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J-GLOBAL ID：201702218459695507   整理番号：17A0164358

煙のSLA-DQA遺伝子コード領域の多型とバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Polymorphism and Bioinformatics Analysis of SLA-DQA Gene CDs in Yantai Black Pig

著者 (5件)： Huang Xiaoyu (College of Animal Science and Technology,Gansu Agricultural University) ,  Yuan Junhu (Henan Luohe Animal Husbandry Bureau) ,  Yang Qiaoli (College of Animal Science and Technology,Gansu Agricultural University) ,  Ma Yanping (College of Animal Science and Technology,Gansu Agricultural University) ,  Gun Shuangbao (College of Animal Science and Technology,Gansu Agricultural University, Gansu Research Center forSwine Production Engineering and Technology)
資料名： Huabei Nongxuebao  (Huabei Nongxuebao)
巻： 31  号： 5  ページ： 86-93  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2462A  ISSN： 1000-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： PCR-SSCP,クローン配列決定,およびバイオインフォマティクスを用いて,SLA-DQA遺伝子の多型を研究し,その蛋白質構造を予測し,その機能特性を分析した。結果は以下を示した。4つの対立遺伝子,5つの遺伝子型,6つの対立遺伝子,8つの遺伝子型,4つの対立遺伝子,7つの遺伝子型,3つの新しい対立遺伝子を含むSLA-DQA遺伝子エキソン2,エキソン3,エキソン4を検出した。SLA-DQA遺伝子は255のアミノ酸をコードし,コード領域は32のヌクレオチド突然変異と13のアミノ酸変異を共有し,エキソン2は最も豊富であった。蛋白質構造予測の結果,二次構造ではランダムコイルと拡張の割合が最も高く,Αヘリックス数が多く集中し,Βシートが最も少なかった。機能予測の結果,SLA-DQA遺伝子の蛋白質は,エネルギー代謝,構造蛋白質および成長因子において高い確率を示した。本研究の結果はSLA-DQA遺伝子の猪抗病分子育種における応用に理論的根拠を提供することができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エネルギー代謝 ,  アミノ酸 ,  PCR-SSCP法 ,  対立遺伝子 ,  突然変異 ,  クローン ,  タンパク質 ,  遺伝子型 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 分子育種 ,  蛋白質構造予測 ,  アミノ酸変異 ,  機能特性 ,  蛋白質構造 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Yantai black pig ,  SLA-DQA gene ,  Coding region ,  Polymorphism ,  Protein structure

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 煙 ,  遺伝子 ,  多型 ,  バイオインフォマティクス解析