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J-GLOBAL ID：200902273415486748   整理番号：09A1068096

フローソーティングとDenaturing gradient gel electrophoresis(DGGE)を用いたナノプランクトン群集の栄養摂取様式解析法

著者 (8件)： 吉田典明 (東大 海洋研) ,  西村昌彦 (東大 海洋研) ,  井上雄介 (東大 海洋研) ,  吉澤晋 (東大 海洋研) ,  神谷英里子 (東大 海洋研) ,  谷口亮人 (近畿大 水族環境) ,  浜崎恒二 (東大 海洋研) ,  木暮一啓 (東大 海洋研)
資料名： 日本海洋学会大会講演要旨集
巻： 2009  号： 春季  ページ： 184  発行年： 2009年03月23日 
JST資料番号： F0701C  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 短報  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 海洋のナノプランクトン(NP)は従属栄養者のみならず,一次生産者としての機能も果たしている。それぞれの機能を持つNPの量および群集構造,さらに物質循環に対する寄与を知ることは,マイクロビアルループおよび生食食物連鎖の評価をする上で極めて重要である。しかし主に方法論的な制約のため,これまでの知見はNP全体の現存量の推定に限られている。本研究は,フローソーティングと分子的手法を組み合わせることにより,従属栄養性ナノプランクトン(HNP)と独立栄養性ナノプランクトン(ANP)のそれぞれを分取し,さらに群集構造を解析することを目指した。方法論がほぼ確立されたので,ここに報告する。具体的な手法は三つの段階からなる。第一に,海水中のNPをクロスフロー方式濃縮装置を用いて10倍以上に濃縮する。第二に,フローソーティングにより,蛍光特性の違いを利用してHNPとANPをそれぞれ分取する。第三に,それぞれの画分からDNAを抽出し,PCRで遺伝子を増幅した後に,DGGEによって群集構造を明らかにする。ここでは沿岸海水中の群集に適用した結果を示す。(著者抄録)

シソーラス用語： 従属栄養 ,  *プランクトン ,  独立栄養 ,  DNA【核酸】 ,  ソーティング ,  *蛍光特性 ,  *微小プランクトン
準シソーラス用語： *ナノプランクトン ,  *フローソーティング ,  *従属栄養性ナノプランクトン ,  *独立栄養性ナノプランクトン

分類 (2件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  プランクトン  (FH02050R)

タイトルに関連する用語 (9件)： フロー ,  ソーティング ,  Gradient ,  DGGE ,  ナノプランクトン ,  群集 ,  栄養摂取 ,  様式 ,  解析法