- 2010 - 2011 天然変性部位がDNAの分解と組換えの切り替えを行う酵素の反応機構
- 2010 - 2011 自己DNA識別修復酵素の自己DNAシグナル配列認識の分子機構
- 2009 - 2010 ゲノムの高レベル進化速度に寄与する相同組換えの分子機構
- 2009 - 2010 無害な細菌が病原性遺伝子を獲得して病原細菌になることを防ぐ機構
- 2008 - 2009 ゲノムに潜む全く新しい構造と機能をもつDNaseファミリーの探索と解析
- 2007 - 2008 微生物に病原性をもたらす「病原ゲノム・アイランド」の取り込みに関与するDNA識別/排除機構の研究
- 2007 - 2008 自己ゲノムDNAを識別して修復するATP駆動モーターの一分子生化学
- 2007 - 2008 病原性薬剤耐性等の遺伝子の導入に対して細菌が備えるバリアーと細菌の生死
- 2005 - 2006 ゲノム分解・修復マシーンによる「自己」ゲノム識別の一分子可視化解析
- 2005 - 2006 ゲノム維持ナノマシン:DNA分解修復を支配するATP駆動モーターの一分子生化学
- 2005 - 2006 非自己ゲノムを分解し、自己ゲノムを修復する組換え酵素の「一分子」遺伝学
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