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J-GLOBAL ID：201702220447827133   整理番号：17A0109861

本研究では,トウモロコシのスーパーファミリーの遺伝子同定と胞子形成過程における転写パターンを同定した。【JST・京大機械翻訳】

Gene Identification of GPCRs Superfamily and Its Transcriptional Profile During Conidial Development of Setosphaeria turcica

著者 (9件)： Yu Bo (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Zhang Yumei (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Li Zhiyong (Millet Institute of Agricultural Academy of Hebei Province) ,  Wu Di (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Gong Xiaodong (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Shen Shen (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Cao Zhiyan (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Hao Zhimin (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei) ,  Dong Jingao (Provincial Key Laboratory of Physiological and Molecular Plant Pathology,College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 24  号： 9  ページ： 1302-1311  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： Gタンパク質共役受容体(G PROTEIN-COUPLED RECEPTORS, GPCRS)は動物、植物及び微生物に広く存在し、最もシグナル伝達に関わる膜受容体ファミリーである。本研究では、隠れモデルに基づくHMMER 3.0ソフトウェアを用いて、トウモロコシラット(菌 TURCICA)のゲノムデータベースを探索し、GPCRSスーパーファミリー遺伝子及びその遺伝子局在を同定し、獲得した。MEGA6.0ソフトウェアを用いて系統発生解析を行った。一般的サンプルデータシステム(GENERALIZED SAMPLE DATA SYSTEM, GSDS)ツールを用いて遺伝子構造の分析を行った。GPCRSのSMARTドメインを,INTERPROとSMARTツールを用いて分析した。さらに,QRT-PCR法を用いて,分生子の発達におけるGPCR遺伝子の発現の過程における異なる段階の相対的発現量を分析した。その結果,9つの典型的なGPCRがトウモロコシの斑紋病病原体のゲノムに存在し,そのうち3つは窒素源,誘導受容体および炭素源誘導因子の2つのタイプ,2つの環,酸および真の1つであることを示した。これらの遺伝子はトウモロコシの斑紋病のゲノムの中に散布され、しかも構造は複雑で多様であるが、すべてのメンバーのコード産物はすべてN末端、7つの膜貫通ドメイン、3つの胞内環、3つの細胞外環及びC端から構成される。各膜貫通ドメインには20~25個のアミノ酸が含まれている。分生子を対照として,すべての遺伝子は接種後12時間(1212 POST INOCULATION,1212)で有意に減少した(P<0.05)。遺伝子STRTC1とSTFDD123を除いて,全遺伝子の変化傾向はアップレギュレーション/横ばい(3 )-アップレギュレーション(6変異)-ダウンレギュレーション(12変異)-アップレギュレーション(24変異)を示した。特に,侵入した糸の形成時期(24 変異)は著しく上昇した(P<0.05)。付着器形成時期(6 )では,STSTE2PとSTRTC2発現のみが有意に上方制御された。STRTC1とSTFDD123の発現レベルは,各段階で有意差を示さなかった。本研究は植物病原真菌GPCRスーパーファミリーの機能を深く解析するための理論的基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分生子 ,  系統発生 ,  アップレギュレーション ,  アミノ酸 ,  ゲノム ,  *遺伝子 ,  *胞子形成 ,  ダウンレギュレーション ,  膜貫通領域 ,  炭素源 ,  窒素源 ,  遺伝子構造 ,  Gタンパク質共役型受容体 ,  *遺伝子同定 ,  遺伝的変異 ,  胞子 ,  生殖細胞 ,  菌類構造 ,  *分化 ,  *発生生理
準シソーラス用語： 変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Setosphaeria turcica ,  G protein-coupled receptor ,  Invasion ,  Transcriptional profile

分類 (2件)： 細胞膜の受容体  (EF04030C) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (8件)： 研究 ,  トウモロコシ ,  ファミリー ,  遺伝子同定 ,  胞子 ,  形成過程 ,  転写 ,  同定