toshihiko Shiroishi, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Inference of selective forces on house mouse genomes during secondary contact in East Asia. Genome Research. 2024
  • Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Exploring The Interplay Between Scoring Functions and Physico-chemical Properties in Antibody-antigen Docking. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 10-17
  • So Nakagawa, Shoichi Sakaguchi, Atsushi Ogura, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo, Yoshiyuki Suzuki, Takashi Gojobori. Current trends in RNA virus detection through metatranscriptome sequencing data. FEBS open bio. 2023. 13. 6. 992-1000
  • Yi Cong, Toshinori Endo. Multi-Omics and Artificial Intelligence-Guided Drug Repositioning: Prospects, Challenges, and Lessons Learned from COVID-19. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2022. 26. 7. 361-371
  • Yi Cong, Misaki Shintani, Fuga Imanari, Naoki Osada, Toshinori Endo. A New Approach to Drug Repurposing with Two-Stage Prediction, Machine Learning, and Unsupervised Clustering of Gene Expression. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2022. 26. 6. 339-347
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MISC (27件)：
  • Sangeetha Udani Ratnayake, Toshinori Endo, Naoki Osada. Revisiting the Relationship between Evolutionary Conservation and Disease Causality: A Case Study of Beta Globin Gene. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2016. 91. 6. 345-345
  • Yasuaki Takada, Aya Takahashi, Ryutaro Miyagi, Toshinori Endo, Naoki Osada. The cause of gene expression changes in reciprocal crosses of Drosophila melanogaster by measuring allele-specific gene expression. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2016. 91. 6. 372-372
  • 安富祖仁, 峯田克彦, 遠藤俊徳. グラフを用いたタンパク質のモーション表現法の提案. 研究報告バイオ情報学(BIO). 2013. 2013. 7. 1-7
  • 安富祖仁, 峯田克彦, 遠藤俊徳. グラフを用いたタンパク質のモーション表現法の提案. 研究報告数理モデル化と問題解決(MPS). 2013. 2013. 7. 1-7
  • Liu Zheng, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo. Development of an efficient multiple sequence alignment method using GPGPU. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2013. 88. 6. 380-380
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書籍 (18件)：
  • 生物の科学 遺伝 Vol.76 No.4 特集:メンデル生誕200年記念
    エヌ・ティー・エス 2022 ISBN:486043756X
  • 遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源
    丸善出版 2022 ISBN:9784621306604
  • 改訂 遺伝単 -遺伝学用語集 対訳付き (『生物の科学 遺伝』別冊No.25)
    エヌ・ティー・エス 2021 ISBN:4860437128
  • 遺伝単-遺伝学用語集 対訳付き (生物の科学 遺伝 別冊No.22)
    エヌ・ティー・エス 2017 ISBN:4860434994
  • 分子生物学のためのバイオインフォマティクス入門 : 生物情報解析の理論とアルゴリズム
    共立出版 2001 ISBN:4320055802
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講演・口頭発表等 (1件)：
  • Evolutionary analysis of Mollicutes based on standardized phylogenetic tree
    (2013)
学歴 (3件)：
  • 1993 - 1996 総合研究大学院大学 生命科学研究科 遺伝学専攻
  • 1990 - 1993 東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻
  • 1986 - 1990 東京大学 理学部 生物化学科
学位 (2件)：
  • 博士(理学) (総合研究大学院大学)
  • Master.of Science (The University of Tokyo)
経歴 (13件)：
  • 2019/04 - 現在 北海道大学 大学院情報科学研究院 教授
  • 2016/12 - 現在 北海道大学 数理・データサイエンス教育研究センター
  • 2020/04 - 2021/03 北海道大学 大学院情報科学院 生体情報工学コース長
  • 2020/04 - 2021/03 北海道大学 大学院情報科学研究院情報科学専攻 生命人間情報科学部門長
  • 2004/04 - 2019/03 北海道大学 大学院情報科学研究科 教授
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委員歴 (15件)：
  • 2019/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 北海道地域部会長
  • 2016/12 - 現在 数理・データサイエンス教育強化拠点コンソーシアム 委員
  • 2011/04 - 現在 日本情報処理学会 バイオ情報学研究会論文誌編集委員会
  • 2011/04 - 現在 日本情報処理学会 バイオ情報学研究会運営委員会
  • 2009 - 現在 日本遺伝学会 幹事
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所属学会 (7件)：
日本バイオインフォマティクス学会 ,  生き物文化誌学会 ,  日本遺伝学会 ,  日本進化学会 ,  日本情報処理学会 ,  Society for Molecular Biology and Evolution ,  日本情報処理学会バイオ情報学研究会
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