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J-GLOBAL ID：201602288177376876   整理番号：16A0964482

アボカドのゲノムDNA抽出のSSR-PCR反応系を最適化およびプライマーでスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

DNA Extraction,Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening of Persea americana

著者 (6件)： Zhou Hailan (Key Laboratory of Protection and Development Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources(Hainan University),Ministry of Education / College of Horticulture and Landscape Architecture,Hainan University) ,  Li Shaopeng (Key Laboratory of Protection and Development Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources(Hainan University),Ministry of Education / College of Horticulture and Landscape Architecture,Hainan University) ,  Li Weiliang (Key Laboratory of Protection and Development Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources(Hainan University),Ministry of Education / College of Horticulture and Landscape Architecture,Hainan University) ,  He Junhu (Tropic Crops Genetic Resources Institute,Chinese Academy of Tropic Agricultural Sciences) ,  Bao Donghong (Key Laboratory of Protection and Development Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources(Hainan University),Ministry of Education / College of Horticulture and Landscape Architecture,Hainan University) ,  Li Maofu (Key Laboratory of Protection and Development Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources(Hainan University),Ministry of Education / College of Horticulture and Landscape Architecture,Hainan University)
資料名： Shengwu Jishu Tongbao  (Shengwu Jishu Tongbao)
巻： 32  号： 4  ページ： 143-150  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2986A  ISSN： 1002-5464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 安定性と信頼性のアボカド(PERSEA AMERICANA MILL)の葉のDNAの抽出方法とSSR-PCR反応系を確立しおよび安定したアボカドSSR多型プライマーをスクリーニングし,アボカドをSSR分子マーカーコレクションを展開するために遺伝的研究の基礎を提供することを目指す。アボカドの葉身を試験材料として,3種のアボカドの葉からのDNA抽出法を比較した;L_(16)(45)直交実験を用いてアボカドSSR-PCR反応系に対し最適化を行う;最適化のための反応系を利用して,プライマーをスクリーニングした;同時に,5対の多型プライマーを選び,この最適化システムの安定性をさらに検出する。45アボカドに対してコレクションをPCR増幅を行う。結果により,従来の2×CTAB法、試薬キット法等の3つのDNA抽出方法における抽出に2×CTAB法と植物DNAを改良した,改良2×CTABアボカドゲノムDNAの抽出効果に対する最適法;最適反応系を得る:220 ΜL反応総反応系における,約40NG DNAテンプレートを含む、1.5 MMOL/L MG(2+)、0.15 MMOL/L DNTPS,0.5U TAQ DNAポリメラーゼ0.5ΜMOL/Lのプライマー ;この反応系を,この系を基礎にしてプライマーをスクリーニングし,30対の増幅のはっきりしたバンドの多型プライマーをアボカド73対のSSRプライマーからスクリーニングした行ったアボカドのSSRマーカーの更なる研究に使えることを説明した;安定性の検出によって得られたバンドは明瞭であり,この最適化反応系の安定性と信頼性であることを示した。これにより可視,アボカドの葉DNAの大量サンプル,改良2×CTAB法は,抽出に用いることができる,最適化後のSSR-PCR反応系とスクリーニングした30対の多型プライマーを,アボカドのSSRマーカーの更なる研究に使用できる。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化手法 ,  直交性 ,  *最適化 ,  *アボカド ,  PCR法 ,  信頼性 ,  葉身 ,  *DNA【核酸】 ,  *反応系
準シソーラス用語： マイクロサテライトマーカー ,  植物DNA ,  *DNA抽出 ,  遺伝学研究 ,  分子マーカー ,  ゲノムDNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Persea americana Mill ,  DNA extraction ,  SSR marker ,  system optimization ,  primer screening

分類 (2件)： 果実とその加工品  (FJ11030Z) ,  果樹  (FC03042G)

タイトルに関連する用語 (8件)： アボカド ,  ゲノム ,  DNA抽出 ,  SSR ,  PCR反応 ,  最適化 ,  プライマー ,  スクリーニング