抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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蛋白質は生物の主要成分である。蛋白質表面への凹形(ポケット)を反応への薬物のthebest標的であることが知られている。以前にポケットとアミノacidresidue間の距離解析にastudyを示した。蛋白質surfaceandアミノacidresidueと最も深い点の原子またはポケットの外側ループ間の距離を計算にポケットを同定した。アミノ酸残基の任意対にarecloseポケットの少なくとも一つ,新薬の開発につながる蛋白質のtheratiosを計算し,着色マトリックスとして比をdistributionofを可視化する蛋白質を抽出した。アミノ酸residuesmayの特別な対はpreviousstudyにおける蛋白質のドラッガビリティに影響するthevisualization結果から示唆された。蛋白質のドラッガビリティのexplorethe関連性本研究の拡張を提示し,アミノ酸残基と蛋白質surfacepocketsのセットをdistancesbetween。この方法はアミノ酸残基の各々までの距離からなる,20dimensionalvectorsとしてポケットを扱い,ベクトル集合とGeodesicSOMを適用した。GeodesicSOMにより生成されたSphericalmapsは次元vectorspaceにおけるポケットの分布,およびポケットの次元ベクトルを用いた蛋白質のドラッガビリティの推定をvisualizationofに使用されている。Copyright 2016 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】