BISC: BInary SubComplex Database

• University of California, Santa Cruz

タンパク質間相互作用のデータベースです。構造生物学領域と機能ゲノム領域の橋渡しとなることを目的として、現在主流のタンパク間相互作用データベースに収録されているデータのなかで、モデリングの可能な部分複合体構造を対象にした検索機能を提供しています。このデータベースは以下の3つのパートで構成されています。
1. 既知の部分複合体構造の情報として、PDBの結晶構造から抽出された2量体部分構造およびその座標情報に基づいてPISAにより予測された生物学的多量体の情報を掲載。ホモダイマーはBISCHom、ヘテロダイマーはBISCHetに分けて収録されています。
2. モデリングの可能なタンパク質間相互作用の情報として、実験結果に基づいたタンパク質間相互作用データベースであるBioGRID、IntAct、HPRDのデータを対象に、BISCHomまたはBISCHetにある配列と類似するテンプレート構造を収録。
3. 構造の決定されていない相互作用についてはMolSurferやSCOTCH、PISAといったさまざまな検証プログラムによる実行結果を収録。