- 2022 - 2025 沿岸海洋島における固有植物の初期的種分化の解明:いつ,どこで,なぜ,どのように?
- 2022 - 2025 近交弱勢と繁殖形質の集団内変異:その維持要因と進化的意義
- 2022 - 2025 大規模撹乱と野生植物集団の遺伝的多様性:巨大津波を想定した前向き・後ろ向き研究
- 2021 - 2024 宍道湖流域の水草相の過去から現在~環境DNAを用いた広域解析~
- 2020 - 2024 多様な繁殖段階で生じる形質置換の進化過程の解明
- 2020 - 2023 地球温暖化の生物間相互作用への影響-環境DNA解析で植物利用者の変化を解明する
- 2019 - 2023 バック・トゥ・ザ・ホンシュウ:伊豆諸島起源植物の本州への逆移入と定着過程を探る
- 2019 - 2023 農地拡大が水生植物に与えたインパクトの分子植物地理学的手法を用いた評価
- 2019 - 2022 自殖と近交弱勢の関係の新理論を基軸とした、植物の繁殖戦略の多様性の統一理解
- 2019 - 2022 稲作の衰退が生物多様性を減少させる:落水後のため池に特有な植物群の現状とその保全
- 2017 - 2021 見えないものを見える化して保全する-環境DNAを用いた水草稀少種の生育状況の解明
- 2017 - 2020 花形質の地理的クラインをもたらす繁殖干渉メカニズムの解明
- 2016 - 2019 近交弱勢を避ける道:その戦略の進化の統一的理解
- 2016 - 2019 植物の生態型分化機構研究:アキノキリンソウ群多様化の比較ゲノム解析
- 2016 - 2019 津波攪乱域に新規に出現した稀少植物群の保全遺伝学的研究-地域固有性の解明と保全
- 2015 - 2018 外来種による遺伝的攪乱-侵入後の経過を植物標本DNAから探る
- 2015 - 2018 性特異的マーカーの伝達に着目した雄性両全性異株性の維持機構
- 2014 - 2018 水生植物アサザを用いた科学的リファレンス像の構築に関する研究
- 2014 - 2017 繁殖干渉による形質置換がもたらす植物の生態分化
- 2013 - 2016 自家不和合性の進化における二つの謎:理論的解析とその検証による解明の試み
- 2012 - 2016 外来侵入植物による遺伝的汚染-ギシギシ属在来種の危機的実態の解明
- 2012 - 2015 風穴植物の系統地理学-低地に氷河期の足跡を探る
- 2011 - 2013 送粉系における側所的生態分化と遺伝分化
- 2009 - 2011 異なる生育環境における, 同じ2種間の交雑は異なる進化生物学的結果をもたらすか?
- 2009 - 2011 絶滅の危機に瀕するサクライソウの保全のための基礎研究
- 2007 - 2008 伊豆諸島に固有な植物の形態的,生態的,遺伝的分化に関する研究
- 2004 - 2005 急速に分化した植物群における系統解析-複数の核遺伝子を用いて
- 2001 - 2002 メギ科イカリソウ属2種の交雑帯における生殖的隔離機構の解析
- 2000 - 2000 種分化による多様性創出のメカニズムの解明
- 1998 - 1999 野生植物における組み換え種分化の分子分類学的再検討
- 1997 - 1998 草本植物における遺伝的変異・サイズ構造と多様性
- 1996 - 1998 性の進化生態学
- 1996 - 1998 サクラソウをめぐる生物間相互作用-その生態的・進化的意義の検討-
- 1996 - 1996 キク科カワラノギクの集団構造に関する分子分類学的研究
- 1995 - 1995 カワラナデシコにおける雌性両性花異株の進化と両性個体の自家交配の関係に関する研究
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