研究者
J-GLOBAL ID:200901096092851040   更新日: 2024年01月29日

北尾 彰朗

キタオ アキオ | Kitao Akio
所属機関・部署:
職名: 教授
ホームページURL (2件): http://www.kitao.bio.titech.ac.jp/http://www.kitao.bio.titech.ac.jp/indexE.html
研究分野 (3件): 基礎物理化学 ,  生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 ,  生物物理学
研究キーワード (24件): energy landscape ,  solvation ,  function ,  dynamics ,  molecular simulation ,  nano machine ,  Protein ,  分子論 ,  相互作用 ,  分子メカニズム ,  超並列計算 ,  生体分子機械 ,  エネルギー地形 ,  水和 ,  機能 ,  ダイナミクス ,  分子シミュレーション ,  ナノマシン ,  蛋白質 ,  理論化学 ,  計算化学 ,  計算物理 ,  化学物理 ,  生物物理
競争的資金等の研究課題 (36件):
  • 2020 - 2023 プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進
  • 2019 - 2023 先端シミュレーションで低分子結合が制御するGPCR活性化のメカニズムを探る
  • 2020 - 2022 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析
  • 2017 - 2020 回転分子モーター制御機構解明への再構成的アプローチ
  • 2014 - 2020 生体分子システムの機能制御による革新的創薬基盤の構築
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論文 (122件):
  • Tegar N. Wijaya, Akio Kitao. Energetic and Kinetic Origins of CALB Interfacial Activation Revealed by PaCS-MD/MSM. The Journal of Physical Chemistry B. 2023. 127. 7431-7441
  • Akio Kitao. Molecular Simulation to Investigate Open-Close Motion of a Flagellar Export Apparatus Protein FlhAC. Methods in Molecular Biology. 2023. 27-34
  • Kazuhiro Takemura, Akio Kitao. Molecular dynamics. Plasma Membrane Shaping. 2023. 431-443
  • Mariko Kojima, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Yuki Hishikawa, Akio Kitao, Takafumi Ueno. Engineering of an in-cell protein crystal for fastening a metastable conformation of a target miniprotein. Biomaterials Science. 2023
  • Tatsuro Nishikino, Norihiro Takekawa, Duy Phuoc Tran, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Sakura Onoe, Seiji Kojima, Michio Homma, Akio Kitao, Takayuki Kato, et al. Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2022. 631. 78-85
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MISC (131件):
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特許 (1件):
  • FLAGELLAR AN DNEEDLE COMPLEX(INJECTOSOME)LOOP AS ANTI BACTERIAL DRUG TARGET,
書籍 (7件):
  • in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術
    技術情報協会 2018 ISBN:9784861046889
  • The Bacterial Flagellum
    Springer 2017
  • 揺らぎ・ダイナミクスと生体機能 : 物理化学的視点から見た生体分子
    化学同人 2013 ISBN:9784759815108
  • シミュレーション辞典
    コロナ社 2012 ISBN:9784339024586
  • Normal mode analysis : theory and applications to biological and chemical systems
    Chapman & Hall/CRC 2006 ISBN:158488472X
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講演・口頭発表等 (143件):
  • SARS-CoV-2タンパク質のオリゴマー化を阻害する薬剤候補分子の探索
    (新型コロナウイルス感染症対応HPCI臨時課題の最前線 2020)
  • PaCS-MDによるタンパク質-タンパク質複合体の解離シミュレーション
    (第9回日本生物物理学会関東支部会 2020)
  • PaCS-MDによるアクトミオシンの結合解離予測
    (第9回日本生物物理学会関東支部会 2020)
  • 長時間ダイナミクス法と 標的分子ネットワーク
    (第7回 重点課題1ワークショップ 2020)
  • 計算で予測するタンパク質複合体立体構造と結合親和性
    (第7回 生命理工オープンイノベーションハブ(LiHub)フォーラム -メゾスケール分子と創薬- 2019)
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Works (20件):
  • eePaCS-MD (Edge expansion parallel cascade selection molecular dynamics)
    Kenichiro Takaba, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao 2020 -
  • a/dPaCS-MD (association and dissociation PaCS-MD)
    Duy Phuoc Tran, Akio Kitao 2020 -
  • evERdock BAI (Machine-learning-guided selection of protein-protein complex structure)
    Kei Terayama, Ai Shinbu, Koji Tsuda, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao 2019 -
  • dPaCS-MD/MSM
    Duy Phuoc Tran, Akio Kitao 2019 -
  • PaCS-MD/MSM
    Duy Phuoc Tran, Kazuhiro Takemura, Kazuo Kuwata, Akio Kitao 2018 -
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学歴 (3件):
  • 1991 - 1993 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻 博士後期課程
  • 1989 - 1991 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻 修士課程
  • 1985 - 1989 京都大学 理学部 主に物理学及び化学
学位 (3件):
  • 博士(理学) (京都大学)
  • 修士(理学) (京都大学)
  • 学士(理学) (京都大学)
経歴 (11件):
  • 2017/07 - 現在 東京工業大学 生命理工学院 教授
  • 2016/04 - 現在 量子科学技術研究開発機構 客員研究員
  • 2017/07 - 2018/03 東京大学 分子細胞生物学研究所 委嘱教授
  • 2007/04 - 2017/06 東京大学 分子細胞生物学研究所 准教授
  • 2005/10 - 2016/03 日本原子力研究開発機構 研究嘱託
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委員歴 (21件):
  • 2021/01 - 現在 日本シミュレーション学会 編集委員長
  • 2008 - 現在 日本蛋白質科学会 男女共同参画ワーキンググループ
  • 2023/04 - 2025/03 日本物理学会 代議員
  • 2023/04 - 2024/03 日本物理学会 領域委員会委員
  • 2023/04 - 2024/03 日本物理学会 領域12領域代表
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所属学会 (10件):
日本化学会ケモインフォマティクス部会 ,  日本化学会情報化学部会 ,  米国生物物理学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本物理学会 ,  溶液化学研究会 ,  日本化学会 ,  日本生物物理学会 ,  日本分子シミュレーション学会 ,  米国化学会
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