セロリ品種’方方’AGCCOAOMT遺伝子のクローニングおよび発現特性解析【JST・京大機械翻訳】

Yuan Xiaoyang; Wu Xuejun; Nie Li; Xu Ke; Xiong Aisheng

文献

J-GLOBAL ID：201702211874787530 整理番号：17A0205116

セロリ品種’方方’AGCCOAOMT遺伝子のクローニングおよび発現特性解析【JST・京大機械翻訳】

Analyses on cloning and expression characteristics of AgCCoAOMT gene from Apium graveolens ‘Liuhe Huangxinqin’

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巻： 25 号： 3 ページ： 19-27 発行年： 2016年
JST資料番号： C3054A ISSN： 1674-7895 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

科(植物植物 LINN.)のトランスクリプトームデータベースに基づいて,, , LINN.のトランスクリプトームを研究した。アピゲニン品種「方方」(’LIUHE HUANGXINQIN’)の葉から全RNAからカフェイン-COA-O-メチルトランスフェラーゼ遺伝子をクローニングし,AGCCOAOMT遺伝子と名付けた。配列解析の結果は以下を示した。AGCCOAOMT遺伝子は1つの長さ726BPのオープンリーディングフレーム(ORF)を含み、241アミノ酸をコードしている。この遺伝子のコード化タンパク質はAGCCOAOMTであり、その理論的相対分子量は27 010であり、理論的PIPIは5.35であった。AGCCOAOMT蛋白質の中で,酸性アミノ酸の割合はアルカリ性アミノ酸より高く,脂肪族アミノ酸の割合は芳香族アミノ酸の約3倍であった。この蛋白質は疎水性蛋白質に属し,1つの保存されたADOMET_ ドメインを含み,AGCCOAOMT蛋白質がADOMET_MTASESスーパーファミリーに属することを示した。AGCCOAOMTの三次構造は,複数のΑ-ヘリックスとΒ-シートを含み,アルファルファ(MEDICAGO SATIVA LINN.)CCOAOMT蛋白質の三次構造との一致性は%であった。多重比較と系統樹解析の結果は以下のことを示した。AGCCOAOMT蛋白質には,より高い保存性がある。この蛋白はと科植物植物(AMMI MAJUS LINN.)とパセリ(〔 CRISPUM(LINN.)NYMAN EX A. HILL)との間の進化関係が最も近い。睡蓮(NYMPHAEACEAE 植物 GAERTN.)CCOAOMT(NELUMBO NUCIFERA GAERTN.)のCCOAOMT蛋白質との進化関係は比較的に近い。QRT-PCRの結果は以下のことを示した。AGCCOAOMT遺伝子は,方のの根,茎,葉柄および葉において発現し,葉における相対的発現量は,他の組織よりも有意に高く(P<0.01),この遺伝子の発現は,組織特異性を示した。異なる成長段階において、この遺伝子の葉身中の相対的発現量には明らかな差異があり、そのの播種後の第6日目の相対的発現量は幼苗期(播種後22日目)と生長期期(播種後45日目)より有意に高かった。研究結果は以下を示す。AGCCOAOMT遺伝子は,方 ’の葉の老化とリグニン含有量の増加に関連し,進化過程において高い保存性を持っていた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学 , 微生物の生化学

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