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J-GLOBAL ID：201602226365968553   整理番号：16A0740559

ナスのAP2/ERF転写因子の同定およびストレス条件下の発現を分析した【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Expression Analysis in Oxidative Stress of AP2/ERF Gene Family in Eggplant (Solanum melongena)

著者 (6件)： Shao Xinxin (Department of Biotechnology, Jinan University, Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables) ,  Li Tao (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables) ,  Li Zhiliang (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences) ,  Yu Li (School of Medicine, Jinan University(Guangdong)) ,  Li Zhenxing (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences) ,  Xu Xiaowan (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables)
資料名： Zhiwu Shengli Xuebao  (Zhiwu Shengli Xuebao)
巻： 51  号： 11  ページ： 1901-1918  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2752A  ISSN： 2095-1108  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 植物AP2/ERFは1つの膨大な数の転写因子のファミリーである,植物の成長と発育、器官の構築及び逆境の脅迫とホルモンシグナル応答において重要な役割を果たす。本研究ではナスのゲノム範囲内では,バイオインフォマティクスの方法を利用して、分布はナスのAP2/ERF転写因子ファミリーのメンバーと構造と機能などに対する分析を行った。その結果,ナスAP2/ERFファミリーの130個のタンパク質を含む,その中にAP2、RAVERFサブファミリーそれぞれ20、2と108個含む,ERFをDREB/CBF(41個のメンバ)とERF(67個のメンバ)の2大サブファミリーに分けた,進化分析の両者を11個の小サブファミリーに分けた。MEME分析には,その20個の重要なモチーフを含むことを示した,保存ドメイン構成と同じサブファミリー中のERFメンバーは蛋白質配列のアミノ酸が類似する,しかも各サブファミリーメンバーのアミノ酸LRR類似な組成を,これらのモチーフの存在はERFタンパク質の機能の実行に必要とされることを示した。リアルタイム蛍光定量的PCRを利用してナスの38個のERF遺伝子の組織発現分析をを行い,その組織発現差異がある結果は示した;ストレス応答の分析結果は,33個の遺伝子はABA、SA、塩、重金属、カドミウム、高温と低温誘導発現を受け,そのうちの一部の遺伝子の有意なアップレギュレーション又は発現の下方制御を,ナスの逆境ストレス条件下での防御応答に寄与している可能性が示唆された。本研究の結果はナスのAP2/ERFファミリー遺伝子の更なる研究に根拠を提供する,AP2/ERF遺伝子の機能をさらに解析するために基礎を築く。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： カドミウム ,  定量的PCR法 ,  アップレギュレーション ,  ダウンレギュレーション ,  遺伝子 ,  アミノ酸 ,  *転写因子 ,  低温 ,  ゲノム ,  重金属 ,  蛍光
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  ERF遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  *AP2因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： eggplant (solanum melongena) ,  AP2/ERF family ,  bioinformatics ,  gene expression ,  oxidative stress

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： ナス ,  AP2 ,  転写因子 ,  同定 ,  ストレス ,  発現 ,  分析