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J-GLOBAL ID：201602289494797758   整理番号：16A0826967

アブラナ(BRASSICA NAPUS L.)の低温誘導下のBZIP転写因子のマイニングとクラスタ分析を【JST・京大機械翻訳】

Mining and Cluster Analysis of Rapeseed bZIP Transcription Factors Induced by Low Temperature

著者 (8件)： Du Chunfang (Cotton Research Institute,Shanxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Chunqing (College of Plant Science and Technology,Huazhong Agricultural University) ,  Xian Shuanshi (Cotton Research Institute,Shanxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Fan Jianchun (Cotton Research Institute,Shanxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Hu Kaining (College of Plant Science and Technology,Huazhong Agricultural University) ,  Li Meng (Cotton Research Institute,Shanxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Tu Jinxing (College of Plant Science and Technology,Huazhong Agricultural University) ,  Fu Tingdong (College of Plant Science and Technology,Huazhong Agricultural University)
資料名： Zhiwu Yichuan Ziyuan Xuebao  (Zhiwu Yichuan Ziyuan Xuebao)
巻： 17  号： 1  ページ： 153-161  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2753A  ISSN： 1672-1810  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 低温ストレスに応答する植物の過程は1つの複雑なネットワークの過程であり,多くの転写因子の調節に関与している。本論文では低温ストレス下のキャベツ型アブラナのトランスクリプトームデータのバイオインフォマティクス解析を行うことにより,配列は,BZIP転写因子をコードする108個を得た。染色体位置決め配列アラインメントとクラスタリング分析を経て,これらの転写因子の位置19本の染色体上では,耐寒性の過程において動的変化を表現することが分かった;同時に、G亜族A亜族C亜族、サブファミリーI、Sサブファミリーの中にはこれらの転写因子が最も多く集積を認め,BサブファミリーとDサブファミリーの中でほとんど凝集;4つとるとすべてのストレス段階では全て差の遺伝子を表現し,その調節変化とシークエンシング解析の変化傾向が同じであるということを発見した。定量分析を行う,シークエンシングデータの信頼性を証明しただけでなく,また,キャベツ型アブラナのBZIP転写因子に対する低温ストレスの応答が1つの動態の調節過程であることを証明した。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 耐寒性 ,  定量分析 ,  *転写因子 ,  キャベツ ,  クラスタ化 ,  *クラスタ分析 ,  凝集 ,  *アブラナ ,  染色体 ,  寒冷ストレス ,  *低温
準シソーラス用語： 動的変化 ,  配列アライメント ,  染色体位置決め ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： rapeseed ,  low temperature ,  bZIP transcription factors ,  mining ,  cluster analysis

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： アブラナ ,  Brassica ,  低温 ,  誘導 ,  bZIP ,  転写因子 ,  クラスタ分析