吉沢明康

ヨシザワアキヤス | YOSHIZAWA Akiyasu C.

所属機関・部署：
職名：特任准教授

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , システムゲノム科学 , 生物物理学

研究キーワード (4件)：バイオインフォマティクス(計算生物学) , データベース , 比較ゲノム , 質量分析

競争的資金等の研究課題 (15件)：

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論文 (30件)：

Watanabe, Y, Yoshizawa, AC, Ishihama, Y, Okuda, S. The jPOST Repository as a Public Data Repository for Shotgun Proteomics. Methods in Molecular Biology. 2021. 2259. 309-322
Oka, M, Xu, L, Suzuki, T, Yoshikawa, T, Sakamoto, H, Uemura, H, Yoshizawa, AC, Suzuki, Y, Nakatsura, T, Ishihama, Y, et al. Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer. Genome Biology. 2021. 22. 9
Yamamoto, H, Hayakawa, E, Tsugawa, H, Moriya, Y, Fukusaki, E, Goto, S, Hasunuma, T, Miura, N, Yoshizawa, AC. Japan Computational Mass Spectrometry Meeting 2020 Activity Report. Journal of Proteome Data and Methods. 2020. 2. 5
Tabata, T, Yoshizawa, AC, Ishihama, Y. jPOST Tools (I): Utilities for Peak List Processing. Journal of Proteome Data and Methods. 2020. 2. 4
Vos RA, Katayama T, Mishima H, Kawano S, KawashimaS, Kim J-D, Moriya Y, Tokimatsu T, Yamaguchi A, Yamamoto Y, et al. BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research. F1000Research. 2020. 9. 136

MISC (38件)：

吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, Kaell Lukas, 石濱泰. 事後ペプチドシーケンスタグの利用によるタンパク質同定の精度向上. 電気泳動. 2019. 63. Suppl. 245-245
上村駿人, 伊藤麻里子, 吉沢明康, 杉山直幸, 石濱泰. メタプロテオミクスのためのデータ解析ワークフロー開発. 日本薬学会年会要旨集. 2018. 138年会. 2. 240-240
吉沢明康. プロテオーム・データベースの構築. 京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム研究成果報告書. 2017. 2016. 27-27
奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, et al. jPOST:プロテオーム統合データベースプロジェクト. 日本生化学会大会(Web). 2017. 90th. ROMBUNNO.3P-0171 (WEB ONLY)-0171]
吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, et al. jPOST:同定結果のFDR改善を目指す再解析プロトコルの開発. 日本生化学会大会(Web). 2017. 90th. ROMBUNNO.3P-0172 (WEB ONLY)-0172]

特許 (13件)：

書籍 (4件)：

講演・口頭発表等 (207件)：

jPOST & JPDM:プロテオームデータベースとデータ論文ジャーナル
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
メタボロームデータリポジトリMB-POSTの開発状況
(2023年度統合化推進プログラム(DICP)研究交流会 2023)
Mass++ ver.4 - An open-source MS data viewer with enhanced basic functions and easy implementation of external software
(ASMS 2023 (70th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics) 2023)
Temporal Analysis of Proteome and Phosphoproteomeof the SARS-CoV-2 Infected Cell
(第6回京都生体質量分析研究会(KBMSS)国際シンポジウム・国際質量分析イメージングシンポジウム2023京都 2023)
Mass++ ver.4 -MS data viewer meets online databases-
(Human Proteome Organization World Congress (HUPO2022) 2022)

Works (7件)：

Mass++ ver.4
Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, AC 2018 - 現在
jPOST
Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Yamanouchi, Y, Araki, N, Yoshizawa, AC, Tabata, T, Iwasaki, M, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y 2016 - 現在
Mass++ ver.2.7.4/2.7.5
Tanaka, S, Fujita,Y, Parry, H.E, Yoshizawa, AC, Morimoto, K, Murase, M, Yamada, Y, Yao, J, Utsunomiya, S, Kajihara, S, Fukuda, M, Ikawa, M, Tabata, T, Takahashi, K, Aoshima, K, Nihei, Y, Nishioka, T, Oda, Y, Tanaka, K 2014 - 現在
ProteinCarta
Yoshizawa, AC, Fukuyama, Y, Kajihara, S, Kuyama, H, Tanaka, K 2014 - 現在
KEGG OC
Nakaya, A, Katayama, T, Itoh, M, Hiranuka, K, Kawashima, S, Moriya, Y, Okuda, S, Tanaka, M, Tokimatsu, T, Yamanishi, Y, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M, Goto, S 2012 - 現在

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (14件)：

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所属学会 (5件)：

Human Proteome Organization (HUPO) , American Society for Mass Spectrometry (ASMS) , 日本生物物理学会 , 日本分子生物学会 , 日本プロテオーム学会

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吉沢 明康