山本義治

ヤマモトヨシハル | Yamamoto Yoshiharu

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (3件)：

特定国立研究開発法人理化学研究所客員研究員
連合農学研究科教授
応用生物科学研究科教授

ホームページURL (1件)： http://www1.gifu-u.ac.jp/~yyy/

研究分野 (6件)：分子生物学 , 植物栄養学、土壌学 , 進化生物学 , 植物分子、生理科学 , 遺伝学 , ゲノム生物学

研究キーワード (24件)：細胞内共生 , プロモーター獲得 , アントシアニン , 共転写因子 , GWAS , 植物 , コマクチベーター , ゲノム , 強光ストレス , ナチュラルバリエーション , 集団遺伝 , 光ストレス , 光形態形成 , ルシフェラーゼ , 遺伝子発現 , マイクロアレイ , 転写 , 植物ゲノム , シロイヌナズナ , 環境応答 , 転写調節ネットワーク , 環境適応 , 局所適応 , バイオインフォマティクス

競争的資金等の研究課題 (33件)：

2022 - 2026 複合環境ストレス応答する黒米のフラボノイド生合成制御メカニズムの研究
2021 - 2024 種内ナチュラルバリエーションを用いた植物プロモーターの進化的側面の解明
2019 - 2022 有用根圏細菌処理により植物に誘導される青枯病菌排除現象の分子機構解明
2015 - 2018 植物の酸関連ストレス耐性のコアモジュールSTOP1転写制御システムの分子的理解
2012 - 2018 植物バイオマス生産高度化のための合成プロモーター作出

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論文 (99件)：

Agrahari RK, Kobayashi Y, Enomoto T, Miyachi T, Fujita M, Iuchi S, Kobayashi M, Yamamoto YY, Koyama H. STOP1-regulated SMALL AUXIN UP RNA55 (SAUR55) is involved in proton/malate co-secretion for Al tolerance in Arabidopsis. Plant Direct. 2023. 8. 1
Yingxi Chen, Kohji Nishimura, Mutsutomo Tokizawa, Yoshiharu Y. Yamamoto, Yoshito Oka, Tomonao Matsushita, Kousuke Hanada, Kazumasa Shirai, Shoji Mano, Takayuki Shimizu, et al. Cytosolic heme metabolism by alternative localization of heme oxygenase 1 in plant cells. 2023
The transcription factors, STOP1 and TCP20, are required for root system architecture alterations in response to nitrate deficiency. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2023. 120. 35
榎本拓央, 伊藤弘樹, 中野友貴, 柳瀬笑子, 渡部敏裕, 井内聖, 小林正智, 山本義治, 小山博之, 小林佑理子. 4-3-7 Al 耐性遺伝子PGIP1 の発現量ゲノムワイド関連解析によるPGIP1 発現を制御するシグナル伝達経路と遺伝子の同定(4-3 植物の有害元素 2022年度東京大会). 日本土壌肥料学会講演要旨集. 2022. 68. 55-55
Yoshiharu Y. Yamamoto. Sequence-based evaluation of promoter context for prediction of transcription start sites in Arabidopsis and rice. Scientific reports. 2022. 12. 1976

MISC (56件)：

榎本拓央, 時澤睦朋, 時澤睦朋, 伊藤弘樹, 井内聖, 小林正智, 山本義治, 小林佑理子, 小山博之. STOP1はHsfA2とGDHの転写調節を介して低酸素耐性を制御する. 日本土壌肥料学会講演要旨集(Web). 2019. 65
野元美佳, 板谷知健, 鈴木孝征, 塚越啓央, 松下智直, 時澤睦朋, 山本義治, 東山哲也, 東山哲也, SPOEL Steven, et al. サリチル酸シグナルの転写制御因子であるNPR1はMYC転写因子のターンオーバーを制御することでジャスモン酸シグナルを抑制する. 日本植物学会大会研究発表記録. 2018. 82nd
Kentaro Ifuku, Dongyi Yan, Hiroyo Nishide, Natsuko Inoue-Kashino, Yoshiharu, Y. Yamamoto, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino. Genome Analysis and Genetic Engineering in the Diatom Chaetoceros gracilis. The 73rd Fujihara Seminar International Conference "Molecular Life of Diatoms". 2017
伊福健太郎, 閻東怡, 西出浩世, 山本義治, 内山郁夫, 菓子野康浩. 実用珪藻 Chaetoceros gracilis のバイオファクトリー化に向けた基盤技術の開発. 日本農芸化学会2017年度京都大会. 2017
清水琴恵, 野元美佳, 福井大和, 板谷知健, 森毅, 時澤睦朋, 山本義治, 塚越啓央, 塚越啓央, 多田安臣, et al. 転写補助因子SNI1とNPR1によるWRKY転写因子を介したSA応答性遺伝子発現制御機構の解析. 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集. 2017. 2017

