- 2023 - 2027 津波被災地の海岸防災施設における環境保全事業の多面的評価
- 2020 - 2025 日本におけるタケ類の開花現象の実態とその生態系影響
- 2021 - 2024 生態ゲノミクスによる野生植物の平行進化機構の解明
- 2020 - 2022 放牧地由来の窒素が地下で分水嶺を越えて森林渓流に湧出する影響
- 2017 - 2020 森林源流域から進行する窒素飽和メカニズムの解明と森林炭素蓄積能力への影響評価
- 2017 - 2020 森林における植物-土壌系内部循環と斜面水移動の統合モデルによる窒素流出機構の解明
- 2017 - 2019 芦生冷温帯天然林における集水域単位のシカ防護柵の生態系機能保全効果と実用性の検証
- 2015 - 2018 山地森林の霧水沈着分布と空間不均一性の評価手法の開発
- 2014 - 2017 森林における腐植酸鉄の挙動と河川流下過程における物理化学性及び生物利用性の変化
- 2013 - 2017 巨大地震により生じた湾奥部汽水域の環境再生機構の解明と環境価値の評価
- 2013 - 2016 森林植生に対するシカ食害の影響評価と森林管理
- 2013 - 2016 気候変動下における森林窒素循環の急激変化を生じるホットモーメントの解明
- 2015 - 2016 シカによる森林下層植生の衰退が渓流への土砂流出に与える影響
- 2012 - 2015 シカ食害を排除しても森林生態系の窒素吸収能が回復しないのはなぜか?
- 2009 - 2014 森里海連環学による地域循環木文化社会創出事業(木文化プロジェクト)
- 2012 - 2013 水源域における森林生態系の攪乱が流域全体の河川水及び沿岸河口域の栄養塩動態に与える影響
- 2010 - 2013 森林生態系における窒素流出メカニズムの解明と窒素飽和の将来予測
- 2009 - 2010 河川上流域の有機物動態:森林河川とダム湖における有機物の生成・分解・堆積・変質過程
- 2009 - 2010 緯度系列で見たモウソウチクの形態的可塑性:各地域でのモウソウチク拡大戦略
- 2008 - 2010 ニホンジカによる過採食が芦生の冷温帯天然林の生物多様性と生態系機能に及ぼす影響の解明
- 2007 - 2010 森林の加齢に伴う窒素飽和現象の解明とPnET-CNモデルを用いた影響予測
- 2008 - 2009 日本の里山に見られる竹林拡大のメカニズムと生態系機能への影響評価
- スギ人工林の成立にともなう窒素循環の変化とそのメカニズム
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