資源
J-GLOBAL ID：201410058281793447
研究資源コード：NBDC01218
更新日：2022年09月21日
PmiRKB: Plant microRNA Knowledge Base
PmiRKB: Plant microRNA Knowledge Base
保有機関：
資源分類：
データ・データベース
タグ【対象】 (2件)：
遺伝的多様性
, RNA
タグ【データの種類】 (1件)：
配列
生物種 (2件)：
Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)
, Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530)
概要：
miRNAの4つの主要セクション (functional modules)から構成されている植物miRNA知識データベースです。対象生物はシロイヌナズナとイネです。(1) 「SNP」では、miRNA前駆体やmiRNA, 標的サイトに存在するSNP情報を提供しています。(2) 「Pri-miR」は、MPSS (Massively Parallel Signature Sequencing)データに基づく組織特異的なpri-miRNAの転写シグナル情報を提供しています。(3) 「MiR-Tar」は、PARE (Parallel Analysis of RNA Ends)データに基づく予測miRNA標的認識サイト内の開裂シグナル情報を提供しています。(4)「Seld-reg」は、PARE (Parallel Analysis of RNA Ends)データに基づくmiRNA前駆体のプロセシングとmiRNAによる自己制御の残余物シグナル情報を提供しています。
作成機関：
NBDC
レコード管理者：
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件：
Creative Commons CC0 license
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