文献

J-GLOBAL ID：201602277394530380   整理番号：16A0854945

アクチン豆状帯Tao虫遺伝子クローンおよびその参照分子としての応用【JST・京大機械翻訳】

Cloning of Taenia pisiformis Actin Gene and Assessment of Its Use as An Internal Control

著者 (4件)： Zhang Shaohua (State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Luo Xuenong (State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Xueqiang (State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Cai Xuepeng (State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Zhongguo Jishengchongxue yu Jishengchongbing Zazhi  (Zhongguo Jishengchongxue yu Jishengchongbing Zazhi)
巻： 34  号： 1  ページ： 32-37  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2242A  ISSN： 1000-7423  CODEN： ZJYZET  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的クローン豆状帯Tao虫(TAENIA PISIFORMIS)アクチン(TP-アクチン)遺伝子の全長CDNAは,その遺伝子の構造、システムおよび参照遺伝子の適用性として進化を分析した。この方法では,RT-PCR法を採用したTP-アクチン遺伝子フラグメントを増幅し,RACE-PCR法は3’と5’端CDNA配列を得て,それぞれシークエンシング後TP-アクチンの全長CDNAをスプライシングし。遺伝子の構造とシステムを行うバイオインフォマティクスソフトウェア進化分析を利用する。PRIMER EXPRESSソフトウェア設計TP-ACTINと豆状帯Tao虫カテプシンL様半システインプロテアーゼ遺伝子(TPCP)の特異的プライマーを応用した。プライマーの特異性とTP-アクチン遺伝子をリアルタイム蛍光定量的PCR(QRT-PCR)法で増幅効率を検出し,TP-アクチンを参照遺伝子として使用した。TPCP豆状帯Tao虫六鉤幼虫、有鉤嚢尾虫の成熟体節と孕節片等の異なる発育段階の組織においての発現特徴を分析した。結果はシークエンシングの結果,TPは-アクチン遺伝子フラグメント1 BPであり,3’と5’端の遺伝子断片は,それぞれ428と945 BPであり,予想結果と一致することを示した。スプライシングで得たTP-アクチンの全長CDNAは1 BPであった,そのうち3’UTR長さ118 BP,5’UTRの長さ30 BP,オープンリーディングフレーム(ORF)は1 BPであった,配列はすでにGENBANK(受入番号JX624787)を提出する。バイオインフォマティクス分析の結果は示した,この配列は376個のアミノ酸をコードし,蛋白質の相対分子質量(M_R)は41 749であり,等電点は5.29であった,6つの特定機能部位と3つのアクチンと蛋白質のファミリーの特徴を位点を含むと推測される。システム進化分析は示した,TP-アクチン配列と有鉤条虫(TAENIA SOLIUM)と枝形裂頭条虫(DIPHYLLOBOTHRIUM DENDRITICUM)の相同性はそれぞれ100%と99.7%であった。QRT-PCRの結果は,TP-ACTINとTPCP遺伝子は特異的プライマーでの増幅を経て,それぞれ82および108 BPフラグメントを得て,予想結果と一致することを示した;TP-ACTINとTPCP遺伝子は融解曲線はいずれも単一信号を呈し,プライマーの特異性は強い;TPは-アクチン遺伝子の標準曲線の直線性は相関係数(R2)は0.999であった,,QRT-PCR増幅効率に対する要求に適合した;TP-アクチン遺伝子を参照遺伝子として,受精卵を体節においてTPCP遺伝子は相対転写レベル比は1.65である,六鉤幼虫(1.00)と成熟体節(0.87)が尾虫(0.62)(P<0.05)より有意に高かった。結論:TP-アクチン遺伝子の高度保存,えんどう豆様条虫の遺伝子発現は調節及び定量分析の内部標準と参照することができる。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RT-PCR法 ,  分子量 ,  *クローン ,  相同性 ,  蛍光 ,  相関係数 ,  等電点 ,  幼虫 ,  アミノ酸 ,  定量的PCR法 ,  *アクチン ,  検量線 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 特異性 ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Taenia pisiformis ,  Actin gene ,  Sequence analysis ,  Reference gene

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  食品の汚染  (FJ01053P) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： アクチン ,  豆 ,  参照 ,  分子 ,  応用