青海省の北山森林農場野生SINOPODOPHYLLUM EMODI7根内生真菌の群落の組成および多様性の研究上【JST・京大機械翻訳】

Ning Yi; Li Yanling; Zhou Guoying; Yang Lucun; Xu Wenhua

文献

J-GLOBAL ID：201602252817812728 整理番号：16A1043708

青海省の北山森林農場野生SINOPODOPHYLLUM EMODI7根内生真菌の群落の組成および多様性の研究上【JST・京大機械翻訳】

Community composition and diversity of endophytic fungi from roots of Sinopodophyllum hexandrum in forest of Upper-north mountain of Qinghai province

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資料名：
巻： 41 号： 7 ページ： 1227-1234 発行年： 2016年
JST資料番号： C2264A ISSN： 1001-5302 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

この研究では,第2世代シークエンシング(NGS)技術を適用することにより,すなわちハイスループットシークエンシング方法シークエンシング青海野生SINOPODOPHYLLUM EMODI7根内真菌メタゲノム群のITS1領域のために,そして,RDPにおける根拠の設定の分類しきい値処理後の配列に対し種の分類を行う,同定された内生真菌の群落組成。研究結果は,シークエンシングの結果は品質制御を経て共有効な56522のバンドは,97%の配列類似性に従いクラスタ類似性分析を行い得,全てのサンプルを得るためのことは合計517個分類操作単位(OTUS)を示した。RDP分類0.8の分類の閾値と同定したすべての真菌による分類は13綱であること、35目44科55属。3つの試料LD1,LD2,LD3における共同の優位性は属真菌はTETRACLADIUM属(、占める割合はそれぞれ35.49%, 68.55%,12.96%)であった,試料のSHANNON多様性指数およびSIMPSONの多様性指数はそれぞれ1.75~2.92,0.11~0.32)。研究の結果,青海省の北山森林農場野生SINOPODOPHYLLUM EMODI7内の内生真菌は高い多様性とより複雑な群落の組成,内部寄生性植物菌類の豊富な資源を秘めている,そしてハイスループットシークエンシング技術は植物の内生真菌群落の研究に対して構成および多様性は顕著な優位性を持つ持つ上。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生態

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