特許 (7件)：

書籍 (8件)：

H2O2-mediated biotic- and aboitic-stress responses in plants
Springer Nature 2019 ISBN:9783319953144
Redox homeostasis in plants
Springer Nature 2019
2. 予測される作物栽培問題: 2-2干ばつ、洪水環境下での作物の生産性
日本土壌肥料科学雑誌 2018
ppdb, Plant Promoter Database
Springer, Dordrecht 2016 ISBN:9781493966561
Rhizotoxic ions: “-Omics” approaches for studying abiotic stress tolerance in plants
Bentham Science Publishers 2011

講演・口頭発表等 (23件)：

低温強光UV-B応答を全て担うシロイヌナズナのシス因子機能ユニット
(第64回日本植物生理学会年会 2023)
ラボでのトランスクリプトームデータを用いた野外植物の温度応答の予測
(第64回日本植物生理学会年会 2023)
Evaluation of the promoter context in plants and trials for prediction of gene expression in the fields based on expression data in lab
(産総研北海道センターセミナー 2022)
Sequence-based evaluation of promoter context for prediction of transcriptional start sites in Arabidopsis and rice
(産総研北海道センターセミナー 2022)
シロイヌナズナの低温強光UV-B応答を全て担うシス因子機能ユニット
(日本遺伝学会第94回札幌大会 2022)

学歴 (2件)：

1989 - 1994 京都大学大学院理学研究科
1984 - 1989 京都大学理学部

学位 (1件)：

博士(理学) (京都大学)

経歴 (10件)：

2018/04 - 現在岐阜大学岐阜大学-インド工科大学グワハティ校ジョイントディグリープログラム担当教員
2013/04 - 現在岐阜大学応用生物科学部教授
2009/04 - 現在理化学研究所横浜研究所客員研究員
2009/04 - 2013/03 岐阜大学応用生物科学部准教授
2006/04 - 2009/03 名古屋大学遺伝子実験施設研究員

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委員歴 (8件)：

2023/09 - 現在 International Society of Endocytobiology (ISE) 日本支部代表
2021/05 - 現在日本光合成学会幹事
2021/04 - 現在 Journal of Genome Editing and Regulation誌雑誌編集員
2021/04 - 現在 DNA (MDPI)誌雑誌編集員
2021/04 - 現在 Frontiers in Plant Science誌雑誌編集員

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受賞 (10件)：

2018/09 - 第一回植物インフォマティクス研究会優秀発表賞塩基配列情報をもとにしたプロモーター位置の予測法の開発
2017/03 - 日本農芸化学会日本農芸化学会トピック賞実用珪藻 Chaetoceros gracilisのバイオファクトリー化に向けた基盤技術の開発
2015/03 - 日本植物病理学会学生優秀発表賞疾病防御応答の活性化による生長制御機構の解明
2014/09/10 - 日本土壌肥料学会日本土壌肥料学会ポスター賞シロイヌナズナにおけるアルミニウム及び低pH耐性のゲノムワイド関連解析
2014/09 - 日本土壌肥料学会優秀ポスター賞シロイヌナズナにおけるアルミニウム及び低pH耐性のゲノムワイド関連解析

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所属学会 (8件)：

日本光合成学会 , 国際細胞共生学会 , 日本植物生理学会 , 日本植物病理学会 , 日本光合成研究会 , 日本遺伝学会 , 日本分子生物学会 , 日本植物細胞分子生物学会

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山本 義治

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